Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 ENA1YDR040C 3276 nt3.47□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 SEC63YOR254C 1992 nt3.47□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 RAD34YDR314C 2079 nt3.47□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt3.46□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 AKR1YDR264C 2295 nt3.46□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 MNL2YLR057W 2550 nt3.46□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 MET5YJR137C 4329 nt3.46□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 COX12YLR038C 252 nt3.45□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 NAM7YMR080C 2916 nt3.45□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 DNL4YOR005C 2835 nt3.44□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 CRM1YGR218W 3255 nt3.44□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 MAK21YDR060W 3078 nt3.44□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.44□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt3.44□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 ZRG8YER033C 3231 nt3.44□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 HEF3YNL014W 3135 nt3.44□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 RTT10YPL183C 3042 nt3.44□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 PKH1YDR490C 2301 nt3.44□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 XRS2YDR369C 2565 nt3.44□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 STB4YMR019W 2850 nt3.43□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 AUS1YOR011W 4185 nt3.43□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 SSM4YIL030C 3960 nt3.43□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 SET2YJL168C 2202 nt3.43□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 STU2YLR045C 2667 nt3.42□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt3.42□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 STE11YLR362W 2154 nt3.42□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 HSH155YMR288W 2916 nt3.42□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 SLM1YIL105C 2061 nt3.42□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 DUG2YBR281C 2637 nt3.41□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 RGA2YDR379W 3030 nt3.41□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 MIT1YEL007W 2001 nt3.41□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 REC8YPR007C 2043 nt3.41□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 IFH1YLR223C 3258 nt3.41□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.41□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.41□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.41□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.41□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.41□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.41□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.41□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 SPT4YGR063C 309 nt3.41□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 SPO22YIL073C 2928 nt3.41□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 TAE2YPL009C 3117 nt3.41□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 RRP6YOR001W 2202 nt3.4□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 TFC1YBR123C 1950 nt3.4□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 MMS1YPR164W 4224 nt3.4□□□□□ -1.86
YRR1Q12172 RRP5YMR229C 5190 nt3.4□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 RRP12YPL012W 3687 nt3.4□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 IRC8YJL051W 2469 nt3.39□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 AFI1YOR129C 2682 nt3.39□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt3.39□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt3.39□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 PSK1YAL017W 4071 nt3.39□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 TSC11YER093C 4293 nt3.39□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 SLX4YLR135W 2247 nt3.39□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 INP53YOR109W 3324 nt3.39□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.38□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.38□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.38□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.38□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 MTR4YJL050W 3222 nt3.38□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 PTP2YOR208W 2253 nt3.37□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 RPO41YFL036W 4056 nt3.37□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 PAU8YAL068C 363 nt3.37□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 PAU18YLL064C 363 nt3.37□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 PAU6YNR076W 363 nt3.37□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 PAU20YOL161C 363 nt3.37□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 YNL018CYNL018C 1839 nt3.37□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 YME2YMR302C 2553 nt3.37□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 DSE4YNR067C 3354 nt3.37□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 SMC3YJL074C 3693 nt3.37□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 MAD1YGL086W 2250 nt3.36□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 STU1YBL034C 4542 nt3.36□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 CRS5YOR031W 210 nt3.35□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 GCN1YGL195W 8019 nt3.35□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 CIN8YEL061C 3003 nt3.35□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 YDR186CYDR186C 2634 nt3.35□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 YHR080CYHR080C 4038 nt3.35□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 YPP1YGR198W 2454 nt3.34□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 TTI1YKL033W 3117 nt3.34□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 KTI11YBL071W-A 249 nt3.34□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 NAB6YML117W 3405 nt3.34□□□□□ -1.87
YRR1Q12172 CAT2YML042W 2013 nt3.33□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt3.33□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 YGL182CYGL182C 324 nt3.33□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 QCR9YGR183C 201 nt3.33□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt3.33□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 YLL054CYLL054C 2532 nt3.33□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 YEL025CYEL025C 3567 nt3.32□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt3.32□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.32□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt3.32□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt3.32□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 SET3YKR029C 2256 nt3.32□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 SAS3YBL052C 2496 nt3.32□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 RPS21AYKR057W 264 nt3.31□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 ENV11YGR071C 2583 nt3.31□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 NFT1YKR103W 3657 nt3.31□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 VAS1YGR094W 3315 nt3.31□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 CHS2YBR038W 2892 nt3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.5 ms