Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC00271P0C7V0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms