Protein–RNA interactions for Protein: Q12211

PUS1, tRNA pseudouridine synthase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS1Q12211 SAK1YER129W 3429 nt2.97□□□□□ -1.93
PUS1Q12211 COG6YNL041C 2520 nt2.97□□□□□ -1.93
PUS1Q12211 IKI3YLR384C 4050 nt2.97□□□□□ -1.93
PUS1Q12211 FMP16YDR070C 282 nt2.97□□□□□ -1.93
PUS1Q12211 APL1YJR005W 2103 nt2.97□□□□□ -1.93
PUS1Q12211 SGM1YJR134C 2124 nt2.97□□□□□ -1.93
PUS1Q12211 RPL42AYNL162W 321 nt2.97□□□□□ -1.93
PUS1Q12211 YLL054CYLL054C 2532 nt2.97□□□□□ -1.93
PUS1Q12211 PRP5YBR237W 2550 nt2.97□□□□□ -1.93
PUS1Q12211 GIS1YDR096W 2685 nt2.96□□□□□ -1.93
PUS1Q12211 RIF1YBR275C 5751 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 SLM1YIL105C 2061 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 MPH1YIR002C 2982 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 YKU80YMR106C 1890 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 MNE1YOR350C 1992 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 VPS35YJL154C 2835 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 POM152YMR129W 4014 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 SLH1YGR271W 5904 nt2.95□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 APC11YDL008W 498 nt2.95□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 FAR11YNL127W 2862 nt2.94□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 RPS29AYLR388W 171 nt2.94□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 KRE33YNL132W 3171 nt2.93□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 snR64snR64 101 nt2.93□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 snR70snR70 164 nt2.93□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 NAB6YML117W 3405 nt2.93□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 BNR1YIL159W 4128 nt2.93□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 RGA2YDR379W 3030 nt2.93□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 MMS1YPR164W 4224 nt2.92□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 YMR31YFR049W 372 nt2.92□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt2.92□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 SWI6YLR182W 2412 nt2.92□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 SEF1YBL066C 3447 nt2.91□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 RPS26AYGL189C 360 nt2.91□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 PIP2YOR363C 2991 nt2.9□□□□□ -1.94
PUS1Q12211 GCV2YMR189W 3105 nt2.9□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 YGL182CYGL182C 324 nt2.9□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt2.9□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 SRO77YBL106C 3033 nt2.9□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 HMI1YOL095C 2121 nt2.9□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 YPL150WYPL150W 2706 nt2.9□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 RPH1YER169W 2391 nt2.89□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 RFX1YLR176C 2436 nt2.89□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 EDS1YBR033W 2760 nt2.89□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 SNF5YBR289W 2718 nt2.89□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 SCH9YHR205W 2475 nt2.88□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 ATG11YPR049C 3537 nt2.88□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 PUT3YKL015W 2940 nt2.88□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 UBP1YDL122W 2430 nt2.88□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.88□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 snR50snR50 90 nt2.88□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 RAD34YDR314C 2079 nt2.88□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt2.87□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 BFR2YDR299W 1605 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 ORC3YLL004W 1851 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 YNL114CYNL114C 372 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 PDR3YBL005W 2931 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 ASE1YOR058C 2658 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 SET2YJL168C 2202 nt2.85□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt2.85□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 KTI11YBL071W-A 249 nt2.85□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 CSF1YLR087C 8877 nt2.85□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 YBT1YLL048C 4986 nt2.84□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.84□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 FKS3YMR306W 5358 nt2.84□□□□□ -1.95
PUS1Q12211 RRP6YOR001W 2202 nt2.84□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 MRD1YPR112C 2664 nt2.83□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 MAD1YGL086W 2250 nt2.83□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.83□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 UBP15YMR304W 3693 nt2.83□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 SDC25YLL016W 3147 nt2.83□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 BCK1YJL095W 4437 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 AXL1YPR122W 3627 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YER138CYER138C 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YER160CYER160C 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YJR027WYJR027W 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YML039WYML039W 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YML045WYML045W 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YMR050CYMR050C 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
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