Protein–RNA interactions for Protein: Q3E7B3

YPR108W-A, Uncharacterized protein YPR108W-A, yeastyeast

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR108W-AQ3E7B3 YNL211CYNL211C 261 nt-0.58□□□□□ -2.5
YPR108W-AQ3E7B3 URB1YKL014C 5295 nt-0.58□□□□□ -2.5
YPR108W-AQ3E7B3 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.59□□□□□ -2.5
YPR108W-AQ3E7B3 YNL146WYNL146W 303 nt-0.59□□□□□ -2.5
YPR108W-AQ3E7B3 YBR063CYBR063C 1215 nt-0.59□□□□□ -2.5
YPR108W-AQ3E7B3 RSM18YER050C 417 nt-0.6□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 COX5BYIL111W 456 nt-0.6□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.6□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 LSM4YER112W 564 nt-0.61□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 ATP20YPR020W 348 nt-0.61□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 COY1YKL179C 2040 nt-0.62□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 OLI1Q0130 231 nt-0.62□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 YKU70YMR284W 1809 nt-0.62□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.63□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 PRP21YJL203W 843 nt-0.63□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 RUF20RUF20 443 nt-0.63□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 MCM10YIL150C 1716 nt-0.64□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 BI3Q0115 1554 nt-0.64□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 snR79snR79 84 nt-0.64□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 MRPL31YKL138C 396 nt-0.64□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.64□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 YDR008CYDR008C 351 nt-0.65□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 ECM9YKR004C 1134 nt-0.65□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt-0.65□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 PAN3YKL025C 2040 nt-0.65□□□□□ -2.51
YPR108W-AQ3E7B3 COX3Q0275 810 nt-0.66□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YJL007CYJL007C 315 nt-0.66□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YJR079WYJR079W 330 nt-0.66□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt-0.66□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YPL197CYPL197C 414 nt-0.66□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.66□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 THG1YGR024C 714 nt-0.67□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YJL086CYJL086C 369 nt-0.67□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 AFB1YLR040C 675 nt-0.67□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 RPS10BYMR230W 318 nt-0.67□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 TFB6YOR352W 1032 nt-0.67□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 ASE1YOR058C 2658 nt-0.68□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 QCR7YDR529C 384 nt-0.68□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.68□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.68□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 COX7YMR256C 183 nt-0.68□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YPR099CYPR099C 357 nt-0.68□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 snR46snR46 197 nt-0.68□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 BI4Q0120 1917 nt-0.68□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 UTP8YGR128C 2142 nt-0.68□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 NIP100YPL174C 2607 nt-0.68□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 NNF2YGR089W 2811 nt-0.69□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YBR064WYBR064W 429 nt-0.69□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YER076W-AYER076W-A 348 nt-0.7□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.7□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YLR198CYLR198C 360 nt-0.7□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 HTB2YBL002W 396 nt-0.7□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YOR345CYOR345C 351 nt-0.7□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 HAL9YOL089C 3093 nt-0.71□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 NIP1YMR309C 2439 nt-0.71□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 RUB1YDR139C 234 nt-0.71□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 RMD6YEL072W 696 nt-0.71□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.71□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.71□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.72□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 CMS1YLR003C 876 nt-0.72□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YNL171CYNL171C 369 nt-0.72□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.72□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-0.72□□□□□ -2.52
YPR108W-AQ3E7B3 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt-0.73□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.73□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 YPL225WYPL225W 441 nt-0.73□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 RFX1YLR176C 2436 nt-0.74□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 HTB1YDR224C 396 nt-0.74□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 TDA2YER071C 381 nt-0.74□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.74□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 RAD34YDR314C 2079 nt-0.74□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 snR57snR57 88 nt-0.75□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 POP6YGR030C 477 nt-0.75□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 YPL185WYPL185W 396 nt-0.75□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 SDS22YKL193C 1017 nt-0.76□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 VPS63YLR261C 327 nt-0.76□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.76□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 YPL205CYPL205C 345 nt-0.76□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 SUS1YBR111W-A 291 nt-0.76□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 snR44snR44 211 nt-0.76□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 YER138W-AYER138W-A 105 nt-0.77□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 YGL204CYGL204C 306 nt-0.77□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.77□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 DFG10YIL049W 762 nt-0.77□□□□□ -2.53
YPR108W-AQ3E7B3 DIE2YGR227W 1578 nt-0.79□□□□□ -2.54
YPR108W-AQ3E7B3 PSF2YJL072C 642 nt-0.79□□□□□ -2.54
YPR108W-AQ3E7B3 YJL135WYJL135W 318 nt-0.79□□□□□ -2.54
YPR108W-AQ3E7B3 PAA1YDR071C 576 nt-0.8□□□□□ -2.54
YPR108W-AQ3E7B3 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt-0.8□□□□□ -2.54
YPR108W-AQ3E7B3 YLR271WYLR271W 825 nt-0.8□□□□□ -2.54
YPR108W-AQ3E7B3 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.8□□□□□ -2.54
YPR108W-AQ3E7B3 SVS1YPL163C 783 nt-0.8□□□□□ -2.54
YPR108W-AQ3E7B3 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.81□□□□□ -2.54
YPR108W-AQ3E7B3 SNU56YDR240C 1479 nt-0.81□□□□□ -2.54
YPR108W-AQ3E7B3 RSM23YGL129C 1353 nt-0.82□□□□□ -2.54
YPR108W-AQ3E7B3 YAP6YDR259C 1152 nt-0.82□□□□□ -2.54
YPR108W-AQ3E7B3 GSP1YLR293C 660 nt-0.82□□□□□ -2.54
YPR108W-AQ3E7B3 BLS1YLR408C 369 nt-0.82□□□□□ -2.54
YPR108W-AQ3E7B3 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.83□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 89.8 ms