Protein–RNA interactions for Protein: Q12234

RUD3, GRIP domain-containing protein RUD3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUD3Q12234 URM1YIL008W 300 nt0.55□□□□□ -2.32
RUD3Q12234 YLR198CYLR198C 360 nt0.55□□□□□ -2.32
RUD3Q12234 RCN2YOR220W 798 nt0.55□□□□□ -2.32
RUD3Q12234 PAN2YGL094C 3348 nt0.54□□□□□ -2.32
RUD3Q12234 YJR003CYJR003C 1560 nt0.54□□□□□ -2.32
RUD3Q12234 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.54□□□□□ -2.32
RUD3Q12234 YIL029CYIL029C 429 nt0.54□□□□□ -2.32
RUD3Q12234 GRX5YPL059W 453 nt0.54□□□□□ -2.32
RUD3Q12234 IRC16YPR038W 360 nt0.54□□□□□ -2.32
RUD3Q12234 UTP20YBL004W 7482 nt0.54□□□□□ -2.32
RUD3Q12234 BFR2YDR299W 1605 nt0.53□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 SPO11YHL022C 1197 nt0.52□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 APQ13YJL075C 417 nt0.52□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 ILM1YJR118C 612 nt0.52□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.51□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 PRP21YJL203W 843 nt0.51□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 DCP1YOL149W 696 nt0.51□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 YDR269CYDR269C 324 nt0.5□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 YHL042WYHL042W 453 nt0.5□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 VMA21YGR105W 234 nt0.49□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 YNL050CYNL050C 813 nt0.49□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 YOR282WYOR282W 321 nt0.49□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 GEA2YEL022W 4380 nt0.48□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 YSP1YHR155W 3687 nt0.48□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 RPL9AYGL147C 576 nt0.48□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 YGL239CYGL239C 315 nt0.48□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 YKL044WYKL044W 321 nt0.48□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 LOA1YPR139C 903 nt0.48□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 YER135CYER135C 393 nt0.47□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 PHS1YJL097W 654 nt0.47□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 YOR218CYOR218C 420 nt0.47□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 ZIP2YGL249W 2115 nt0.47□□□□□ -2.33
RUD3Q12234 PMP1YCR024C-A 123 nt0.46□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 GPG1YGL121C 381 nt0.46□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 HUR1YGL168W 333 nt0.46□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.46□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.46□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.46□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 CHS6YJL099W 2241 nt0.46□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 NOP9YJL010C 2001 nt0.45□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 ULP2YIL031W 3105 nt0.43□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.43□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 FMP27YLR454W 7887 nt0.43□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.42□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.42□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.42□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.42□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.42□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.42□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.42□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.42□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.42□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 NPR2YEL062W 1848 nt0.41□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 YJL135WYJL135W 318 nt0.41□□□□□ -2.34
RUD3Q12234 YGR025WYGR025W 303 nt0.4□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 BER1YLR412W 825 nt0.4□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 snR13snR13 124 nt0.4□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.39□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.39□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 SVS1YPL163C 783 nt0.39□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 EFR3YMR212C 2349 nt0.39□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 Q0255Q0255 1419 nt0.38□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.38□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 ABF2YMR072W 552 nt0.38□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 MYO1YHR023W 5787 nt0.38□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.37□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 YJR141WYJR141W 1044 nt0.37□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 PKH2YOL100W 3246 nt0.36□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 UBC7YMR022W 498 nt0.36□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.35□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 RPS27AYKL156W 249 nt0.35□□□□□ -2.35
RUD3Q12234 YDR029WYDR029W 315 nt0.34□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 YDR344CYDR344C 444 nt0.34□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.34□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 YCK3YER123W 1575 nt0.34□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.34□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 RPL26BYGR034W 384 nt0.33□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 RPS24BYIL069C 408 nt0.33□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 RPL26AYLR344W 384 nt0.33□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 YOL160WYOL160W 342 nt0.33□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 YDL016CYDL016C 303 nt0.32□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 UBX4YMR067C 1251 nt0.32□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 RPB10YOR210W 213 nt0.32□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 YPL182CYPL182C 384 nt0.32□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 TSC3YBR058C-A 243 nt0.32□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.32□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.31□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.31□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 YKL202WYKL202W 582 nt0.31□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 CDC33YOL139C 642 nt0.31□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 YPL261CYPL261C 309 nt0.31□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 AI1Q0050 2505 nt0.31□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 SBH1YER087C-B 249 nt0.3□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 WIP1YDR374W-A 270 nt0.29□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 BSC3YLR465C 309 nt0.29□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 YPL044CYPL044C 549 nt0.29□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 RAD34YDR314C 2079 nt0.29□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 BIG1YHR101C 1008 nt0.28□□□□□ -2.36
RUD3Q12234 SNU56YDR240C 1479 nt0.28□□□□□ -2.37
RUD3Q12234 BIR1YJR089W 2865 nt0.27□□□□□ -2.37
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