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Protein–RNA interactions for Protein: Q12090
REX3, RNA exonuclease 3, yeast
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404 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
REX3
Q12090
YML108W
YML108W
318 nt
1
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
IRC23
YOR044W
474 nt
1
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
YOR108C-A
YOR108C-A
210 nt
1
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
YOR199W
YOR199W
330 nt
1
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
CDC39
YCR093W
6327 nt
1
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
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YDL206W
2289 nt
0.99
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
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YMR242W-A
90 nt
0.99
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
BUD3
YCL014W
4911 nt
0.99
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
SCC2
YDR180W
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0.99
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
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YDL046W
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□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
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YKL202W
582 nt
0.98
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
AIM9
YER080W
1884 nt
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□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
ZIP2
YGL249W
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□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
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YHR088W
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0.97
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
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YDL158C
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□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
TIM13
YGR181W
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□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
IFH1
YLR223C
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0.96
□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
NFU1
YKL040C
771 nt
0.95
□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
YOR029W
YOR029W
336 nt
0.95
□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
YMR290W-A
YMR290W-A
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0.94
□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
PAN2
YGL094C
3348 nt
0.94
□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
YER084W-A
YER084W-A
513 nt
0.93
□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
DOP1
YDR141C
5097 nt
0.93
□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
PAC1
YOR269W
1485 nt
0.92
□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
YJR003C
YJR003C
1560 nt
0.92
□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
BEM2
YER155C
6504 nt
0.91
□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
YPR153W
YPR153W
423 nt
0.91
□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
snR54
snR54
86 nt
0.91
□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
UTP20
YBL004W
7482 nt
0.91
□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
WAR1
YML076C
2835 nt
0.91
□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
SLD3
YGL113W
2007 nt
0.91
□□□□□ -2.26
REX3
Q12090
GPG1
YGL121C
381 nt
0.9
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
PAM16
YJL104W
450 nt
0.9
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
YBL071C
YBL071C
309 nt
0.9
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
ZEO1
YOL109W
342 nt
0.9
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
YDL011C
YDL011C
324 nt
0.89
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
YLR287C
YLR287C
1068 nt
0.89
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
RPB10
YOR210W
213 nt
0.89
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
AIM29
YKR074W
468 nt
0.88
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
YNL122C
YNL122C
348 nt
0.88
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
YPL261C
YPL261C
309 nt
0.88
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
BI2
Q0110
1272 nt
0.87
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
ECL1
YGR146C
636 nt
0.87
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
YJL135W
YJL135W
318 nt
0.87
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
SMC1
YFL008W
3678 nt
0.86
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
YDL196W
YDL196W
330 nt
0.86
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
ISD11
YER048W-A
285 nt
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□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
DIE2
YGR227W
1578 nt
0.86
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
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YJL020W-A
258 nt
0.85
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
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YOL013W-B
291 nt
0.85
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
YOL160W
YOL160W
342 nt
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□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
ALG13
YGL047W
609 nt
0.84
□□□□□ -2.27
REX3
Q12090
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YIR044C
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□□□□□ -2.27
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Q12090
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YLR171W
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ERP4
YOR016C
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Q12090
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YOR182C
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REX3
Q12090
PKH2
YOL100W
3246 nt
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Q12090
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YPL229W
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Q12090
DBP6
YNR038W
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Q12090
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YAL016C-B
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Q12090
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YOL139C
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Q12090
IES4
YOR189W
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Q12090
LOA1
YPR139C
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Q12090
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YGR290W
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Q12090
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YHL042W
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□□□□□ -2.28
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Q12090
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YIL142C-A
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Q12090
snR189
snR189
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Q12090
WIP1
YDR374W-A
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YOR282W
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YBR301W
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Q12090
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YDL073W
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CUL3
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YER006C-A
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YMR141W-A
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YPR159C-A
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snR51
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YGR042W
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Q12090
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YNL058C
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YHR063W-A
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Q12090
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Q12090
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REX3
Q12090
snR72
snR72
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Q12090
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YDR511W
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REX3
Q12090
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YAL024C
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REX3
Q12090
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YMR160W
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REX3
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REX3
Q12090
SEC1
YDR164C
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REX3
Q12090
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REX3
Q12090
YKL083W
YKL083W
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□□□□□ -2.29
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Q12090
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YLR101C
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Q12090
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YAR047C
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□□□□□ -2.29
REX3
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YOR192C-C
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REX3
Q12090
PTP2
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□□□□□ -2.3
REX3
Q12090
CBS1
YDL069C
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□□□□□ -2.3
REX3
Q12090
tF(GAA)B
tF(GAA)B
73 nt
0.71
□□□□□ -2.3
REX3
Q12090
tF(GAA)F
tF(GAA)F
73 nt
0.71
□□□□□ -2.3
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