Protein–RNA interactions for Protein: Q12180

HAL9, Halotolerance protein 9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9Q12180 SCP160YJL080C 3669 nt2.29□□□□□ -2.04
HAL9Q12180 YEF3YLR249W 3135 nt2.29□□□□□ -2.04
HAL9Q12180 SPC98YNL126W 2541 nt2.29□□□□□ -2.04
HAL9Q12180 CLN3YAL040C 1743 nt2.29□□□□□ -2.04
HAL9Q12180 SGF11YPL047W 300 nt2.29□□□□□ -2.04
HAL9Q12180 MSB1YOR188W 3414 nt2.29□□□□□ -2.04
HAL9Q12180 snR74snR74 88 nt2.28□□□□□ -2.04
HAL9Q12180 MCM10YIL150C 1716 nt2.28□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 IST2YBR086C 2841 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 SAS3YBL052C 2496 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 NOP14YDL148C 2433 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 REV3YPL167C 4515 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 UBR1YGR184C 5853 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 RTT101YJL047C 2529 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 MAK10YEL053C 2202 nt2.26□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 TRL1YJL087C 2484 nt2.26□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 ELG1YOR144C 2376 nt2.26□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 YFR016CYFR016C 3702 nt2.26□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 RTT107YHR154W 3213 nt2.26□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 TOR1YJR066W 7413 nt2.25□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 ZIP2YGL249W 2115 nt2.25□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.25□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.25□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 YOR170WYOR170W 306 nt2.25□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 CDC60YPL160W 3273 nt2.25□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 PUT3YKL015W 2940 nt2.24□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 YDR341CYDR341C 1824 nt2.24□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 RPL34BYIL052C 366 nt2.24□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 SPO75YLL005C 2607 nt2.24□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 RLM1YPL089C 2031 nt2.24□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 TOF1YNL273W 3717 nt2.23□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 BRP1YGL007W 378 nt2.23□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 YGL217CYGL217C 342 nt2.23□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.23□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 APL5YPL195W 2799 nt2.23□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 RAD34YDR314C 2079 nt2.22□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 ECM12YHR021W-A 456 nt2.22□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 PET309YLR067C 2898 nt2.22□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 HSH155YMR288W 2916 nt2.21□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 ULI1YFR026C 510 nt2.21□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 RPS25BYLR333C 327 nt2.21□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.21□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 YBR174CYBR174C 315 nt2.21□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 snR46snR46 197 nt2.21□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 GIP3YPL137C 3831 nt2.21□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 NAM7YMR080C 2916 nt2.21□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 SSD1YDR293C 3753 nt2.21□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 SPO21YOL091W 1830 nt2.2□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 SAP185YJL098W 3177 nt2.2□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 SCD5YOR329C 2619 nt2.2□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.2□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 VTC1YER072W 390 nt2.2□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 YJL120WYJL120W 324 nt2.2□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 DNF1YER166W 4716 nt2.2□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 SYH1YPL105C 2550 nt2.2□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 MAD1YGL086W 2250 nt2.2□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 NUP170YBL079W 4509 nt2.19□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 RAV1YJR033C 4074 nt2.19□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 ATP7YKL016C 525 nt2.19□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.19□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 MLH3YPL164C 2148 nt2.19□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 YOL098CYOL098C 3114 nt2.19□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 APL2YKL135C 2181 nt2.19□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 VPS13YLL040C 9435 nt2.18□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 YIR044CYIR044C 186 nt2.18□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.18□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 YNL170WYNL170W 396 nt2.18□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 ENV11YGR071C 2583 nt2.18□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 IRA2YOL081W 9240 nt2.18□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 SAC3YDR159W 3906 nt2.17□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 HMI1YOL095C 2121 nt2.17□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.17□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 snR52snR52 92 nt2.17□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 NOC3YLR002C 1992 nt2.17□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 CAT2YML042W 2013 nt2.17□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 CTR9YOL145C 3234 nt2.16□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 MSH5YDL154W 2706 nt2.16□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 UBP1YDL122W 2430 nt2.16□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 RPL37BYDR500C 267 nt2.16□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 BUD2YKL092C 3315 nt2.16□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 YLL007CYLL007C 1998 nt2.16□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 IRC8YJL051W 2469 nt2.15□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 PTP2YOR208W 2253 nt2.15□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 BNI1YNL271C 5862 nt2.15□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 ATG11YPR049C 3537 nt2.14□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 IRE1YHR079C 3348 nt2.14□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 HER1YOR227W 3741 nt2.14□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 RGA1YOR127W 3024 nt2.14□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 COF1YLL050C 432 nt2.14□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 AGC1YPR021C 2709 nt2.14□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 CUL3YGR003W 2235 nt2.14□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 TFC3YAL001C 3483 nt2.14□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 DGR2YKL121W 2559 nt2.13□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 STH1YIL126W 4080 nt2.13□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 LRE1YCL051W 1752 nt2.13□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 SAP190YKR028W 3102 nt2.13□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.12□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 RPL31AYDL075W 342 nt2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.6 ms