Protein–RNA interactions for Protein: P47076

RPC17, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, yeastyeast

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC17P47076 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RPC17P47076 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RPC17P47076 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RPC17P47076 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RPC17P47076 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RPC17P47076 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RPC17P47076 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RPC17P47076 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RPC17P47076 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RPC17P47076 RRT1YBL048W 312 nt0.71□□□□□ -2.3
RPC17P47076 YOL014WYOL014W 375 nt0.71□□□□□ -2.3
RPC17P47076 ENV11YGR071C 2583 nt0.71□□□□□ -2.3
RPC17P47076 YDL196WYDL196W 330 nt0.7□□□□□ -2.3
RPC17P47076 NBL1YHR199C-A 222 nt0.7□□□□□ -2.3
RPC17P47076 RCN2YOR220W 798 nt0.7□□□□□ -2.3
RPC17P47076 SLI15YBR156C 2097 nt0.69□□□□□ -2.3
RPC17P47076 WAR1YML076C 2835 nt0.69□□□□□ -2.3
RPC17P47076 HUR1YGL168W 333 nt0.69□□□□□ -2.3
RPC17P47076 YGR025WYGR025W 303 nt0.69□□□□□ -2.3
RPC17P47076 UBX4YMR067C 1251 nt0.69□□□□□ -2.3
RPC17P47076 IES4YOR189W 351 nt0.69□□□□□ -2.3
RPC17P47076 snR13snR13 124 nt0.69□□□□□ -2.3
RPC17P47076 ALY2YJL084C 3141 nt0.69□□□□□ -2.3
RPC17P47076 SNU56YDR240C 1479 nt0.68□□□□□ -2.3
RPC17P47076 YDL016CYDL016C 303 nt0.68□□□□□ -2.3
RPC17P47076 NPC2YDL046W 522 nt0.68□□□□□ -2.3
RPC17P47076 OCA6YDR067C 675 nt0.68□□□□□ -2.3
RPC17P47076 MET32YDR253C 576 nt0.68□□□□□ -2.3
RPC17P47076 YDR269CYDR269C 324 nt0.68□□□□□ -2.3
RPC17P47076 YGL239CYGL239C 315 nt0.68□□□□□ -2.3
RPC17P47076 YFL012WYFL012W 447 nt0.67□□□□□ -2.3
RPC17P47076 TSC3YBR058C-A 243 nt0.67□□□□□ -2.3
RPC17P47076 snR78snR78 87 nt0.66□□□□□ -2.3
RPC17P47076 YER135CYER135C 393 nt0.66□□□□□ -2.3
RPC17P47076 ALG13YGL047W 609 nt0.66□□□□□ -2.3
RPC17P47076 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
RPC17P47076 YPR153WYPR153W 423 nt0.66□□□□□ -2.3
RPC17P47076 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.66□□□□□ -2.3
RPC17P47076 SWF1YDR126W 1011 nt0.65□□□□□ -2.31
RPC17P47076 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.65□□□□□ -2.31
RPC17P47076 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.65□□□□□ -2.31
RPC17P47076 EFR3YMR212C 2349 nt0.65□□□□□ -2.31
RPC17P47076 RKR1YMR247C 4689 nt0.65□□□□□ -2.31
RPC17P47076 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.64□□□□□ -2.31
RPC17P47076 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.64□□□□□ -2.31
RPC17P47076 URM1YIL008W 300 nt0.64□□□□□ -2.31
RPC17P47076 DBP6YNR038W 1890 nt0.64□□□□□ -2.31
RPC17P47076 ZIP2YGL249W 2115 nt0.64□□□□□ -2.31
RPC17P47076 GEA2YEL022W 4380 nt0.64□□□□□ -2.31
RPC17P47076 PRP16YKR086W 3216 nt0.63□□□□□ -2.31
RPC17P47076 RPS27AYKL156W 249 nt0.63□□□□□ -2.31
RPC17P47076 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.63□□□□□ -2.31
RPC17P47076 WIP1YDR374W-A 270 nt0.62□□□□□ -2.31
RPC17P47076 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.62□□□□□ -2.31
RPC17P47076 YDR029WYDR029W 315 nt0.61□□□□□ -2.31
RPC17P47076 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.61□□□□□ -2.31
RPC17P47076 YGR042WYGR042W 816 nt0.61□□□□□ -2.31
RPC17P47076 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.6□□□□□ -2.31
RPC17P47076 ISD11YER048W-A 285 nt0.59□□□□□ -2.31
RPC17P47076 GPG1YGL121C 381 nt0.59□□□□□ -2.31
RPC17P47076 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.59□□□□□ -2.31
RPC17P47076 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.59□□□□□ -2.31
RPC17P47076 YKL123WYKL123W 381 nt0.59□□□□□ -2.31
RPC17P47076 YPL182CYPL182C 384 nt0.59□□□□□ -2.31
RPC17P47076 UTP10YJL109C 5310 nt0.59□□□□□ -2.32
RPC17P47076 BIR1YJR089W 2865 nt0.59□□□□□ -2.32
RPC17P47076 RPL9AYGL147C 576 nt0.58□□□□□ -2.32
RPC17P47076 BIG1YHR101C 1008 nt0.58□□□□□ -2.32
RPC17P47076 ECM12YHR021W-A 456 nt0.57□□□□□ -2.32
RPC17P47076 RPB10YOR210W 213 nt0.57□□□□□ -2.32
RPC17P47076 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.56□□□□□ -2.32
RPC17P47076 YMR321CYMR321C 318 nt0.56□□□□□ -2.32
RPC17P47076 GPI15YNL038W 690 nt0.56□□□□□ -2.32
RPC17P47076 ULP2YIL031W 3105 nt0.56□□□□□ -2.32
RPC17P47076 PKH2YOL100W 3246 nt0.55□□□□□ -2.32
RPC17P47076 YCR001WYCR001W 315 nt0.55□□□□□ -2.32
RPC17P47076 YJL135WYJL135W 318 nt0.55□□□□□ -2.32
RPC17P47076 TRS65YGR166W 1683 nt0.55□□□□□ -2.32
RPC17P47076 PAN2YGL094C 3348 nt0.54□□□□□ -2.32
RPC17P47076 YLL007CYLL007C 1998 nt0.54□□□□□ -2.32
RPC17P47076 RPL38YLR325C 237 nt0.54□□□□□ -2.32
RPC17P47076 UBC7YMR022W 498 nt0.54□□□□□ -2.32
RPC17P47076 YOR218CYOR218C 420 nt0.54□□□□□ -2.32
RPC17P47076 YOR282WYOR282W 321 nt0.54□□□□□ -2.32
RPC17P47076 LOA1YPR139C 903 nt0.54□□□□□ -2.32
RPC17P47076 BFR2YDR299W 1605 nt0.53□□□□□ -2.32
RPC17P47076 YML002WYML002W 2214 nt0.53□□□□□ -2.32
RPC17P47076 TIM13YGR181W 318 nt0.53□□□□□ -2.32
RPC17P47076 YKL202WYKL202W 582 nt0.53□□□□□ -2.32
RPC17P47076 YLR269CYLR269C 351 nt0.53□□□□□ -2.32
RPC17P47076 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.53□□□□□ -2.32
RPC17P47076 AI1Q0050 2505 nt0.52□□□□□ -2.33
RPC17P47076 FMP27YLR454W 7887 nt0.51□□□□□ -2.33
RPC17P47076 RPF1YHR088W 888 nt0.51□□□□□ -2.33
RPC17P47076 YHL042WYHL042W 453 nt0.49□□□□□ -2.33
RPC17P47076 EAF6YJR082C 342 nt0.49□□□□□ -2.33
RPC17P47076 PBI2YNL015W 228 nt0.49□□□□□ -2.33
RPC17P47076 YOL160WYOL160W 342 nt0.49□□□□□ -2.33
RPC17P47076 NFU1YKL040C 771 nt0.48□□□□□ -2.33
RPC17P47076 snR72snR72 98 nt0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.3 ms