Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 SET3YKR029C 2256 nt0.58□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 SCW11YGL028C 1629 nt0.57□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 OST1YJL002C 1431 nt0.57□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YDR521WYDR521W 336 nt0.57□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 SCEIQ0160 708 nt0.57□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YAP3YHL009C 993 nt0.57□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YJR079WYJR079W 330 nt0.57□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 RUF22RUF22 515 nt0.57□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YDL206WYDL206W 2289 nt0.57□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 UTP20YBL004W 7482 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 RIM20YOR275C 1986 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YGR045CYGR045C 363 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 BMT5YIL096C 1011 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 SDH2YLL041C 801 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YBR032WYBR032W 303 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YBR071WYBR071W 636 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 STO1YMR125W 2586 nt0.56□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 PXA2YKL188C 2562 nt0.55□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YMR160WYMR160W 2451 nt0.55□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YJR003CYJR003C 1560 nt0.55□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 SPO13YHR014W 876 nt0.55□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 ECM9YKR004C 1134 nt0.55□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.55□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.55□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 NUP157YER105C 4176 nt0.55□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 LYS14YDR034C 2373 nt0.55□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 PPN1YDR452W 2025 nt0.54□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YDR008CYDR008C 351 nt0.54□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 MXR1YER042W 555 nt0.54□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 NBL1YHR199C-A 222 nt0.54□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 AFR1YDR085C 1863 nt0.54□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 SPO23YBR250W 1572 nt0.53□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 RKR1YMR247C 4689 nt0.53□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YJR087WYJR087W 351 nt0.53□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 IPP1YBR011C 864 nt0.53□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 SLM6YBR266C 453 nt0.53□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 SLD3YGL113W 2007 nt0.53□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YDL187CYDL187C 330 nt0.52□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 YDL196WYDL196W 330 nt0.52□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 YDR114CYDR114C 303 nt0.52□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 HIT1YJR055W 495 nt0.52□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 YLR252WYLR252W 306 nt0.52□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 YOR199WYOR199W 330 nt0.52□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.51□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.51□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.51□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.51□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.51□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.51□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.51□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.51□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.51□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 AFB1YLR040C 675 nt0.51□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 YLR198CYLR198C 360 nt0.51□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 GMC2YLR445W 567 nt0.51□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.51□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 PDE2YOR360C 1581 nt0.5□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 SWF1YDR126W 1011 nt0.5□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.5□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 UTP10YJL109C 5310 nt0.49□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 OCA6YDR067C 675 nt0.49□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 DCP1YOL149W 696 nt0.49□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 IES4YOR189W 351 nt0.49□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 GRX5YPL059W 453 nt0.49□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 SWI6YLR182W 2412 nt0.49□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 LCD1YDR499W 2244 nt0.49□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 SLY1YDR189W 2001 nt0.48□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 SPO11YHL022C 1197 nt0.48□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 URM1YIL008W 300 nt0.48□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 UPS1YLR193C 528 nt0.48□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 MMS4YBR098W 2076 nt0.48□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.47□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 PHS1YJL097W 654 nt0.47□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.47□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.47□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 YNL050CYNL050C 813 nt0.47□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 WAR1YML076C 2835 nt0.47□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 YLL032CYLL032C 2478 nt0.47□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 GEA2YEL022W 4380 nt0.47□□□□□ -2.33
YHP1Q04116 ALG13YGL047W 609 nt0.46□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YOR248WYOR248W 303 nt0.46□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YPR039WYPR039W 336 nt0.46□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.45□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 ILM1YJR118C 612 nt0.45□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 MRPL31YKL138C 396 nt0.45□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 RRT1YBL048W 312 nt0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.2 ms