Protein–RNA interactions for Protein: P53758

YNR077C, UPF0320 protein YNR077C, yeastyeast

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNR077CP53758 TMA10YLR327C 261 nt0.75□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 RCN2YOR220W 798 nt0.75□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 NUT2YPR168W 474 nt0.75□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 EAF1YDR359C 2949 nt0.75□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 NST1YNL091W 3723 nt0.75□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 APL3YBL037W 3078 nt0.75□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 YPR117WYPR117W 7470 nt0.75□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 YGL239CYGL239C 315 nt0.74□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.74□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 PXA2YKL188C 2562 nt0.74□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 SCW11YGL028C 1629 nt0.74□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 SLY1YDR189W 2001 nt0.73□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.73□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 YGR045CYGR045C 363 nt0.73□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 GPI15YNL038W 690 nt0.73□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 YBR012CYBR012C 420 nt0.73□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt0.73□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 STB6YKL072W 2301 nt0.73□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 RFX1YLR176C 2436 nt0.72□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 EAF6YJR082C 342 nt0.72□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 RUF22RUF22 515 nt0.72□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 RPL32YBL092W 393 nt0.72□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 YLL032CYLL032C 2478 nt0.72□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 YER135CYER135C 393 nt0.71□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 EMC4YGL231C 573 nt0.71□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YIL059CYIL059C 366 nt0.71□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 SPO75YLL005C 2607 nt0.71□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 NUP192YJL039C 5052 nt0.71□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YCR001WYCR001W 315 nt0.7□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.7□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 NBL1YHR199C-A 222 nt0.7□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 URM1YIL008W 300 nt0.7□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 RPL16AYIL133C 600 nt0.7□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 MRPL31YKL138C 396 nt0.7□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 UPS1YLR193C 528 nt0.7□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 PBI2YNL015W 228 nt0.7□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YPL182CYPL182C 384 nt0.7□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.7□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 FIG4YNL325C 2640 nt0.7□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 APL2YKL135C 2181 nt0.7□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 MMS4YBR098W 2076 nt0.69□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 ROM2YLR371W 4071 nt0.69□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.69□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YDR269CYDR269C 324 nt0.69□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.69□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YHL037CYHL037C 402 nt0.69□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 PHS1YJL097W 654 nt0.69□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 RPS27AYKL156W 249 nt0.69□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YNR025CYNR025C 360 nt0.69□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.69□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 CDC39YCR093W 6327 nt0.69□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 SIP4YJL089W 2490 nt0.69□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 RIM20YOR275C 1986 nt0.68□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 SET3YKR029C 2256 nt0.68□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 SMC1YFL008W 3678 nt0.68□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YLR422WYLR422W 5799 nt0.68□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 EFR3YMR212C 2349 nt0.68□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 ERP4YOR016C 624 nt0.68□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 KAP120YPL125W 3099 nt0.68□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.68□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 LCD1YDR499W 2244 nt0.68□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 ENV11YGR071C 2583 nt0.67□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 STO1YMR125W 2586 nt0.67□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 AIM9YER080W 1884 nt0.67□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 PDE2YOR360C 1581 nt0.67□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 CYC7YEL039C 342 nt0.67□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.67□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YDL206WYDL206W 2289 nt0.66□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 ALY2YJL084C 3141 nt0.66□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.66□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 RPF1YHR088W 888 nt0.66□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 STE18YJR086W 333 nt0.66□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YLR269CYLR269C 351 nt0.66□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 RRT1YBL048W 312 nt0.66□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt0.66□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 IRC23YOR044W 474 nt0.66□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 YGR130CYGR130C 2451 nt0.66□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 SLI15YBR156C 2097 nt0.66□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 NUP157YER105C 4176 nt0.66□□□□□ -2.3
YNR077CP53758 NPC2YDL046W 522 nt0.65□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.65□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 PRE4YFR050C 801 nt0.65□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YML108WYML108W 318 nt0.65□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YOR199WYOR199W 330 nt0.65□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 PAU24YBR301W 363 nt0.65□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 ZIP2YGL249W 2115 nt0.64□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YHR130CYHR130C 336 nt0.64□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 IFH1YLR223C 3258 nt0.63□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 TIM13YGR181W 318 nt0.63□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 NFU1YKL040C 771 nt0.63□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.63□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.63□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YJR029WYJR029W 5268 nt0.63□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.63□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YKL202WYKL202W 582 nt0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 53.9 ms