Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 SLH1YGR271W 5904 nt2.76□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 NIP100YPL174C 2607 nt2.75□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 VTC3YPL019C 2508 nt2.75□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 ISW1YBR245C 3390 nt2.75□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 SAP1YER047C 2694 nt2.75□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 EMP24YGL200C 612 nt2.75□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 TRS65YGR166W 1683 nt2.75□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 MOT1YPL082C 5604 nt2.75□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 RPO41YFL036W 4056 nt2.74□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 ATP8Q0080 147 nt2.74□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.74□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 SEC5YDR166C 2916 nt2.74□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 TRS130YMR218C 3309 nt2.73□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.73□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 YLR140WYLR140W 327 nt2.73□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.73□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 PRP39YML046W 1890 nt2.73□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 SWA2YDR320C 2007 nt2.73□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 snR74snR74 88 nt2.72□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 HYP2YEL034W 474 nt2.72□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 MET18YIL128W 3099 nt2.72□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 ORC2YBR060C 1863 nt2.72□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 UBR1YGR184C 5853 nt2.71□□□□□ -1.97
MCD1Q12158 BUB1YGR188C 3066 nt2.71□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 SPC98YNL126W 2541 nt2.71□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 RPS29AYLR388W 171 nt2.71□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 YOR376WYOR376W 369 nt2.71□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 YCL046WYCL046W 324 nt2.71□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 DNA2YHR164C 4569 nt2.71□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 FAR11YNL127W 2862 nt2.7□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.7□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 ESL2YKR096W 3588 nt2.7□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 MNE1YOR350C 1992 nt2.7□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 YKU70YMR284W 1809 nt2.7□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 NUP100YKL068W 2880 nt2.7□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 PHO2YDL106C 1680 nt2.69□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 SEC26YDR238C 2922 nt2.69□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 LCL1YPL056C 306 nt2.69□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 SEC7YDR170C 6030 nt2.69□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 VPS8YAL002W 3825 nt2.69□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 YRB1YDR002W 606 nt2.68□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 RPS27BYHR021C 249 nt2.68□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 YIL174WYIL174W 228 nt2.68□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.68□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.68□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 SGF11YPL047W 300 nt2.68□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 YPP1YGR198W 2454 nt2.68□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 SGM1YJR134C 2124 nt2.68□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 ZRG17YNR039C 1818 nt2.68□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 CLN3YAL040C 1743 nt2.68□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 EDS1YBR033W 2760 nt2.67□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 SGS1YMR190C 4344 nt2.67□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 SMC6YLR383W 3345 nt2.67□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 SRP14YDL092W 441 nt2.67□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.67□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 YBL012CYBL012C 402 nt2.67□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 YOR218CYOR218C 420 nt2.67□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 KRE33YNL132W 3171 nt2.66□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 SPO75YLL005C 2607 nt2.66□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.66□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 NAB6YML117W 3405 nt2.66□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 NUM1YDR150W 8247 nt2.65□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 YPL150WYPL150W 2706 nt2.65□□□□□ -1.98
MCD1Q12158 snR70snR70 164 nt2.65□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 RPS22AYJL190C 393 nt2.65□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.65□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 YGL217CYGL217C 342 nt2.64□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 RPS17AYML024W 411 nt2.64□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 YOR170WYOR170W 306 nt2.64□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.63□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 FKS3YMR306W 5358 nt2.63□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 TFC8YPL007C 1767 nt2.62□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 TUS1YLR425W 3924 nt2.62□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.62□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 ATG11YPR049C 3537 nt2.62□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 NOP14YDL148C 2433 nt2.62□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 MSC6YOR354C 2079 nt2.62□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 SRO77YBL106C 3033 nt2.61□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 SIR3YLR442C 2937 nt2.61□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 AXL1YPR122W 3627 nt2.61□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 BNR1YIL159W 4128 nt2.61□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 MRP10YDL045W-A 288 nt2.6□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 snR46snR46 197 nt2.6□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 YEF3YLR249W 3135 nt2.6□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 ZIP1YDR285W 2628 nt2.6□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 HSH155YMR288W 2916 nt2.6□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 MCM10YIL150C 1716 nt2.59□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 TRA1YHR099W 11235 nt2.59□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 SPO21YOL091W 1830 nt2.59□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 RPL34BYIL052C 366 nt2.59□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.59□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 PUT3YKL015W 2940 nt2.59□□□□□ -1.99
MCD1Q12158 RLM1YPL089C 2031 nt2.58□□□□□ -2
MCD1Q12158 RAV1YJR033C 4074 nt2.58□□□□□ -2
MCD1Q12158 PDR3YBL005W 2931 nt2.58□□□□□ -2
MCD1Q12158 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.58□□□□□ -2
MCD1Q12158 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.58□□□□□ -2
MCD1Q12158 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.58□□□□□ -2
MCD1Q12158 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.58□□□□□ -2
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