Protein–RNA interactions for Protein: Q12220

DIP2, U3 small nucleolar RNA-associated protein 12, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 943 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DIP2Q12220 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.65□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.65□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.65□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.65□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.65□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.65□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.65□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.65□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.65□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt4.65□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt4.65□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 SWR1YDR334W 4545 nt4.65□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 TAH1YCR060W 336 nt4.64□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 COG4YPR105C 2586 nt4.63□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 EAF1YDR359C 2949 nt4.63□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 MAK10YEL053C 2202 nt4.63□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 SCP160YJL080C 3669 nt4.63□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 RTT107YHR154W 3213 nt4.63□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 VAS1YGR094W 3315 nt4.62□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 snR64snR64 101 nt4.62□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 SGM1YJR134C 2124 nt4.61□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 YER078W-AYER078W-A 165 nt4.61□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 PKH2YOL100W 3246 nt4.61□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 PAU11YGL261C 363 nt4.6□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt4.6□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 MLH3YPL164C 2148 nt4.6□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 UFD2YDL190C 2886 nt4.59□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 YDR210WYDR210W 228 nt4.59□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 RPS26AYGL189C 360 nt4.59□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 GLG1YKR058W 1851 nt4.59□□□□□ -1.67
DIP2Q12220 BUB1YGR188C 3066 nt4.59□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 FIR1YER032W 2631 nt4.59□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 ECM21YBL101C 3354 nt4.58□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 ISW1YBR245C 3390 nt4.58□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 YDL206WYDL206W 2289 nt4.58□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 RPO21YDL140C 5202 nt4.58□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 TBS1YBR150C 3285 nt4.57□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 YLR278CYLR278C 4026 nt4.57□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 IST2YBR086C 2841 nt4.56□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 snR50snR50 90 nt4.56□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt4.56□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 YGR067CYGR067C 2415 nt4.56□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 CHD1YER164W 4407 nt4.55□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 TUS1YLR425W 3924 nt4.55□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 VPS8YAL002W 3825 nt4.55□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 STU2YLR045C 2667 nt4.54□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 FLO5YHR211W 3228 nt4.53□□□□□ -1.68
DIP2Q12220 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt4.52□□□□□ -1.69
DIP2Q12220 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt4.52□□□□□ -1.69
DIP2Q12220 COX19YLL018C-A 297 nt4.52□□□□□ -1.69
DIP2Q12220 BUD2YKL092C 3315 nt4.51□□□□□ -1.69
DIP2Q12220 PKH1YDR490C 2301 nt4.51□□□□□ -1.69
DIP2Q12220 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt4.51□□□□□ -1.69
DIP2Q12220 INP51YIL002C 2841 nt4.5□□□□□ -1.69
DIP2Q12220 CBF2YGR140W 2871 nt4.49□□□□□ -1.69
DIP2Q12220 SMC3YJL074C 3693 nt4.48□□□□□ -1.69
DIP2Q12220 SLI15YBR156C 2097 nt4.47□□□□□ -1.69
DIP2Q12220 MSH5YDL154W 2706 nt4.46□□□□□ -1.69
DIP2Q12220 RTP1YMR185W 2946 nt4.46□□□□□ -1.69
DIP2Q12220 SIN3YOL004W 4611 nt4.46□□□□□ -1.69
DIP2Q12220 RPM2YML091C 3609 nt4.46□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 SSN2YDR443C 4263 nt4.46□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 SMC6YLR383W 3345 nt4.46□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 FAS2YPL231W 5664 nt4.44□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 JSN1YJR091C 3276 nt4.43□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 RPS28BYLR264W 204 nt4.43□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 ADR1YDR216W 3972 nt4.43□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 POL5YEL055C 3069 nt4.43□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 MDM1YML104C 3384 nt4.42□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt4.42□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt4.42□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 TRM3YDL112W 4311 nt4.42□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 RSM22YKL155C 1887 nt4.41□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 YLR232WYLR232W 348 nt4.41□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 snR47snR47 99 nt4.41□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 ASE1YOR058C 2658 nt4.41□□□□□ -1.7
DIP2Q12220 snR75snR75 89 nt4.4□□□□□ -1.71
DIP2Q12220 PAU10YDR542W 363 nt4.4□□□□□ -1.71
DIP2Q12220 PAU4YLR461W 363 nt4.4□□□□□ -1.71
DIP2Q12220 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt4.39□□□□□ -1.71
DIP2Q12220 YML002WYML002W 2214 nt4.38□□□□□ -1.71
DIP2Q12220 DBP10YDL031W 2988 nt4.38□□□□□ -1.71
DIP2Q12220 SVL3YPL032C 2478 nt4.37□□□□□ -1.71
DIP2Q12220 APE2YKL157W 2859 nt4.37□□□□□ -1.71
DIP2Q12220 NUP159YIL115C 4383 nt4.37□□□□□ -1.71
DIP2Q12220 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt4.36□□□□□ -1.71
DIP2Q12220 RDS1YCR106W 2499 nt4.35□□□□□ -1.71
DIP2Q12220 RAD9YDR217C 3930 nt4.35□□□□□ -1.71
DIP2Q12220 ORC3YLL004W 1851 nt4.34□□□□□ -1.71
DIP2Q12220 SLA1YBL007C 3735 nt4.34□□□□□ -1.72
DIP2Q12220 AGC1YPR021C 2709 nt4.32□□□□□ -1.72
DIP2Q12220 FRK1YPL141C 2598 nt4.32□□□□□ -1.72
DIP2Q12220 CAF120YNL278W 3183 nt4.32□□□□□ -1.72
DIP2Q12220 YBT1YLL048C 4986 nt4.32□□□□□ -1.72
DIP2Q12220 GCN2YDR283C 4980 nt4.31□□□□□ -1.72
DIP2Q12220 AUS1YOR011W 4185 nt4.3□□□□□ -1.72
DIP2Q12220 MET18YIL128W 3099 nt4.3□□□□□ -1.72
DIP2Q12220 SEC26YDR238C 2922 nt4.29□□□□□ -1.72
DIP2Q12220 CDC60YPL160W 3273 nt4.29□□□□□ -1.72
DIP2Q12220 PNC1YGL037C 651 nt4.27□□□□□ -1.73
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