Protein–RNA interactions for Protein: Q12292

ATG34, Autophagy-related protein 34, yeastyeast

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG34Q12292 YPL229WYPL229W 621 nt1.56□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 YPR012WYPR012W 255 nt1.56□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 YLR419WYLR419W 4308 nt1.56□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 NOP53YPL146C 1368 nt1.56□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 FIG2YCR089W 4830 nt1.56□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 YBP1YBR216C 2025 nt1.56□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 RPL31AYDL075W 342 nt1.55□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 YLR334CYLR334C 381 nt1.55□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 YML003WYML003W 873 nt1.55□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 YOR121CYOR121C 306 nt1.55□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 YOP1YPR028W 543 nt1.55□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 DCP2YNL118C 2913 nt1.55□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 HMI1YOL095C 2121 nt1.54□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 SWI6YLR182W 2412 nt1.54□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 HMRA1YCR097W 381 nt1.54□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 SRP14YDL092W 441 nt1.54□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 ATG31YDR022C 591 nt1.54□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 TRX1YLR043C 312 nt1.54□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 CAT8YMR280C 4302 nt1.54□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 LYS14YDR034C 2373 nt1.54□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 CCH1YGR217W 6120 nt1.53□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 CYC7YEL039C 342 nt1.53□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 RTR1YER139C 681 nt1.53□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.53□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 HIT1YJR055W 495 nt1.53□□□□□ -2.16
ATG34Q12292 BRR2YER172C 6492 nt1.52□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 ZIP1YDR285W 2628 nt1.52□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 YHL041WYHL041W 450 nt1.52□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 YIL059CYIL059C 366 nt1.52□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 SAR1YPL218W 573 nt1.52□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 EFR3YMR212C 2349 nt1.52□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 TBS1YBR150C 3285 nt1.52□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.51□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 COA6YMR244C-A 315 nt1.51□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 YPL261CYPL261C 309 nt1.51□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 YIL102CYIL102C 306 nt1.5□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 NUP192YJL039C 5052 nt1.5□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 RFX1YLR176C 2436 nt1.5□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 SFB2YNL049C 2631 nt1.49□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 MLH3YPL164C 2148 nt1.48□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 snR56snR56 88 nt1.48□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 YHL037CYHL037C 402 nt1.48□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 UPS1YLR193C 528 nt1.48□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 IRC23YOR044W 474 nt1.48□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 PAC1YOR269W 1485 nt1.48□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 TDA9YML081W 3756 nt1.48□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 SKI3YPR189W 4299 nt1.47□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 NUT2YPR168W 474 nt1.47□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 SPC110YDR356W 2835 nt1.47□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 YJR003CYJR003C 1560 nt1.47□□□□□ -2.17
ATG34Q12292 SPC98YNL126W 2541 nt1.46□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 PET127YOR017W 2403 nt1.46□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 MRPL31YKL138C 396 nt1.46□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 YLL032CYLL032C 2478 nt1.46□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 PAU2YEL049W 363 nt1.45□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 YGR035CYGR035C 351 nt1.45□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 YOR029WYOR029W 336 nt1.45□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.45□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 YBR012CYBR012C 420 nt1.45□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 SLY1YDR189W 2001 nt1.45□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 FYV8YGR196C 2454 nt1.45□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 DGR2YKL121W 2559 nt1.45□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 CHS1YNL192W 3396 nt1.44□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 CTF4YPR135W 2784 nt1.44□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 SSK2YNR031C 4740 nt1.44□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 MAD1YGL086W 2250 nt1.44□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.44□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 YAR053WYAR053W 297 nt1.44□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 POL5YEL055C 3069 nt1.44□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 LAA1YJL207C 6045 nt1.43□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 MUK1YPL070W 1839 nt1.43□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 PMD1YER132C 5262 nt1.43□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 GIM4YEL003W 336 nt1.43□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 YJL022WYJL022W 309 nt1.43□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.43□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 RPB10YOR210W 213 nt1.43□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 YOR019WYOR019W 2193 nt1.42□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 MSH3YCR092C 3057 nt1.42□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 KCS1YDR017C 3153 nt1.42□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.42□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 PFD1YJL179W 330 nt1.42□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 COF1YLL050C 432 nt1.42□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 SPO24YPR036W-A 204 nt1.42□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 snR51snR51 107 nt1.42□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 SMC4YLR086W 4257 nt1.42□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 KIP1YBL063W 3336 nt1.42□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 PIG1YLR273C 1947 nt1.42□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.41□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 MVP1YMR004W 1536 nt1.41□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.41□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.41□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 EMC5YIL027C 426 nt1.41□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.41□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.41□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 YNL058CYNL058C 951 nt1.41□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 ALK1YGL021W 2283 nt1.41□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 SAS3YBL052C 2496 nt1.41□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 PIK1YNL267W 3201 nt1.4□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 RAD50YNL250W 3939 nt1.4□□□□□ -2.18
ATG34Q12292 ENV11YGR071C 2583 nt1.4□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.1 ms