Protein–RNA interactions for Protein: Q12090

REX3, RNA exonuclease 3, yeastyeast

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REX3Q12090 YML108WYML108W 318 nt1□□□□□ -2.25
REX3Q12090 IRC23YOR044W 474 nt1□□□□□ -2.25
REX3Q12090 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1□□□□□ -2.25
REX3Q12090 YOR199WYOR199W 330 nt1□□□□□ -2.25
REX3Q12090 CDC39YCR093W 6327 nt1□□□□□ -2.25
REX3Q12090 YDL206WYDL206W 2289 nt0.99□□□□□ -2.25
REX3Q12090 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.99□□□□□ -2.25
REX3Q12090 BUD3YCL014W 4911 nt0.99□□□□□ -2.25
REX3Q12090 SCC2YDR180W 4482 nt0.99□□□□□ -2.25
REX3Q12090 NPC2YDL046W 522 nt0.98□□□□□ -2.25
REX3Q12090 YKL202WYKL202W 582 nt0.98□□□□□ -2.25
REX3Q12090 AIM9YER080W 1884 nt0.98□□□□□ -2.25
REX3Q12090 ZIP2YGL249W 2115 nt0.97□□□□□ -2.25
REX3Q12090 RPF1YHR088W 888 nt0.97□□□□□ -2.25
REX3Q12090 YDL158CYDL158C 309 nt0.96□□□□□ -2.26
REX3Q12090 TIM13YGR181W 318 nt0.96□□□□□ -2.26
REX3Q12090 IFH1YLR223C 3258 nt0.96□□□□□ -2.26
REX3Q12090 NFU1YKL040C 771 nt0.95□□□□□ -2.26
REX3Q12090 YOR029WYOR029W 336 nt0.95□□□□□ -2.26
REX3Q12090 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.94□□□□□ -2.26
REX3Q12090 PAN2YGL094C 3348 nt0.94□□□□□ -2.26
REX3Q12090 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.93□□□□□ -2.26
REX3Q12090 DOP1YDR141C 5097 nt0.93□□□□□ -2.26
REX3Q12090 PAC1YOR269W 1485 nt0.92□□□□□ -2.26
REX3Q12090 YJR003CYJR003C 1560 nt0.92□□□□□ -2.26
REX3Q12090 BEM2YER155C 6504 nt0.91□□□□□ -2.26
REX3Q12090 YPR153WYPR153W 423 nt0.91□□□□□ -2.26
REX3Q12090 snR54snR54 86 nt0.91□□□□□ -2.26
REX3Q12090 UTP20YBL004W 7482 nt0.91□□□□□ -2.26
REX3Q12090 WAR1YML076C 2835 nt0.91□□□□□ -2.26
REX3Q12090 SLD3YGL113W 2007 nt0.91□□□□□ -2.26
REX3Q12090 GPG1YGL121C 381 nt0.9□□□□□ -2.27
REX3Q12090 PAM16YJL104W 450 nt0.9□□□□□ -2.27
REX3Q12090 YBL071CYBL071C 309 nt0.9□□□□□ -2.27
REX3Q12090 ZEO1YOL109W 342 nt0.9□□□□□ -2.27
REX3Q12090 YDL011CYDL011C 324 nt0.89□□□□□ -2.27
REX3Q12090 YLR287CYLR287C 1068 nt0.89□□□□□ -2.27
REX3Q12090 RPB10YOR210W 213 nt0.89□□□□□ -2.27
REX3Q12090 AIM29YKR074W 468 nt0.88□□□□□ -2.27
REX3Q12090 YNL122CYNL122C 348 nt0.88□□□□□ -2.27
REX3Q12090 YPL261CYPL261C 309 nt0.88□□□□□ -2.27
REX3Q12090 BI2Q0110 1272 nt0.87□□□□□ -2.27
REX3Q12090 ECL1YGR146C 636 nt0.87□□□□□ -2.27
REX3Q12090 YJL135WYJL135W 318 nt0.87□□□□□ -2.27
REX3Q12090 SMC1YFL008W 3678 nt0.86□□□□□ -2.27
REX3Q12090 YDL196WYDL196W 330 nt0.86□□□□□ -2.27
REX3Q12090 ISD11YER048W-A 285 nt0.86□□□□□ -2.27
REX3Q12090 DIE2YGR227W 1578 nt0.86□□□□□ -2.27
REX3Q12090 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.85□□□□□ -2.27
REX3Q12090 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.85□□□□□ -2.27
REX3Q12090 YOL160WYOL160W 342 nt0.85□□□□□ -2.27
REX3Q12090 ALG13YGL047W 609 nt0.84□□□□□ -2.27
REX3Q12090 YIR044CYIR044C 186 nt0.84□□□□□ -2.27
REX3Q12090 YLR171WYLR171W 390 nt0.84□□□□□ -2.27
REX3Q12090 ERP4YOR016C 624 nt0.84□□□□□ -2.27
REX3Q12090 RPS30BYOR182C 192 nt0.84□□□□□ -2.27
REX3Q12090 PKH2YOL100W 3246 nt0.83□□□□□ -2.28
REX3Q12090 YPL229WYPL229W 621 nt0.83□□□□□ -2.28
REX3Q12090 DBP6YNR038W 1890 nt0.83□□□□□ -2.28
REX3Q12090 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.82□□□□□ -2.28
REX3Q12090 CDC33YOL139C 642 nt0.82□□□□□ -2.28
REX3Q12090 IES4YOR189W 351 nt0.82□□□□□ -2.28
REX3Q12090 LOA1YPR139C 903 nt0.82□□□□□ -2.28
REX3Q12090 YGR290WYGR290W 444 nt0.81□□□□□ -2.28
REX3Q12090 YHL042WYHL042W 453 nt0.81□□□□□ -2.28
REX3Q12090 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.81□□□□□ -2.28
REX3Q12090 snR189snR189 189 nt0.81□□□□□ -2.28
REX3Q12090 WIP1YDR374W-A 270 nt0.8□□□□□ -2.28
REX3Q12090 YOR282WYOR282W 321 nt0.8□□□□□ -2.28
REX3Q12090 PAU24YBR301W 363 nt0.8□□□□□ -2.28
REX3Q12090 YDL073WYDL073W 2955 nt0.8□□□□□ -2.28
REX3Q12090 CUL3YGR003W 2235 nt0.8□□□□□ -2.28
REX3Q12090 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.79□□□□□ -2.28
REX3Q12090 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.79□□□□□ -2.28
REX3Q12090 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.79□□□□□ -2.28
REX3Q12090 snR51snR51 107 nt0.79□□□□□ -2.28
REX3Q12090 RAD34YDR314C 2079 nt0.79□□□□□ -2.28
REX3Q12090 YGR042WYGR042W 816 nt0.78□□□□□ -2.28
REX3Q12090 INA22YIR024C 651 nt0.78□□□□□ -2.28
REX3Q12090 YNL058CYNL058C 951 nt0.78□□□□□ -2.28
REX3Q12090 SWF1YDR126W 1011 nt0.77□□□□□ -2.29
REX3Q12090 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.76□□□□□ -2.29
REX3Q12090 INP2YMR163C 2118 nt0.76□□□□□ -2.29
REX3Q12090 OST1YJL002C 1431 nt0.75□□□□□ -2.29
REX3Q12090 snR72snR72 98 nt0.75□□□□□ -2.29
REX3Q12090 SDH7YDR511W 402 nt0.75□□□□□ -2.29
REX3Q12090 LTE1YAL024C 4308 nt0.75□□□□□ -2.29
REX3Q12090 YMR160WYMR160W 2451 nt0.75□□□□□ -2.29
REX3Q12090 FYV7YLR068W 456 nt0.74□□□□□ -2.29
REX3Q12090 SEC1YDR164C 2175 nt0.74□□□□□ -2.29
REX3Q12090 PRP16YKR086W 3216 nt0.73□□□□□ -2.29
REX3Q12090 PAU12YGR294W 363 nt0.73□□□□□ -2.29
REX3Q12090 YKL083WYKL083W 615 nt0.73□□□□□ -2.29
REX3Q12090 YLR101CYLR101C 396 nt0.73□□□□□ -2.29
REX3Q12090 YAR047CYAR047C 321 nt0.72□□□□□ -2.29
REX3Q12090 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.72□□□□□ -2.29
REX3Q12090 PTP2YOR208W 2253 nt0.71□□□□□ -2.3
REX3Q12090 CBS1YDL069C 690 nt0.71□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.71□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.71□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.9 ms