Protein–RNA interactions for Protein: P53104

ATG1, Serine/threonine-protein kinase ATG1, yeastyeast

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Length 897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG1P53104 NUM1YDR150W 8247 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG1P53104 LRE1YCL051W 1752 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG1P53104 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG1P53104 PSD2YGR170W 3417 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG1P53104 ZIP2YGL249W 2115 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG1P53104 RLM1YPL089C 2031 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG1P53104 SAS3YBL052C 2496 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG1P53104 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG1P53104 RPS25BYLR333C 327 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG1P53104 RPS17AYML024W 411 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG1P53104 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG1P53104 ACM1YPL267W 630 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG1P53104 YBR174CYBR174C 315 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG1P53104 SPO21YOL091W 1830 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG1P53104 YDR239CYDR239C 2364 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG1P53104 SRO77YBL106C 3033 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG1P53104 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG1P53104 APL5YPL195W 2799 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG1P53104 BCK1YJL095W 4437 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG1P53104 MAK10YEL053C 2202 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG1P53104 RAD34YDR314C 2079 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG1P53104 Q0143Q0143 153 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG1P53104 YJL120WYJL120W 324 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG1P53104 LCL1YPL056C 306 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG1P53104 HSH155YMR288W 2916 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG1P53104 YFR016CYFR016C 3702 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG1P53104 ATP7YKL016C 525 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG1P53104 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG1P53104 NAM7YMR080C 2916 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG1P53104 ATG11YPR049C 3537 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG1P53104 UBP15YMR304W 3693 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG1P53104 YGR164WYGR164W 336 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG1P53104 COF1YLL050C 432 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG1P53104 YDR341CYDR341C 1824 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG1P53104 TRL1YJL087C 2484 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG1P53104 ENV11YGR071C 2583 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG1P53104 CAT2YML042W 2013 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG1P53104 SEC26YDR238C 2922 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG1P53104 NOC3YLR002C 1992 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG1P53104 MAD1YGL086W 2250 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG1P53104 GIP3YPL137C 3831 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG1P53104 CDC60YPL160W 3273 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG1P53104 BRP1YGL007W 378 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG1P53104 APL2YKL135C 2181 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG1P53104 RAV1YJR033C 4074 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG1P53104 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG1P53104 MLH3YPL164C 2148 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG1P53104 PHO91YNR013C 2685 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG1P53104 YLL007CYLL007C 1998 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG1P53104 YIR044CYIR044C 186 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG1P53104 RPL33BYOR234C 324 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG1P53104 ESC1YMR219W 4977 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG1P53104 ARP8YOR141C 2646 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG1P53104 MSH5YDL154W 2706 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG1P53104 PDR1YGL013C 3207 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG1P53104 RPL31AYDL075W 342 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG1P53104 YEL073CYEL073C 324 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG1P53104 YOR345CYOR345C 351 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG1P53104 SYH1YPL105C 2550 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG1P53104 ESL2YKR096W 3588 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG1P53104 PET309YLR067C 2898 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG1P53104 RTT107YHR154W 3213 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG1P53104 TIM9YEL020W-A 264 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG1P53104 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG1P53104 SIR3YLR442C 2937 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG1P53104 NCA2YPR155C 1851 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG1P53104 YHR210CYHR210C 1026 nt2.66□□□□□ -1.98
ATG1P53104 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.66□□□□□ -1.98
ATG1P53104 CUL3YGR003W 2235 nt2.65□□□□□ -1.98
ATG1P53104 PTP2YOR208W 2253 nt2.65□□□□□ -1.99
ATG1P53104 RPL37BYDR500C 267 nt2.65□□□□□ -1.99
ATG1P53104 DGR2YKL121W 2559 nt2.65□□□□□ -1.99
ATG1P53104 CHC1YGL206C 4962 nt2.65□□□□□ -1.99
ATG1P53104 HMI1YOL095C 2121 nt2.65□□□□□ -1.99
ATG1P53104 CTR9YOL145C 3234 nt2.64□□□□□ -1.99
ATG1P53104 PAU3YCR104W 375 nt2.64□□□□□ -1.99
ATG1P53104 YOR055WYOR055W 435 nt2.64□□□□□ -1.99
ATG1P53104 STH1YIL126W 4080 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG1P53104 BUD2YKL092C 3315 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG1P53104 YDL196WYDL196W 330 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG1P53104 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG1P53104 AGC1YPR021C 2709 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG1P53104 RTT101YJL047C 2529 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG1P53104 PIP2YOR363C 2991 nt2.62□□□□□ -1.99
ATG1P53104 AIM44YPL158C 2277 nt2.62□□□□□ -1.99
ATG1P53104 PMP1YCR024C-A 123 nt2.62□□□□□ -1.99
ATG1P53104 PIG1YLR273C 1947 nt2.62□□□□□ -1.99
ATG1P53104 FIG4YNL325C 2640 nt2.61□□□□□ -1.99
ATG1P53104 IRE1YHR079C 3348 nt2.61□□□□□ -1.99
ATG1P53104 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.6□□□□□ -1.99
ATG1P53104 YNL205CYNL205C 423 nt2.6□□□□□ -1.99
ATG1P53104 AHC1YOR023C 1701 nt2.59□□□□□ -1.99
ATG1P53104 IRA2YOL081W 9240 nt2.59□□□□□ -1.99
ATG1P53104 YPR097WYPR097W 3222 nt2.59□□□□□ -1.99
ATG1P53104 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.59□□□□□ -1.99
ATG1P53104 COY1YKL179C 2040 nt2.58□□□□□ -2
ATG1P53104 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.58□□□□□ -2
ATG1P53104 SSD1YDR293C 3753 nt2.58□□□□□ -2
ATG1P53104 YEF3YLR249W 3135 nt2.57□□□□□ -2
ATG1P53104 ANS1YHR126C 480 nt2.57□□□□□ -2
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