Protein–RNA interactions for Protein: P32338

RME1, Zinc finger protein RME1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RME1P32338 YLL032CYLL032C 2478 nt0.16□□□□□ -2.38
RME1P32338 NPC2YDL046W 522 nt0.16□□□□□ -2.38
RME1P32338 YGR042WYGR042W 816 nt0.16□□□□□ -2.38
RME1P32338 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.16□□□□□ -2.38
RME1P32338 CSM4YPL200W 471 nt0.16□□□□□ -2.38
RME1P32338 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.15□□□□□ -2.39
RME1P32338 YDR220CYDR220C 294 nt0.15□□□□□ -2.39
RME1P32338 RPL26BYGR034W 384 nt0.15□□□□□ -2.39
RME1P32338 LRP1YHR081W 555 nt0.15□□□□□ -2.39
RME1P32338 YOR248WYOR248W 303 nt0.15□□□□□ -2.39
RME1P32338 SBH1YER087C-B 249 nt0.14□□□□□ -2.39
RME1P32338 RPL32YBL092W 393 nt0.14□□□□□ -2.39
RME1P32338 NOP9YJL010C 2001 nt0.13□□□□□ -2.39
RME1P32338 YGL015CYGL015C 393 nt0.13□□□□□ -2.39
RME1P32338 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.13□□□□□ -2.39
RME1P32338 PRP39YML046W 1890 nt0.12□□□□□ -2.39
RME1P32338 CUP1-1YHR053C 186 nt0.12□□□□□ -2.39
RME1P32338 CUP1-2YHR055C 186 nt0.12□□□□□ -2.39
RME1P32338 RPC10YHR143W-A 213 nt0.12□□□□□ -2.39
RME1P32338 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.12□□□□□ -2.39
RME1P32338 RFX1YLR176C 2436 nt0.12□□□□□ -2.39
RME1P32338 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.11□□□□□ -2.39
RME1P32338 YDR344CYDR344C 444 nt0.11□□□□□ -2.39
RME1P32338 YBL062WYBL062W 381 nt0.11□□□□□ -2.39
RME1P32338 PET111YMR257C 2403 nt0.11□□□□□ -2.39
RME1P32338 YLR217WYLR217W 324 nt0.1□□□□□ -2.39
RME1P32338 YLR252WYLR252W 306 nt0.1□□□□□ -2.39
RME1P32338 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.1□□□□□ -2.39
RME1P32338 VIK1YPL253C 1944 nt0.1□□□□□ -2.39
RME1P32338 SPO11YHL022C 1197 nt0.09□□□□□ -2.4
RME1P32338 MRPL31YKL138C 396 nt0.09□□□□□ -2.4
RME1P32338 snR13snR13 124 nt0.09□□□□□ -2.4
RME1P32338 LOA1YPR139C 903 nt0.09□□□□□ -2.4
RME1P32338 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.08□□□□□ -2.4
RME1P32338 CMC1YKL137W 336 nt0.08□□□□□ -2.4
RME1P32338 snR45snR45 172 nt0.08□□□□□ -2.4
RME1P32338 YFR057WYFR057W 456 nt0.07□□□□□ -2.4
RME1P32338 COX12YLR038C 252 nt0.07□□□□□ -2.4
RME1P32338 CDC33YOL139C 642 nt0.07□□□□□ -2.4
RME1P32338 VAM3YOR106W 852 nt0.07□□□□□ -2.4
RME1P32338 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.06□□□□□ -2.4
RME1P32338 AFB1YLR040C 675 nt0.06□□□□□ -2.4
RME1P32338 RCN2YOR220W 798 nt0.06□□□□□ -2.4
RME1P32338 YPL185WYPL185W 396 nt0.06□□□□□ -2.4
RME1P32338 ZIP2YGL249W 2115 nt0.05□□□□□ -2.4
RME1P32338 snR5snR5 204 nt0.05□□□□□ -2.4
RME1P32338 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.05□□□□□ -2.4
RME1P32338 CWC23YGL128C 852 nt0.05□□□□□ -2.4
RME1P32338 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.05□□□□□ -2.4
RME1P32338 YPL044CYPL044C 549 nt0.05□□□□□ -2.4
RME1P32338 SEC8YPR055W 3198 nt0.05□□□□□ -2.4
RME1P32338 AFR1YDR085C 1863 nt0.04□□□□□ -2.4
RME1P32338 YDR029WYDR029W 315 nt0.04□□□□□ -2.4
RME1P32338 YPT6YLR262C 648 nt0.04□□□□□ -2.4
RME1P32338 YLR271WYLR271W 825 nt0.03□□□□□ -2.4
RME1P32338 YPR096CYPR096C 303 nt0.03□□□□□ -2.4
RME1P32338 COG8YML071C 1824 nt0.03□□□□□ -2.4
RME1P32338 SDS22YKL193C 1017 nt0.02□□□□□ -2.41
RME1P32338 BSC3YLR465C 309 nt0.02□□□□□ -2.41
RME1P32338 YDR269CYDR269C 324 nt0.01□□□□□ -2.41
RME1P32338 YJR079WYJR079W 330 nt0.01□□□□□ -2.41
RME1P32338 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.01□□□□□ -2.41
RME1P32338 BIG1YHR101C 1008 nt0□□□□□ -2.41
RME1P32338 ILM1YJR118C 612 nt0□□□□□ -2.41
RME1P32338 MYO1YHR023W 5787 nt-0□□□□□ -2.41
RME1P32338 YJL113WYJL113W 4647 nt-0□□□□□ -2.41
RME1P32338 YGR115CYGR115C 780 nt-0.01□□□□□ -2.41
RME1P32338 YGR228WYGR228W 345 nt-0.01□□□□□ -2.41
RME1P32338 YIR044CYIR044C 186 nt-0.01□□□□□ -2.41
RME1P32338 VMA21YGR105W 234 nt-0.02□□□□□ -2.41
RME1P32338 CUL3YGR003W 2235 nt-0.02□□□□□ -2.41
RME1P32338 CSE1YGL238W 2883 nt-0.03□□□□□ -2.41
RME1P32338 FYV10YIL097W 1551 nt-0.03□□□□□ -2.41
RME1P32338 INP2YMR163C 2118 nt-0.04□□□□□ -2.42
RME1P32338 RPL35AYDL191W 363 nt-0.04□□□□□ -2.42
RME1P32338 APQ13YJL075C 417 nt-0.04□□□□□ -2.42
RME1P32338 EFR3YMR212C 2349 nt-0.04□□□□□ -2.42
RME1P32338 PRP5YBR237W 2550 nt-0.04□□□□□ -2.42
RME1P32338 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-0.05□□□□□ -2.42
RME1P32338 YMR254CYMR254C 309 nt-0.05□□□□□ -2.42
RME1P32338 YOR053WYOR053W 342 nt-0.05□□□□□ -2.42
RME1P32338 YJL135WYJL135W 318 nt-0.06□□□□□ -2.42
RME1P32338 YNL050CYNL050C 813 nt-0.06□□□□□ -2.42
RME1P32338 RPB10YOR210W 213 nt-0.06□□□□□ -2.42
RME1P32338 IRC16YPR038W 360 nt-0.06□□□□□ -2.42
RME1P32338 PRP42YDR235W 1635 nt-0.06□□□□□ -2.42
RME1P32338 MCM10YIL150C 1716 nt-0.07□□□□□ -2.42
RME1P32338 POP7YBR167C 423 nt-0.07□□□□□ -2.42
RME1P32338 OLI1Q0130 231 nt-0.08□□□□□ -2.42
RME1P32338 YAR053WYAR053W 297 nt-0.08□□□□□ -2.42
RME1P32338 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.08□□□□□ -2.42
RME1P32338 YBR063CYBR063C 1215 nt-0.08□□□□□ -2.42
RME1P32338 YBR064WYBR064W 429 nt-0.08□□□□□ -2.42
RME1P32338 YCL002CYCL002C 792 nt-0.08□□□□□ -2.42
RME1P32338 ORC3YLL004W 1851 nt-0.09□□□□□ -2.42
RME1P32338 PAA1YDR071C 576 nt-0.09□□□□□ -2.42
RME1P32338 YLR198CYLR198C 360 nt-0.09□□□□□ -2.42
RME1P32338 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.09□□□□□ -2.42
RME1P32338 YPL261CYPL261C 309 nt-0.09□□□□□ -2.42
RME1P32338 snR190snR190 190 nt-0.09□□□□□ -2.42
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