Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 RPB10YOR210W 213 nt1.64□□□□□ -2.15
HEF3P53978 RIM20YOR275C 1986 nt1.64□□□□□ -2.15
HEF3P53978 YLL032CYLL032C 2478 nt1.64□□□□□ -2.15
HEF3P53978 MLH3YPL164C 2148 nt1.64□□□□□ -2.15
HEF3P53978 KCS1YDR017C 3153 nt1.63□□□□□ -2.15
HEF3P53978 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.63□□□□□ -2.15
HEF3P53978 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.63□□□□□ -2.15
HEF3P53978 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.62□□□□□ -2.15
HEF3P53978 MVP1YMR004W 1536 nt1.61□□□□□ -2.15
HEF3P53978 HTB2YBL002W 396 nt1.61□□□□□ -2.15
HEF3P53978 CDC25YLR310C 4770 nt1.61□□□□□ -2.15
HEF3P53978 YLR419WYLR419W 4308 nt1.61□□□□□ -2.15
HEF3P53978 SPC98YNL126W 2541 nt1.61□□□□□ -2.15
HEF3P53978 SAS3YBL052C 2496 nt1.6□□□□□ -2.15
HEF3P53978 INP2YMR163C 2118 nt1.6□□□□□ -2.15
HEF3P53978 NHP2YDL208W 471 nt1.6□□□□□ -2.15
HEF3P53978 YDR426CYDR426C 378 nt1.6□□□□□ -2.15
HEF3P53978 PCC1YKR095W-A 267 nt1.6□□□□□ -2.15
HEF3P53978 snR36snR36 182 nt1.6□□□□□ -2.15
HEF3P53978 YOR019WYOR019W 2193 nt1.59□□□□□ -2.15
HEF3P53978 DGR2YKL121W 2559 nt1.59□□□□□ -2.15
HEF3P53978 PET127YOR017W 2403 nt1.59□□□□□ -2.15
HEF3P53978 IML1YJR138W 4755 nt1.59□□□□□ -2.15
HEF3P53978 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.59□□□□□ -2.15
HEF3P53978 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.59□□□□□ -2.15
HEF3P53978 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.59□□□□□ -2.15
HEF3P53978 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.59□□□□□ -2.15
HEF3P53978 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.59□□□□□ -2.15
HEF3P53978 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.59□□□□□ -2.15
HEF3P53978 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.59□□□□□ -2.15
HEF3P53978 YJL135WYJL135W 318 nt1.59□□□□□ -2.15
HEF3P53978 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.59□□□□□ -2.15
HEF3P53978 SPO24YPR036W-A 204 nt1.59□□□□□ -2.15
HEF3P53978 SXM1YDR395W 2835 nt1.59□□□□□ -2.16
HEF3P53978 snR72snR72 98 nt1.58□□□□□ -2.16
HEF3P53978 RPL31AYDL075W 342 nt1.58□□□□□ -2.16
HEF3P53978 YDR413CYDR413C 576 nt1.58□□□□□ -2.16
HEF3P53978 TAR1YLR154W-C 375 nt1.58□□□□□ -2.16
HEF3P53978 YSY6YBR162W-A 198 nt1.58□□□□□ -2.16
HEF3P53978 MON2YNL297C 4911 nt1.58□□□□□ -2.16
HEF3P53978 YPR117WYPR117W 7470 nt1.57□□□□□ -2.16
HEF3P53978 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.57□□□□□ -2.16
HEF3P53978 YFL032WYFL032W 321 nt1.57□□□□□ -2.16
HEF3P53978 YOR199WYOR199W 330 nt1.57□□□□□ -2.16
HEF3P53978 PIG1YLR273C 1947 nt1.56□□□□□ -2.16
HEF3P53978 NPC2YDL046W 522 nt1.56□□□□□ -2.16
HEF3P53978 YDR048CYDR048C 315 nt1.56□□□□□ -2.16
HEF3P53978 PAU2YEL049W 363 nt1.56□□□□□ -2.16
HEF3P53978 YER097WYER097W 330 nt1.56□□□□□ -2.16
HEF3P53978 YNL146WYNL146W 303 nt1.56□□□□□ -2.16
HEF3P53978 SKI3YPR189W 4299 nt1.55□□□□□ -2.16
HEF3P53978 AHC1YOR023C 1701 nt1.55□□□□□ -2.16
HEF3P53978 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.55□□□□□ -2.16
HEF3P53978 TTI1YKL033W 3117 nt1.55□□□□□ -2.16
HEF3P53978 MDS3YGL197W 4464 nt1.55□□□□□ -2.16
HEF3P53978 ENV11YGR071C 2583 nt1.55□□□□□ -2.16
HEF3P53978 ZIP2YGL249W 2115 nt1.54□□□□□ -2.16
HEF3P53978 APL2YKL135C 2181 nt1.54□□□□□ -2.16
HEF3P53978 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.54□□□□□ -2.16
HEF3P53978 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.54□□□□□ -2.16
HEF3P53978 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.54□□□□□ -2.16
HEF3P53978 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.54□□□□□ -2.16
HEF3P53978 PIK1YNL267W 3201 nt1.54□□□□□ -2.16
HEF3P53978 SPC110YDR356W 2835 nt1.53□□□□□ -2.16
HEF3P53978 YAR029WYAR029W 225 nt1.53□□□□□ -2.16
HEF3P53978 SDH2YLL041C 801 nt1.52□□□□□ -2.17
HEF3P53978 YOL160WYOL160W 342 nt1.52□□□□□ -2.17
HEF3P53978 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.52□□□□□ -2.17
HEF3P53978 FYV8YGR196C 2454 nt1.52□□□□□ -2.17
HEF3P53978 POL5YEL055C 3069 nt1.52□□□□□ -2.17
HEF3P53978 MAM33YIL070C 801 nt1.51□□□□□ -2.17
HEF3P53978 RPL39YJL189W 156 nt1.51□□□□□ -2.17
HEF3P53978 RPL33BYOR234C 324 nt1.51□□□□□ -2.17
HEF3P53978 SEC5YDR166C 2916 nt1.5□□□□□ -2.17
HEF3P53978 MAD1YGL086W 2250 nt1.5□□□□□ -2.17
HEF3P53978 YFL063WYFL063W 456 nt1.5□□□□□ -2.17
HEF3P53978 EMC5YIL027C 426 nt1.5□□□□□ -2.17
HEF3P53978 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.5□□□□□ -2.17
HEF3P53978 STE5YDR103W 2754 nt1.49□□□□□ -2.17
HEF3P53978 RAD50YNL250W 3939 nt1.49□□□□□ -2.17
HEF3P53978 YJL022WYJL022W 309 nt1.49□□□□□ -2.17
HEF3P53978 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.49□□□□□ -2.17
HEF3P53978 NOC3YLR002C 1992 nt1.48□□□□□ -2.17
HEF3P53978 YAR009CYAR009C 3591 nt1.48□□□□□ -2.17
HEF3P53978 YGL149WYGL149W 306 nt1.48□□□□□ -2.17
HEF3P53978 DBP6YNR038W 1890 nt1.48□□□□□ -2.17
HEF3P53978 COG4YPR105C 2586 nt1.48□□□□□ -2.17
HEF3P53978 SMC4YLR086W 4257 nt1.47□□□□□ -2.17
HEF3P53978 HTL1YCR020W-B 237 nt1.47□□□□□ -2.17
HEF3P53978 COF1YLL050C 432 nt1.47□□□□□ -2.17
HEF3P53978 UFD2YDL190C 2886 nt1.47□□□□□ -2.17
HEF3P53978 BST1YFL025C 3090 nt1.47□□□□□ -2.17
HEF3P53978 BEM2YER155C 6504 nt1.47□□□□□ -2.17
HEF3P53978 RAD34YDR314C 2079 nt1.46□□□□□ -2.18
HEF3P53978 NIP100YPL174C 2607 nt1.46□□□□□ -2.18
HEF3P53978 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.46□□□□□ -2.18
HEF3P53978 ALK1YGL021W 2283 nt1.45□□□□□ -2.18
HEF3P53978 SCW11YGL028C 1629 nt1.45□□□□□ -2.18
HEF3P53978 YCS4YLR272C 3531 nt1.45□□□□□ -2.18
HEF3P53978 YGL217CYGL217C 342 nt1.45□□□□□ -2.18
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