Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.86□□□□□ -2.11
VID28P40547 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.86□□□□□ -2.11
VID28P40547 YPR092WYPR092W 306 nt1.86□□□□□ -2.11
VID28P40547 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.86□□□□□ -2.11
VID28P40547 LHS1YKL073W 2646 nt1.85□□□□□ -2.11
VID28P40547 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.85□□□□□ -2.11
VID28P40547 VPS55YJR044C 423 nt1.85□□□□□ -2.11
VID28P40547 YNL337WYNL337W 255 nt1.85□□□□□ -2.11
VID28P40547 NPR2YEL062W 1848 nt1.84□□□□□ -2.11
VID28P40547 SPO21YOL091W 1830 nt1.84□□□□□ -2.11
VID28P40547 MCM10YIL150C 1716 nt1.84□□□□□ -2.11
VID28P40547 RPL31AYDL075W 342 nt1.84□□□□□ -2.11
VID28P40547 EMC5YIL027C 426 nt1.84□□□□□ -2.11
VID28P40547 APQ12YIL040W 417 nt1.84□□□□□ -2.11
VID28P40547 RRT15YLR162W-A 189 nt1.84□□□□□ -2.11
VID28P40547 YLL007CYLL007C 1998 nt1.84□□□□□ -2.11
VID28P40547 SLI15YBR156C 2097 nt1.84□□□□□ -2.12
VID28P40547 PFD1YJL179W 330 nt1.83□□□□□ -2.12
VID28P40547 DNF3YMR162C 4971 nt1.83□□□□□ -2.12
VID28P40547 TBS1YBR150C 3285 nt1.83□□□□□ -2.12
VID28P40547 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.82□□□□□ -2.12
VID28P40547 SPO24YPR036W-A 204 nt1.82□□□□□ -2.12
VID28P40547 SKI3YPR189W 4299 nt1.82□□□□□ -2.12
VID28P40547 YLR419WYLR419W 4308 nt1.82□□□□□ -2.12
VID28P40547 NUT1YGL151W 3399 nt1.82□□□□□ -2.12
VID28P40547 SEC5YDR166C 2916 nt1.81□□□□□ -2.12
VID28P40547 COG4YPR105C 2586 nt1.81□□□□□ -2.12
VID28P40547 YBR174CYBR174C 315 nt1.81□□□□□ -2.12
VID28P40547 PKH2YOL100W 3246 nt1.8□□□□□ -2.12
VID28P40547 CTF4YPR135W 2784 nt1.8□□□□□ -2.12
VID28P40547 ALK1YGL021W 2283 nt1.79□□□□□ -2.12
VID28P40547 VPS15YBR097W 4365 nt1.79□□□□□ -2.12
VID28P40547 PBY1YBR094W 2262 nt1.79□□□□□ -2.12
VID28P40547 SAC3YDR159W 3906 nt1.78□□□□□ -2.12
VID28P40547 SBE22YHR103W 2559 nt1.78□□□□□ -2.12
VID28P40547 YOR302WYOR302W 78 nt1.78□□□□□ -2.12
VID28P40547 SGF11YPL047W 300 nt1.78□□□□□ -2.12
VID28P40547 IFH1YLR223C 3258 nt1.78□□□□□ -2.12
VID28P40547 KCS1YDR017C 3153 nt1.78□□□□□ -2.12
VID28P40547 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.77□□□□□ -2.13
VID28P40547 YDR521WYDR521W 336 nt1.77□□□□□ -2.13
VID28P40547 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.77□□□□□ -2.13
VID28P40547 YKU70YMR284W 1809 nt1.77□□□□□ -2.13
VID28P40547 RAD50YNL250W 3939 nt1.77□□□□□ -2.13
VID28P40547 UFD2YDL190C 2886 nt1.77□□□□□ -2.13
VID28P40547 PKH3YDR466W 2697 nt1.76□□□□□ -2.13
VID28P40547 YCS4YLR272C 3531 nt1.76□□□□□ -2.13
VID28P40547 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.76□□□□□ -2.13
VID28P40547 snR74snR74 88 nt1.75□□□□□ -2.13
VID28P40547 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.75□□□□□ -2.13
VID28P40547 ADR1YDR216W 3972 nt1.74□□□□□ -2.13
VID28P40547 PAM16YJL104W 450 nt1.74□□□□□ -2.13
VID28P40547 ALY2YJL084C 3141 nt1.74□□□□□ -2.13
VID28P40547 OLI1Q0130 231 nt1.73□□□□□ -2.13
VID28P40547 YOR376WYOR376W 369 nt1.73□□□□□ -2.13
VID28P40547 PIP2YOR363C 2991 nt1.73□□□□□ -2.13
VID28P40547 CHS1YNL192W 3396 nt1.73□□□□□ -2.13
VID28P40547 ISD11YER048W-A 285 nt1.72□□□□□ -2.13
VID28P40547 YGL217CYGL217C 342 nt1.72□□□□□ -2.13
VID28P40547 ECM12YHR021W-A 456 nt1.72□□□□□ -2.13
VID28P40547 COF1YLL050C 432 nt1.72□□□□□ -2.13
VID28P40547 YLL054CYLL054C 2532 nt1.71□□□□□ -2.14
VID28P40547 YJL022WYJL022W 309 nt1.71□□□□□ -2.14
VID28P40547 YBR206WYBR206W 324 nt1.71□□□□□ -2.14
VID28P40547 CAT8YMR280C 4302 nt1.71□□□□□ -2.14
VID28P40547 SLX4YLR135W 2247 nt1.71□□□□□ -2.14
VID28P40547 MON2YNL297C 4911 nt1.71□□□□□ -2.14
VID28P40547 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.7□□□□□ -2.14
VID28P40547 AIM44YPL158C 2277 nt1.7□□□□□ -2.14
VID28P40547 BRR2YER172C 6492 nt1.7□□□□□ -2.14
VID28P40547 MMS4YBR098W 2076 nt1.7□□□□□ -2.14
VID28P40547 CDC31YOR257W 486 nt1.69□□□□□ -2.14
VID28P40547 MEC1YBR136W 7107 nt1.69□□□□□ -2.14
VID28P40547 SMC4YLR086W 4257 nt1.69□□□□□ -2.14
VID28P40547 SLD3YGL113W 2007 nt1.69□□□□□ -2.14
VID28P40547 PAN2YGL094C 3348 nt1.68□□□□□ -2.14
VID28P40547 FIG2YCR089W 4830 nt1.68□□□□□ -2.14
VID28P40547 YEL014CYEL014C 306 nt1.68□□□□□ -2.14
VID28P40547 NCA2YPR155C 1851 nt1.68□□□□□ -2.14
VID28P40547 AHC1YOR023C 1701 nt1.67□□□□□ -2.14
VID28P40547 YDL206WYDL206W 2289 nt1.67□□□□□ -2.14
VID28P40547 IRA1YBR140C 9279 nt1.66□□□□□ -2.14
VID28P40547 KAP122YGL016W 3246 nt1.66□□□□□ -2.14
VID28P40547 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.66□□□□□ -2.14
VID28P40547 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.66□□□□□ -2.14
VID28P40547 YLR140WYLR140W 327 nt1.66□□□□□ -2.14
VID28P40547 MSH3YCR092C 3057 nt1.66□□□□□ -2.14
VID28P40547 Q0032Q0032 291 nt1.65□□□□□ -2.15
VID28P40547 ULI1YFR026C 510 nt1.65□□□□□ -2.15
VID28P40547 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.65□□□□□ -2.15
VID28P40547 YLR422WYLR422W 5799 nt1.64□□□□□ -2.15
VID28P40547 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.64□□□□□ -2.15
VID28P40547 BST1YFL025C 3090 nt1.64□□□□□ -2.15
VID28P40547 PIK1YNL267W 3201 nt1.64□□□□□ -2.15
VID28P40547 PMD1YER132C 5262 nt1.63□□□□□ -2.15
VID28P40547 YOR019WYOR019W 2193 nt1.63□□□□□ -2.15
VID28P40547 YDL196WYDL196W 330 nt1.62□□□□□ -2.15
VID28P40547 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt1.62□□□□□ -2.15
VID28P40547 YOR225WYOR225W 330 nt1.61□□□□□ -2.15
VID28P40547 snR14snR14 160 nt1.61□□□□□ -2.15
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