Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms