Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 ATG31YDR022C 591 nt1.76□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 HIT1YJR055W 495 nt1.76□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 ABM1YJR108W 372 nt1.76□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.76□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 YML003WYML003W 873 nt1.76□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 HHT1YBR010W 411 nt1.76□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 YPL261CYPL261C 309 nt1.76□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 ZRG17YNR039C 1818 nt1.75□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 SBE22YHR103W 2559 nt1.75□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 PXA2YKL188C 2562 nt1.75□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 RLM1YPL089C 2031 nt1.75□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 YGR265WYGR265W 411 nt1.75□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 YPL229WYPL229W 621 nt1.75□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 NOP53YPL146C 1368 nt1.73□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 RPL31AYDL075W 342 nt1.73□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.73□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.73□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 MSH5YDL154W 2706 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 PAU3YCR104W 375 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 RTR1YER139C 681 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 MAK10YEL053C 2202 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 MON2YNL297C 4911 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 YBP1YBR216C 2025 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 DCP2YNL118C 2913 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 SWI6YLR182W 2412 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 LYS14YDR034C 2373 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 ATP6Q0085 780 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 YOR029WYOR029W 336 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 YOP1YPR028W 543 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 FRK1YPL141C 2598 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 MDM20YOL076W 2391 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 GIM4YEL003W 336 nt1.7□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 YIL059CYIL059C 366 nt1.7□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 EFR3YMR212C 2349 nt1.7□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 YBR012CYBR012C 420 nt1.7□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 TRM3YDL112W 4311 nt1.7□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 HMI1YOL095C 2121 nt1.69□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 SRP14YDL092W 441 nt1.69□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 CYC7YEL039C 342 nt1.69□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 YGR035CYGR035C 351 nt1.69□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 YHL037CYHL037C 402 nt1.69□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 YHL041WYHL041W 450 nt1.69□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 TRX1YLR043C 312 nt1.69□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 YLR419WYLR419W 4308 nt1.69□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 YJR003CYJR003C 1560 nt1.68□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 ZIP1YDR285W 2628 nt1.68□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.68□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 IRC23YOR044W 474 nt1.68□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 SPC110YDR356W 2835 nt1.68□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 PET127YOR017W 2403 nt1.68□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 CTF4YPR135W 2784 nt1.67□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 RFX1YLR176C 2436 nt1.67□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.67□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.66□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 SPO24YPR036W-A 204 nt1.66□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 POL5YEL055C 3069 nt1.66□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 SKI3YPR189W 4299 nt1.66□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 FYV8YGR196C 2454 nt1.65□□□□□ -2.14
SEC39Q12745 PAC1YOR269W 1485 nt1.65□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.65□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 UPS1YLR193C 528 nt1.65□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 YAR053WYAR053W 297 nt1.65□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 YOR019WYOR019W 2193 nt1.65□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.64□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 NUT2YPR168W 474 nt1.64□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 MLH3YPL164C 2148 nt1.64□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.63□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 CCH1YGR217W 6120 nt1.63□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 SLY1YDR189W 2001 nt1.62□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 YLL032CYLL032C 2478 nt1.62□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 BRR2YER172C 6492 nt1.62□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 CHS1YNL192W 3396 nt1.62□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 MRPL31YKL138C 396 nt1.61□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 MUK1YPL070W 1839 nt1.61□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 MEC1YBR136W 7107 nt1.61□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 PAU2YEL049W 363 nt1.6□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.6□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.6□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 YPR197CYPR197C 564 nt1.6□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 snR51snR51 107 nt1.6□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 DGR2YKL121W 2559 nt1.6□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 CFT1YDR301W 4074 nt1.6□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 YNL058CYNL058C 951 nt1.59□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 RPB10YOR210W 213 nt1.59□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 BIL1YOR304C-A 231 nt1.59□□□□□ -2.15
SEC39Q12745 KAP122YGL016W 3246 nt1.59□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 SGO1YOR073W 1773 nt1.59□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 MVP1YMR004W 1536 nt1.58□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 PIG1YLR273C 1947 nt1.58□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 ENV11YGR071C 2583 nt1.57□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 SAS3YBL052C 2496 nt1.57□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 CSN9YDR179C 489 nt1.56□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 COA6YMR244C-A 315 nt1.56□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 HKR1YDR420W 5409 nt1.55□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.55□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 snR72snR72 98 nt1.55□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.55□□□□□ -2.16
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