Protein–RNA interactions for Protein: P0C2J7

TY4B-H, Transposon Ty4-H Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY4B-HP0C2J7 LOC1YFR001W 615 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YPR170CYPR170C 336 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YLR252WYLR252W 306 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YOR366WYOR366W 354 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 LEE1YPL054W 906 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YPR153WYPR153W 423 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 RPL35AYDL191W 363 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 TIM8YJR135W-A 264 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YOL106WYOL106W 354 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 RPB10YOR210W 213 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 snR190snR190 190 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 ATC1YDR184C 885 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 SRB7YDR308C 423 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YBR064WYBR064W 429 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 PAN3YKL025C 2040 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YGL204CYGL204C 306 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YHR054CYHR054C 1065 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 LRP1YHR081W 555 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 RCN2YOR220W 798 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YHL042WYHL042W 453 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YER188C-AYER188C-A 300 nt-0.09□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 RRI2YOL117W 1938 nt-0.09□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YJL007CYJL007C 315 nt-0.1□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 YLR271WYLR271W 825 nt-0.1□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 YPL197CYPL197C 414 nt-0.1□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 NIP100YPL174C 2607 nt-0.1□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 SSS1YDR086C 243 nt-0.1□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 ACF4YJR083C 930 nt-0.1□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 YCL002CYCL002C 792 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 FYV10YIL097W 1551 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 YPL044CYPL044C 549 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 RCO1YMR075W 2055 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 PRP5YBR237W 2550 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 INP2YMR163C 2118 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 YJR079WYJR079W 330 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 YLR232WYLR232W 348 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 BSC3YLR465C 309 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 CSM4YPL200W 471 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 PRP42YDR235W 1635 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 YGR164WYGR164W 336 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 COX12YLR038C 252 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 RPL26AYLR344W 384 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 YNL050CYNL050C 813 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 CDC33YOL139C 642 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 POL32YJR043C 1053 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 YOR248WYOR248W 303 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 CUL3YGR003W 2235 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 RPL22BYFL034C-A 369 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 OLI1Q0130 231 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY4B-HP0C2J7 NPC2YDL046W 522 nt-0.16□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 QCR7YDR529C 384 nt-0.16□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 TDA2YER071C 381 nt-0.16□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YKL111CYKL111C 336 nt-0.16□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YOR364WYOR364W 369 nt-0.16□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 RFX1YLR176C 2436 nt-0.16□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YJL135WYJL135W 318 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 AFB1YLR040C 675 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 VAM3YOR106W 852 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 TFB6YOR352W 1032 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.18□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-0.18□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YNL150WYNL150W 408 nt-0.18□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YNL211CYNL211C 261 nt-0.18□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YOL160WYOL160W 342 nt-0.18□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YBR071WYBR071W 636 nt-0.19□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 IPI3YNL182C 1668 nt-0.19□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 CUP1-1YHR053C 186 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 CUP1-2YHR055C 186 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 MRPL31YKL138C 396 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YDR220CYDR220C 294 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YDR344CYDR344C 444 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 IRC16YPR038W 360 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 snR46snR46 197 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 ORC3YLL004W 1851 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 ASE1YOR058C 2658 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YDR029WYDR029W 315 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 HTB1YDR224C 396 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 CWC23YGL128C 852 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YKL136WYKL136W 399 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY4B-HP0C2J7 YFR057WYFR057W 456 nt-0.22□□□□□ -2.45
TY4B-HP0C2J7 YPR096CYPR096C 303 nt-0.22□□□□□ -2.45
TY4B-HP0C2J7 RSM23YGL129C 1353 nt-0.23□□□□□ -2.45
TY4B-HP0C2J7 MAM33YIL070C 801 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY4B-HP0C2J7 COX5BYIL111W 456 nt-0.24□□□□□ -2.45
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