Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 YOR170WYOR170W 306 nt2.42□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.42□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 SPO21YOL091W 1830 nt2.41□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 YIL174WYIL174W 228 nt2.41□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.41□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 SAP185YJL098W 3177 nt2.41□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 NOP14YDL148C 2433 nt2.4□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 PHO91YNR013C 2685 nt2.4□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 YJL120WYJL120W 324 nt2.4□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 NAM7YMR080C 2916 nt2.4□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 BCK1YJL095W 4437 nt2.4□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 CAT2YML042W 2013 nt2.39□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 RAV1YJR033C 4074 nt2.39□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 RPL34BYIL052C 366 nt2.39□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 SMC6YLR383W 3345 nt2.39□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 YPL216WYPL216W 3309 nt2.39□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 UBP1YDL122W 2430 nt2.39□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 SLN1YIL147C 3663 nt2.38□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 YBR174CYBR174C 315 nt2.38□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 MSC6YOR354C 2079 nt2.38□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 RLM1YPL089C 2031 nt2.37□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.37□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.37□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.37□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 RAD34YDR314C 2079 nt2.37□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 TFC8YPL007C 1767 nt2.36□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 ECM12YHR021W-A 456 nt2.36□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 ATP7YKL016C 525 nt2.36□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 RPS25BYLR333C 327 nt2.36□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 YNL170WYNL170W 396 nt2.36□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 GIP3YPL137C 3831 nt2.36□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 AXL1YPR122W 3627 nt2.36□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 ZIP1YDR285W 2628 nt2.36□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 SAC3YDR159W 3906 nt2.36□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 MCM10YIL150C 1716 nt2.35□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 BNI1YNL271C 5862 nt2.35□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 ZIP2YGL249W 2115 nt2.35□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 RTT107YHR154W 3213 nt2.34□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 TRL1YJL087C 2484 nt2.34□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 MSH5YDL154W 2706 nt2.34□□□□□ -2.03
SRP1Q02821 NOC3YLR002C 1992 nt2.34□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 YDR341CYDR341C 1824 nt2.33□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 APL2YKL135C 2181 nt2.33□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 RTT101YJL047C 2529 nt2.33□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 IRA2YOL081W 9240 nt2.32□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 CHC1YGL206C 4962 nt2.32□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 MAD1YGL086W 2250 nt2.32□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 ULI1YFR026C 510 nt2.32□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 BRP1YGL007W 378 nt2.32□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.32□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.32□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 SAS3YBL052C 2496 nt2.32□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 NUP170YBL079W 4509 nt2.32□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 BUD2YKL092C 3315 nt2.31□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 RPL31AYDL075W 342 nt2.31□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 SYH1YPL105C 2550 nt2.31□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 ATG9YDL149W 2994 nt2.31□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.3□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 COF1YLL050C 432 nt2.3□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 snR52snR52 92 nt2.3□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 MAK10YEL053C 2202 nt2.3□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 MLH1YMR167W 2310 nt2.3□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 DCP2YNL118C 2913 nt2.29□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 LRE1YCL051W 1752 nt2.29□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 SDH6YDR379C-A 240 nt2.29□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.29□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 PAU3YCR104W 375 nt2.28□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 RPL37BYDR500C 267 nt2.28□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.28□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 YOR345CYOR345C 351 nt2.28□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 SEC26YDR238C 2922 nt2.28□□□□□ -2.04
SRP1Q02821 ELG1YOR144C 2376 nt2.28□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 PDR11YIL013C 4236 nt2.27□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 CDC60YPL160W 3273 nt2.27□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 MLH3YPL164C 2148 nt2.27□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 IRC8YJL051W 2469 nt2.27□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 YFR016CYFR016C 3702 nt2.26□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 STH1YIL126W 4080 nt2.26□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 VTC1YER072W 390 nt2.26□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.26□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 PIG1YLR273C 1947 nt2.26□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 SPF1YEL031W 3648 nt2.26□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 PDR8YLR266C 2106 nt2.26□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 YIR044CYIR044C 186 nt2.25□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 APL5YPL195W 2799 nt2.24□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.24□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 RPL33BYOR234C 324 nt2.24□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 PMP1YCR024C-A 123 nt2.23□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 YDL196WYDL196W 330 nt2.23□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.23□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 AGC1YPR021C 2709 nt2.23□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 HIR3YJR140C 4947 nt2.22□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 SSD1YDR293C 3753 nt2.22□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 YLL007CYLL007C 1998 nt2.22□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 MGA2YIR033W 3342 nt2.22□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 Q0143Q0143 153 nt2.22□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 TMA7YLR262C-A 195 nt2.22□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 DGR2YKL121W 2559 nt2.22□□□□□ -2.05
SRP1Q02821 CTR9YOL145C 3234 nt2.21□□□□□ -2.06
SRP1Q02821 HSL1YKL101W 4557 nt2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 71.6 ms