Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms