Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms