Protein–RNA interactions for Protein: Q12514

NOT5, General negative regulator of transcription subunit 5, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOT5Q12514 snR54snR54 86 nt1.11□□□□□ -2.23
NOT5Q12514 MVP1YMR004W 1536 nt1.1□□□□□ -2.23
NOT5Q12514 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.1□□□□□ -2.23
NOT5Q12514 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.1□□□□□ -2.23
NOT5Q12514 YJL022WYJL022W 309 nt1.1□□□□□ -2.23
NOT5Q12514 YOR376WYOR376W 369 nt1.1□□□□□ -2.23
NOT5Q12514 SWI6YLR182W 2412 nt1.1□□□□□ -2.23
NOT5Q12514 IML1YJR138W 4755 nt1.09□□□□□ -2.23
NOT5Q12514 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.09□□□□□ -2.23
NOT5Q12514 PHS1YJL097W 654 nt1.09□□□□□ -2.23
NOT5Q12514 RPS27AYKL156W 249 nt1.09□□□□□ -2.23
NOT5Q12514 YOP1YPR028W 543 nt1.09□□□□□ -2.23
NOT5Q12514 SIP4YJL089W 2490 nt1.08□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 PAU2YEL049W 363 nt1.08□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.08□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 MKT1YNL085W 2493 nt1.07□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 SCC2YDR180W 4482 nt1.07□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.07□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 YGL239CYGL239C 315 nt1.07□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 NFU1YKL040C 771 nt1.07□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 RPL32YBL092W 393 nt1.07□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 ATP19YOL077W-A 207 nt1.07□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 ZEO1YOL109W 342 nt1.07□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 GDS1YOR355W 1569 nt1.07□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 ROM2YLR371W 4071 nt1.06□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 YDR008CYDR008C 351 nt1.06□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 VPS55YJR044C 423 nt1.06□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.06□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 YLR287CYLR287C 1068 nt1.06□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 YLR456WYLR456W 615 nt1.06□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 RUF22RUF22 515 nt1.06□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.06□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 TIM18YOR297C 579 nt1.06□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 UFD2YDL190C 2886 nt1.06□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 GUP1YGL084C 1683 nt1.06□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 DGR2YKL121W 2559 nt1.05□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.05□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 AZF1YOR113W 2745 nt1.05□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.05□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.05□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.05□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 YGL217CYGL217C 342 nt1.05□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 EMC5YIL027C 426 nt1.05□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.05□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 YLR101CYLR101C 396 nt1.05□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 Q0017Q0017 162 nt1.05□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 YLL054CYLL054C 2532 nt1.05□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 SLX4YLR135W 2247 nt1.04□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 LYS14YDR034C 2373 nt1.04□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 RPL9BYNL067W 576 nt1.04□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 YBL071CYBL071C 309 nt1.04□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 YPL068CYPL068C 882 nt1.04□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 SGO1YOR073W 1773 nt1.03□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 TIM13YGR181W 318 nt1.03□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 YPL182CYPL182C 384 nt1.03□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 PXA2YKL188C 2562 nt1.03□□□□□ -2.24
NOT5Q12514 EFR3YMR212C 2349 nt1.03□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 TTI1YKL033W 3117 nt1.02□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 DIE2YGR227W 1578 nt1.02□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 YIL059CYIL059C 366 nt1.02□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 SDH2YLL041C 801 nt1.02□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 SAS3YBL052C 2496 nt1.02□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 SPO23YBR250W 1572 nt1.02□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 YDL211CYDL211C 1119 nt1.01□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 YDR114CYDR114C 303 nt1.01□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.01□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.01□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 RPL40BYKR094C 387 nt1.01□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 YLR202CYLR202C 327 nt1.01□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 YJR029WYJR029W 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 NOC3YLR002C 1992 nt1.01□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 SLY1YDR189W 2001 nt1□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 YDR269CYDR269C 324 nt1□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 RTR1YER139C 681 nt1□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 HCH1YNL281W 462 nt1□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 YPR063CYPR063C 423 nt1□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 VPS54YDR027C 2670 nt1□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 NUP120YKL057C 3114 nt0.99□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 CYC7YEL039C 342 nt0.99□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 RFX1YLR176C 2436 nt0.99□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 PIG1YLR273C 1947 nt0.99□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 YLL032CYLL032C 2478 nt0.98□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 CBS1YDL069C 690 nt0.98□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 YAR047CYAR047C 321 nt0.98□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.98□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 snR14snR14 160 nt0.98□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 NUT2YPR168W 474 nt0.98□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 NUP188YML103C 4968 nt0.98□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 SMC1YFL008W 3678 nt0.98□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 MUK1YPL070W 1839 nt0.98□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 WIP1YDR374W-A 270 nt0.97□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 RTT102YGR275W 474 nt0.97□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 YKL083WYKL083W 615 nt0.97□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 MRPL31YKL138C 396 nt0.97□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 ERP4YOR016C 624 nt0.97□□□□□ -2.25
NOT5Q12514 RPB10YOR210W 213 nt0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 147.3 ms