Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 RPL9AYGL147C 576 nt1.01□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 snR13snR13 124 nt1.01□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 TSC3YBR058C-A 243 nt1.01□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 RTR1YER139C 681 nt1□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 NUT1YGL151W 3399 nt1□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 SPO75YLL005C 2607 nt1□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 LYS14YDR034C 2373 nt0.99□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 BEM2YER155C 6504 nt0.99□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 EMC4YGL231C 573 nt0.99□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 YNR025CYNR025C 360 nt0.99□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 YGR130CYGR130C 2451 nt0.99□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 NUP145YGL092W 3954 nt0.99□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 SPO23YBR250W 1572 nt0.99□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 PIG1YLR273C 1947 nt0.99□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 SPT21YMR179W 2277 nt0.99□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 PIP2YOR363C 2991 nt0.99□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 NOC3YLR002C 1992 nt0.98□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.98□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 NUT2YPR168W 474 nt0.98□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 SPT7YBR081C 3999 nt0.98□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 PXA2YKL188C 2562 nt0.97□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.97□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.97□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.97□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 MXR1YER042W 555 nt0.97□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 YLR269CYLR269C 351 nt0.97□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 RPL32YBL092W 393 nt0.97□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 EAF1YDR359C 2949 nt0.97□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 CDC39YCR093W 6327 nt0.96□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 RPF1YHR088W 888 nt0.96□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.96□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 HCH1YNL281W 462 nt0.96□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 YDR114CYDR114C 303 nt0.95□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 BIG1YHR101C 1008 nt0.95□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 HIT1YJR055W 495 nt0.95□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 EAF6YJR082C 342 nt0.95□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 YML003WYML003W 873 nt0.95□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 SWI6YLR182W 2412 nt0.95□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 MPT5YGL178W 2580 nt0.95□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 STB6YKL072W 2301 nt0.94□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 APL3YBL037W 3078 nt0.94□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 PRE4YFR050C 801 nt0.94□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 URM1YIL008W 300 nt0.94□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 PHS1YJL097W 654 nt0.94□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 STE18YJR086W 333 nt0.94□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 SDH2YLL041C 801 nt0.94□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.94□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 SCW11YGL028C 1629 nt0.93□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 IML1YJR138W 4755 nt0.93□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 AIM44YPL158C 2277 nt0.93□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 YCR001WYCR001W 315 nt0.93□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.93□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 YGL239CYGL239C 315 nt0.93□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 PBI2YNL015W 228 nt0.93□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 RUF22RUF22 515 nt0.93□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 YLL032CYLL032C 2478 nt0.92□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 YGR045CYGR045C 363 nt0.91□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 RTT102YGR275W 474 nt0.91□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 NBL1YHR199C-A 222 nt0.91□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 ERP4YOR016C 624 nt0.91□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 YBR012CYBR012C 420 nt0.91□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.91□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 IFH1YLR223C 3258 nt0.91□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 FIG4YNL325C 2640 nt0.9□□□□□ -2.26
SNF8Q12483 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.9□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 MRPL31YKL138C 396 nt0.9□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 SAS3YBL052C 2496 nt0.9□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 KAP120YPL125W 3099 nt0.9□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 RFX1YLR176C 2436 nt0.89□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 CDC33YOL139C 642 nt0.89□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 SET3YKR029C 2256 nt0.89□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 YDL158CYDL158C 309 nt0.88□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 CYC7YEL039C 342 nt0.88□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.88□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 UPS1YLR193C 528 nt0.88□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 IRC23YOR044W 474 nt0.88□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 AIM9YER080W 1884 nt0.87□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 YDR269CYDR269C 324 nt0.87□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.87□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.87□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 RPL16AYIL133C 600 nt0.87□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 NFU1YKL040C 771 nt0.87□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 YML108WYML108W 318 nt0.87□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.87□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 SLD3YGL113W 2007 nt0.87□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 SMC1YFL008W 3678 nt0.87□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 ENV11YGR071C 2583 nt0.87□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 STO1YMR125W 2586 nt0.87□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 YIL059CYIL059C 366 nt0.86□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 AIM29YKR074W 468 nt0.86□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 PAU24YBR301W 363 nt0.86□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 DOP1YDR141C 5097 nt0.86□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 APL2YKL135C 2181 nt0.86□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 SCC2YDR180W 4482 nt0.85□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.85□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.85□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 YPR117WYPR117W 7470 nt0.85□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 NUP157YER105C 4176 nt0.85□□□□□ -2.27
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