Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms