Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARFGEF2Q9Y6D5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ARFGEF2Q9Y6D5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARFGEF2Q9Y6D5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARFGEF2Q9Y6D5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF2Q9Y6D5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms