Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YPL261CYPL261C 309 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 SLX4YLR135W 2247 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 SEC5YDR166C 2916 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YLL054CYLL054C 2532 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 PIK1YNL267W 3201 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 ALY2YJL084C 3141 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 RSM22YKL155C 1887 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 UPS1YLR193C 528 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 SWI4YER111C 3282 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YLR422WYLR422W 5799 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 AZF1YOR113W 2745 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 PBY1YBR094W 2262 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 RPL38YLR325C 237 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 RRT1YBL048W 312 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YDR157WYDR157W 402 nt1.34□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.34□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YNL058CYNL058C 951 nt1.34□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YOR121CYOR121C 306 nt1.34□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.34□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.33□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 SDH2YLL041C 801 nt1.33□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 SPC98YNL126W 2541 nt1.33□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 ZIP2YGL249W 2115 nt1.33□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 AHC1YOR023C 1701 nt1.32□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 YDL211CYDL211C 1119 nt1.32□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 ATG31YDR022C 591 nt1.32□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 YHL041WYHL041W 450 nt1.32□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 snR51snR51 107 nt1.32□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 ROM2YLR371W 4071 nt1.32□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 YGR130CYGR130C 2451 nt1.31□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 RRT15YLR162W-A 189 nt1.31□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 YOL160WYOL160W 342 nt1.31□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 SCW11YGL028C 1629 nt1.3□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 INP2YMR163C 2118 nt1.3□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 MAD1YGL086W 2250 nt1.3□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 SPT21YMR179W 2277 nt1.3□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 NPC2YDL046W 522 nt1.3□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.3□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.3□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.3□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 YOR199WYOR199W 330 nt1.3□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 RPB10YOR210W 213 nt1.3□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.3□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 NST1YNL091W 3723 nt1.29□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 PMD1YER132C 5262 nt1.29□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 CDC36YDL165W 576 nt1.29□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 YJL135WYJL135W 318 nt1.29□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.29□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 PIP2YOR363C 2991 nt1.29□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 SEC3YER008C 4011 nt1.29□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 PAC1YOR269W 1485 nt1.29□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 YJR003CYJR003C 1560 nt1.29□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 NUP145YGL092W 3954 nt1.28□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 APL3YBL037W 3078 nt1.28□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 snR14snR14 160 nt1.28□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 SLI15YBR156C 2097 nt1.28□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 MPT5YGL178W 2580 nt1.28□□□□□ -2.2
VPS54Q12071 RAD9YDR217C 3930 nt1.28□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.27□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.27□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 IRC23YOR044W 474 nt1.27□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 YBR012CYBR012C 420 nt1.27□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 YPR063CYPR063C 423 nt1.27□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 NUP188YML103C 4968 nt1.27□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 NIP100YPL174C 2607 nt1.27□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 RIM20YOR275C 1986 nt1.27□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 snR72snR72 98 nt1.26□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 RPS20YHL015W 366 nt1.26□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 YLL020CYLL020C 306 nt1.26□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 RPL33BYOR234C 324 nt1.26□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 RAD34YDR314C 2079 nt1.25□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 IML1YJR138W 4755 nt1.25□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 YIR044CYIR044C 186 nt1.25□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 LCD1YDR499W 2244 nt1.25□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 PAN2YGL094C 3348 nt1.24□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 TTI1YKL033W 3117 nt1.24□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.24□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.24□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 AIM44YPL158C 2277 nt1.24□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 CDC39YCR093W 6327 nt1.24□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 MMS4YBR098W 2076 nt1.24□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 IFH1YLR223C 3258 nt1.23□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 YPR012WYPR012W 255 nt1.23□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 EAF1YDR359C 2949 nt1.22□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 YGR035CYGR035C 351 nt1.22□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 COG4YPR105C 2586 nt1.22□□□□□ -2.21
VPS54Q12071 STB6YKL072W 2301 nt1.21□□□□□ -2.22
VPS54Q12071 SET3YKR029C 2256 nt1.21□□□□□ -2.22
VPS54Q12071 SIP4YJL089W 2490 nt1.21□□□□□ -2.22
VPS54Q12071 PCC1YKR095W-A 267 nt1.2□□□□□ -2.22
VPS54Q12071 PDE2YOR360C 1581 nt1.19□□□□□ -2.22
VPS54Q12071 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.19□□□□□ -2.22
VPS54Q12071 SPO75YLL005C 2607 nt1.19□□□□□ -2.22
VPS54Q12071 NUP157YER105C 4176 nt1.18□□□□□ -2.22
VPS54Q12071 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.18□□□□□ -2.22
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