Protein–RNA interactions for Protein: P53438

SOK2, Protein SOK2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK2P53438 CAT2YML042W 2013 nt2.65□□□□□ -1.99
SOK2P53438 SAP1YER047C 2694 nt2.65□□□□□ -1.99
SOK2P53438 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt2.65□□□□□ -1.99
SOK2P53438 SWR1YDR334W 4545 nt2.65□□□□□ -1.99
SOK2P53438 INP51YIL002C 2841 nt2.64□□□□□ -1.99
SOK2P53438 SAS3YBL052C 2496 nt2.64□□□□□ -1.99
SOK2P53438 HSH155YMR288W 2916 nt2.64□□□□□ -1.99
SOK2P53438 CBF2YGR140W 2871 nt2.64□□□□□ -1.99
SOK2P53438 SBE22YHR103W 2559 nt2.63□□□□□ -1.99
SOK2P53438 IFH1YLR223C 3258 nt2.63□□□□□ -1.99
SOK2P53438 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.63□□□□□ -1.99
SOK2P53438 YIL174WYIL174W 228 nt2.63□□□□□ -1.99
SOK2P53438 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.63□□□□□ -1.99
SOK2P53438 RPL33AYPL143W 324 nt2.63□□□□□ -1.99
SOK2P53438 YBT1YLL048C 4986 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK2P53438 ECM29YHL030W 5607 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK2P53438 KTI11YBL071W-A 249 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK2P53438 RPS30BYOR182C 192 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK2P53438 YPL216WYPL216W 3309 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK2P53438 YGR067CYGR067C 2415 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK2P53438 PTP2YOR208W 2253 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK2P53438 DYN1YKR054C 12279 nt2.61□□□□□ -1.99
SOK2P53438 NMD2YHR077C 3270 nt2.61□□□□□ -1.99
SOK2P53438 SOM1YEL059C-A 225 nt2.61□□□□□ -1.99
SOK2P53438 RPS22AYJL190C 393 nt2.61□□□□□ -1.99
SOK2P53438 ESL2YKR096W 3588 nt2.61□□□□□ -1.99
SOK2P53438 ZIP1YDR285W 2628 nt2.6□□□□□ -1.99
SOK2P53438 LCL1YPL056C 306 nt2.6□□□□□ -1.99
SOK2P53438 YPR203WYPR203W 309 nt2.6□□□□□ -1.99
SOK2P53438 PRP8YHR165C 7242 nt2.6□□□□□ -1.99
SOK2P53438 NOP14YDL148C 2433 nt2.6□□□□□ -1.99
SOK2P53438 APL2YKL135C 2181 nt2.6□□□□□ -1.99
SOK2P53438 JSN1YJR091C 3276 nt2.6□□□□□ -1.99
SOK2P53438 MMS1YPR164W 4224 nt2.59□□□□□ -1.99
SOK2P53438 MSB2YGR014W 3921 nt2.59□□□□□ -1.99
SOK2P53438 YIL169CYIL169C 2988 nt2.58□□□□□ -2
SOK2P53438 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.58□□□□□ -2
SOK2P53438 YDL118WYDL118W 381 nt2.58□□□□□ -2
SOK2P53438 COX12YLR038C 252 nt2.58□□□□□ -2
SOK2P53438 YOR019WYOR019W 2193 nt2.58□□□□□ -2
SOK2P53438 HOS4YIL112W 3252 nt2.58□□□□□ -2
SOK2P53438 TUS1YLR425W 3924 nt2.58□□□□□ -2
SOK2P53438 SEC7YDR170C 6030 nt2.58□□□□□ -2
SOK2P53438 VPS8YAL002W 3825 nt2.57□□□□□ -2
SOK2P53438 YDR209CYDR209C 414 nt2.57□□□□□ -2
SOK2P53438 STF2YGR008C 255 nt2.57□□□□□ -2
SOK2P53438 TCB2YNL087W 3537 nt2.57□□□□□ -2
SOK2P53438 DGR2YKL121W 2559 nt2.56□□□□□ -2
SOK2P53438 DCP2YNL118C 2913 nt2.56□□□□□ -2
SOK2P53438 BUB1YGR188C 3066 nt2.56□□□□□ -2
SOK2P53438 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.55□□□□□ -2
SOK2P53438 MET6YER091C 2304 nt2.55□□□□□ -2
SOK2P53438 PHO91YNR013C 2685 nt2.55□□□□□ -2
SOK2P53438 CYR1YJL005W 6081 nt2.55□□□□□ -2
SOK2P53438 PRP5YBR237W 2550 nt2.55□□□□□ -2
SOK2P53438 CHS6YJL099W 2241 nt2.53□□□□□ -2
SOK2P53438 YDR521WYDR521W 336 nt2.53□□□□□ -2
SOK2P53438 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.53□□□□□ -2
SOK2P53438 SRO77YBL106C 3033 nt2.53□□□□□ -2
SOK2P53438 FLO11YIR019C 4104 nt2.53□□□□□ -2
SOK2P53438 ILS1YBL076C 3219 nt2.53□□□□□ -2.01
SOK2P53438 CAF120YNL278W 3183 nt2.53□□□□□ -2.01
SOK2P53438 ESC1YMR219W 4977 nt2.52□□□□□ -2.01
SOK2P53438 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.52□□□□□ -2.01
SOK2P53438 TTI1YKL033W 3117 nt2.52□□□□□ -2.01
SOK2P53438 SLH1YGR271W 5904 nt2.52□□□□□ -2.01
SOK2P53438 ALK1YGL021W 2283 nt2.51□□□□□ -2.01
SOK2P53438 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.51□□□□□ -2.01
SOK2P53438 AMS1YGL156W 3252 nt2.51□□□□□ -2.01
SOK2P53438 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.5□□□□□ -2.01
SOK2P53438 MAK10YEL053C 2202 nt2.5□□□□□ -2.01
SOK2P53438 MRD1YPR112C 2664 nt2.5□□□□□ -2.01
SOK2P53438 YNL144CYNL144C 2223 nt2.49□□□□□ -2.01
SOK2P53438 MET18YIL128W 3099 nt2.49□□□□□ -2.01
SOK2P53438 SAP185YJL098W 3177 nt2.49□□□□□ -2.01
SOK2P53438 SAP190YKR028W 3102 nt2.49□□□□□ -2.01
SOK2P53438 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt2.48□□□□□ -2.01
SOK2P53438 MSH5YDL154W 2706 nt2.48□□□□□ -2.01
SOK2P53438 SMC6YLR383W 3345 nt2.47□□□□□ -2.01
SOK2P53438 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.47□□□□□ -2.01
SOK2P53438 DNA2YHR164C 4569 nt2.47□□□□□ -2.01
SOK2P53438 MLH3YPL164C 2148 nt2.47□□□□□ -2.01
SOK2P53438 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.46□□□□□ -2.02
SOK2P53438 STE11YLR362W 2154 nt2.46□□□□□ -2.02
SOK2P53438 YLL054CYLL054C 2532 nt2.45□□□□□ -2.02
SOK2P53438 YNL018CYNL018C 1839 nt2.45□□□□□ -2.02
SOK2P53438 NEW1YPL226W 3591 nt2.45□□□□□ -2.02
SOK2P53438 YGL182CYGL182C 324 nt2.45□□□□□ -2.02
SOK2P53438 RSE1YML049C 4086 nt2.45□□□□□ -2.02
SOK2P53438 IRC8YJL051W 2469 nt2.45□□□□□ -2.02
SOK2P53438 TRS130YMR218C 3309 nt2.44□□□□□ -2.02
SOK2P53438 YPP1YGR198W 2454 nt2.44□□□□□ -2.02
SOK2P53438 APL1YJR005W 2103 nt2.44□□□□□ -2.02
SOK2P53438 AXL1YPR122W 3627 nt2.43□□□□□ -2.02
SOK2P53438 SCP160YJL080C 3669 nt2.43□□□□□ -2.02
SOK2P53438 HMI1YOL095C 2121 nt2.42□□□□□ -2.02
SOK2P53438 snR45snR45 172 nt2.42□□□□□ -2.02
SOK2P53438 BCK1YJL095W 4437 nt2.42□□□□□ -2.02
SOK2P53438 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.41□□□□□ -2.02
SOK2P53438 BUD2YKL092C 3315 nt2.4□□□□□ -2.02
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