Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 MUK1YPL070W 1839 nt1.65□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 FYV8YGR196C 2454 nt1.65□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 YLL032CYLL032C 2478 nt1.64□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 YDR426CYDR426C 378 nt1.64□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 YER181CYER181C 324 nt1.64□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.64□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.64□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 ENV11YGR071C 2583 nt1.63□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 SEC63YOR254C 1992 nt1.63□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 RLM1YPL089C 2031 nt1.63□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 snR72snR72 98 nt1.63□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 NPC2YDL046W 522 nt1.63□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 RPL39YJL189W 156 nt1.63□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 TBS1YBR150C 3285 nt1.63□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 KCS1YDR017C 3153 nt1.63□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 MAD1YGL086W 2250 nt1.63□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 CTR9YOL145C 3234 nt1.62□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 RPB10YOR210W 213 nt1.62□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 INP2YMR163C 2118 nt1.61□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 YOR019WYOR019W 2193 nt1.61□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 MDM20YOL076W 2391 nt1.61□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 MAK10YEL053C 2202 nt1.61□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 snR65snR65 100 nt1.61□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 PCC1YKR095W-A 267 nt1.61□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 YAR029WYAR029W 225 nt1.61□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 YLR255CYLR255C 354 nt1.61□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.61□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 HKR1YDR420W 5409 nt1.61□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 ZIP1YDR285W 2628 nt1.6□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 HTL1YCR020W-B 237 nt1.6□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 RPL31AYDL075W 342 nt1.6□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 SLY1YDR189W 2001 nt1.6□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 IRE1YHR079C 3348 nt1.6□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 DBP6YNR038W 1890 nt1.59□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 SEY1YOR165W 2331 nt1.59□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.59□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 AHC1YOR023C 1701 nt1.59□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 ADR1YDR216W 3972 nt1.58□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 YGL149WYGL149W 306 nt1.58□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 NIP100YPL174C 2607 nt1.57□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 MLH3YPL164C 2148 nt1.57□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 DCP2YNL118C 2913 nt1.57□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 SFB2YNL049C 2631 nt1.57□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 YDR344CYDR344C 444 nt1.56□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.56□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.56□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 YOL160WYOL160W 342 nt1.56□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 MSH3YCR092C 3057 nt1.56□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.55□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 SPO24YPR036W-A 204 nt1.55□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 YPR063CYPR063C 423 nt1.55□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 MPT5YGL178W 2580 nt1.55□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 HMI1YOL095C 2121 nt1.55□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 APL2YKL135C 2181 nt1.55□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 PIG1YLR273C 1947 nt1.54□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.54□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 NUP192YJL039C 5052 nt1.54□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 PAU2YEL049W 363 nt1.54□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 YIL032CYIL032C 357 nt1.54□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 DGR2YKL121W 2559 nt1.53□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 MDS3YGL197W 4464 nt1.53□□□□□ -2.16
LSP1Q12230 FRK1YPL141C 2598 nt1.53□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 SXM1YDR395W 2835 nt1.52□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 SSS1YDR086C 243 nt1.52□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 SDH2YLL041C 801 nt1.52□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 PIK1YNL267W 3201 nt1.52□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 ZIP2YGL249W 2115 nt1.52□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 ALG13YGL047W 609 nt1.51□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 CDC31YOR257W 486 nt1.51□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.51□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 SAS3YBL052C 2496 nt1.51□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 OST1YJL002C 1431 nt1.5□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 PBY1YBR094W 2262 nt1.5□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 snR60snR60 104 nt1.5□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.5□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 FIG2YCR089W 4830 nt1.5□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 SKI3YPR189W 4299 nt1.5□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 SEC21YNL287W 2808 nt1.49□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 INA22YIR024C 651 nt1.49□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 PMD1YER132C 5262 nt1.49□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 RAD34YDR314C 2079 nt1.49□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.48□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 YCR022CYCR022C 345 nt1.48□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 YGR069WYGR069W 336 nt1.48□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.48□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 CDC25YLR310C 4770 nt1.48□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 TRM732YMR259C 4263 nt1.48□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 RAD61YDR014W 1944 nt1.47□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 CTF4YPR135W 2784 nt1.47□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.47□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 YOR282WYOR282W 321 nt1.47□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 SCW11YGL028C 1629 nt1.47□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 YCK3YER123W 1575 nt1.47□□□□□ -2.17
LSP1Q12230 SPO75YLL005C 2607 nt1.46□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 COG8YML071C 1824 nt1.46□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 CDC36YDL165W 576 nt1.46□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 YDL211CYDL211C 1119 nt1.46□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 YHL042WYHL042W 453 nt1.46□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 YJL022WYJL022W 309 nt1.46□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 SPT21YMR179W 2277 nt1.46□□□□□ -2.18
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