Protein–RNA interactions for Protein: Q06336

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, yeastyeast

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GGA1Q06336 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.55□□□□□ -2.32
GGA1Q06336 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.55□□□□□ -2.32
GGA1Q06336 SVS1YPL163C 783 nt0.55□□□□□ -2.32
GGA1Q06336 YPR153WYPR153W 423 nt0.55□□□□□ -2.32
GGA1Q06336 YLL007CYLL007C 1998 nt0.54□□□□□ -2.32
GGA1Q06336 YDR269CYDR269C 324 nt0.54□□□□□ -2.32
GGA1Q06336 YGR042WYGR042W 816 nt0.54□□□□□ -2.32
GGA1Q06336 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.54□□□□□ -2.32
GGA1Q06336 RPL38YLR325C 237 nt0.54□□□□□ -2.32
GGA1Q06336 BER1YLR412W 825 nt0.54□□□□□ -2.32
GGA1Q06336 UTP20YBL004W 7482 nt0.54□□□□□ -2.32
GGA1Q06336 PRE4YFR050C 801 nt0.53□□□□□ -2.32
GGA1Q06336 YKL044WYKL044W 321 nt0.53□□□□□ -2.32
GGA1Q06336 EFR3YMR212C 2349 nt0.53□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 HUR1YGL168W 333 nt0.52□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 ECM12YHR021W-A 456 nt0.52□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 APQ13YJL075C 417 nt0.52□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 RPS27AYKL156W 249 nt0.52□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 RCN2YOR220W 798 nt0.52□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 ZIP2YGL249W 2115 nt0.52□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 YGL239CYGL239C 315 nt0.51□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 FMP27YLR454W 7887 nt0.51□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 YMR160WYMR160W 2451 nt0.5□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 YDL016CYDL016C 303 nt0.5□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 ISD11YER048W-A 285 nt0.5□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 GPG1YGL121C 381 nt0.5□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 TSC3YBR058C-A 243 nt0.5□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 BFR2YDR299W 1605 nt0.49□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 YJR003CYJR003C 1560 nt0.49□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 RPL9AYGL147C 576 nt0.48□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 YGR025WYGR025W 303 nt0.48□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 PHS1YJL097W 654 nt0.48□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.48□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 snR13snR13 124 nt0.48□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 RPB10YOR210W 213 nt0.48□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 YSP1YHR155W 3687 nt0.47□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 INA22YIR024C 651 nt0.47□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 YJR141WYJR141W 1044 nt0.47□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 YOR282WYOR282W 321 nt0.47□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 OST1YJL002C 1431 nt0.47□□□□□ -2.33
GGA1Q06336 PKH2YOL100W 3246 nt0.46□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 YDR029WYDR029W 315 nt0.46□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.46□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 YHL042WYHL042W 453 nt0.45□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 URM1YIL008W 300 nt0.45□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 LOA1YPR139C 903 nt0.45□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 SNU56YDR240C 1479 nt0.45□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 PAC1YOR269W 1485 nt0.45□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 PAN2YGL094C 3348 nt0.45□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 UBX4YMR067C 1251 nt0.44□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.44□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.44□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 CDC33YOL139C 642 nt0.43□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 YPL182CYPL182C 384 nt0.43□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 ULP2YIL031W 3105 nt0.42□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.42□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.42□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.42□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 YNL319WYNL319W 441 nt0.42□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.42□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 CHS6YJL099W 2241 nt0.41□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 BIR1YJR089W 2865 nt0.41□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 PMP1YCR024C-A 123 nt0.41□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 YJL135WYJL135W 318 nt0.41□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 NPR2YEL062W 1848 nt0.41□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 NOP9YJL010C 2001 nt0.4□□□□□ -2.34
GGA1Q06336 YDR344CYDR344C 444 nt0.4□□□□□ -2.35
GGA1Q06336 YOR029WYOR029W 336 nt0.4□□□□□ -2.35
GGA1Q06336 YOR218CYOR218C 420 nt0.39□□□□□ -2.35
GGA1Q06336 TIM13YGR181W 318 nt0.38□□□□□ -2.35
GGA1Q06336 YKL202WYKL202W 582 nt0.38□□□□□ -2.35
GGA1Q06336 BIG1YHR101C 1008 nt0.37□□□□□ -2.35
GGA1Q06336 ABF2YMR072W 552 nt0.37□□□□□ -2.35
GGA1Q06336 YFL012WYFL012W 447 nt0.36□□□□□ -2.35
GGA1Q06336 RPS24BYIL069C 408 nt0.36□□□□□ -2.35
GGA1Q06336 GPI15YNL038W 690 nt0.36□□□□□ -2.35
GGA1Q06336 CUL3YGR003W 2235 nt0.36□□□□□ -2.35
GGA1Q06336 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.35□□□□□ -2.35
GGA1Q06336 RPL26AYLR344W 384 nt0.35□□□□□ -2.35
GGA1Q06336 STE5YDR103W 2754 nt0.35□□□□□ -2.35
GGA1Q06336 YCK3YER123W 1575 nt0.35□□□□□ -2.35
GGA1Q06336 YCR001WYCR001W 315 nt0.34□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 RPL26BYGR034W 384 nt0.34□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 YKL123WYKL123W 381 nt0.34□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 UBC7YMR022W 498 nt0.34□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 YOL160WYOL160W 342 nt0.34□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 RPS30BYOR182C 192 nt0.34□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.34□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 snR72snR72 98 nt0.33□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 STF2YGR008C 255 nt0.33□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 YLR269CYLR269C 351 nt0.33□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 YPL044CYPL044C 549 nt0.33□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.32□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 ASE1YOR058C 2658 nt0.31□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 WIP1YDR374W-A 270 nt0.31□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 RPF1YHR088W 888 nt0.31□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 NFU1YKL040C 771 nt0.31□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.31□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 YBR064WYBR064W 429 nt0.31□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 YPL261CYPL261C 309 nt0.31□□□□□ -2.36
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