Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 YIL102CYIL102C 306 nt2□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 YNL144CYNL144C 2223 nt2□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 UBR2YLR024C 5619 nt1.99□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 SKI3YPR189W 4299 nt1.99□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 FAB1YFR019W 6837 nt1.98□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 YHR210CYHR210C 1026 nt1.98□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 MYO2YOR326W 4725 nt1.98□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.97□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.96□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 PIG1YLR273C 1947 nt1.95□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 ZIP2YGL249W 2115 nt1.95□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.95□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.95□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 YOL160WYOL160W 342 nt1.95□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 YPR063CYPR063C 423 nt1.95□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 KCS1YDR017C 3153 nt1.95□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 CTF4YPR135W 2784 nt1.94□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 ENV11YGR071C 2583 nt1.94□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 EMC5YIL027C 426 nt1.94□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 YIL032CYIL032C 357 nt1.94□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.94□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 RPL31AYDL075W 342 nt1.93□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 SDH2YLL041C 801 nt1.93□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.93□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 APL2YKL135C 2181 nt1.93□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 OST1YJL002C 1431 nt1.91□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.91□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 YCR022CYCR022C 345 nt1.91□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.91□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 PAU2YEL049W 363 nt1.91□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 YHL042WYHL042W 453 nt1.91□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 BPH1YCR032W 6504 nt1.91□□□□□ -2.1
SLX4Q12098 YDR344CYDR344C 444 nt1.9□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 PEP1YBL017C 4740 nt1.9□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 YCS4YLR272C 3531 nt1.9□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 YOR019WYOR019W 2193 nt1.89□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 YDL211CYDL211C 1119 nt1.89□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 IRC20YLR247C 4671 nt1.89□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 SPO24YPR036W-A 204 nt1.89□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 MAD1YGL086W 2250 nt1.88□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 snR60snR60 104 nt1.88□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.88□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 YOR282WYOR282W 321 nt1.88□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 NIP100YPL174C 2607 nt1.88□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.87□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 ALG13YGL047W 609 nt1.87□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 SPT21YMR179W 2277 nt1.87□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 NCA2YPR155C 1851 nt1.86□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 RAD34YDR314C 2079 nt1.86□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 NOC3YLR002C 1992 nt1.86□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 LCD1YDR499W 2244 nt1.86□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 SPC98YNL126W 2541 nt1.85□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 COG8YML071C 1824 nt1.85□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 NUT1YGL151W 3399 nt1.85□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 SSS1YDR086C 243 nt1.85□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 YGR069WYGR069W 336 nt1.85□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.85□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 UFD2YDL190C 2886 nt1.85□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 ANS1YHR126C 480 nt1.84□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 SEC5YDR166C 2916 nt1.84□□□□□ -2.11
SLX4Q12098 BST1YFL025C 3090 nt1.84□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 SCW11YGL028C 1629 nt1.84□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 RTP1YMR185W 2946 nt1.84□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 RAD61YDR014W 1944 nt1.83□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 ALK1YGL021W 2283 nt1.83□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 HMRA2YCR096C 360 nt1.83□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 YJL022WYJL022W 309 nt1.83□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 COF1YLL050C 432 nt1.83□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 YCK3YER123W 1575 nt1.83□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 VPS55YJR044C 423 nt1.82□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 MPT5YGL178W 2580 nt1.81□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 KAP122YGL016W 3246 nt1.81□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 RPL34BYIL052C 366 nt1.81□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 YIR044CYIR044C 186 nt1.81□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.81□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 YOR376WYOR376W 369 nt1.81□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 RAD50YNL250W 3939 nt1.81□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 FIG2YCR089W 4830 nt1.81□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 CFT1YDR301W 4074 nt1.81□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 DNF3YMR162C 4971 nt1.8□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 YLR422WYLR422W 5799 nt1.8□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt1.8□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 COA6YMR244C-A 315 nt1.8□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt1.8□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 KIP1YBL063W 3336 nt1.8□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 VIK1YPL253C 1944 nt1.79□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 MON2YNL297C 4911 nt1.79□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 CUL3YGR003W 2235 nt1.79□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 YLL054CYLL054C 2532 nt1.79□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 YGL217CYGL217C 342 nt1.79□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 YJL015CYJL015C 285 nt1.79□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 VPS54YDR027C 2670 nt1.79□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 SLI15YBR156C 2097 nt1.78□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 MEC1YBR136W 7107 nt1.78□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 YLR140WYLR140W 327 nt1.78□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 YNL028WYNL028W 318 nt1.78□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 CSE2YNR010W 450 nt1.78□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.78□□□□□ -2.12
SLX4Q12098 INA22YIR024C 651 nt1.77□□□□□ -2.13
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