Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 snR9snR9 187 nt0.56□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.56□□□□□ -2.32
CCS1P40202 MND1YGL183C 660 nt0.56□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YAL066WYAL066W 309 nt0.56□□□□□ -2.32
CCS1P40202 RUF22RUF22 515 nt0.56□□□□□ -2.32
CCS1P40202 RKR1YMR247C 4689 nt0.56□□□□□ -2.32
CCS1P40202 NUP157YER105C 4176 nt0.56□□□□□ -2.32
CCS1P40202 MKT1YNL085W 2493 nt0.56□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YDL206WYDL206W 2289 nt0.55□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YGR045CYGR045C 363 nt0.55□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.55□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.55□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.55□□□□□ -2.32
CCS1P40202 SCW11YGL028C 1629 nt0.55□□□□□ -2.32
CCS1P40202 RIM20YOR275C 1986 nt0.55□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YDL073WYDL073W 2955 nt0.55□□□□□ -2.32
CCS1P40202 STO1YMR125W 2586 nt0.54□□□□□ -2.32
CCS1P40202 snR84snR84 550 nt0.54□□□□□ -2.32
CCS1P40202 SDH2YLL041C 801 nt0.54□□□□□ -2.32
CCS1P40202 PXA2YKL188C 2562 nt0.53□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.53□□□□□ -2.32
CCS1P40202 MXR1YER042W 555 nt0.53□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YJR079WYJR079W 330 nt0.53□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YBR032WYBR032W 303 nt0.53□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YBR071WYBR071W 636 nt0.53□□□□□ -2.32
CCS1P40202 COG4YPR105C 2586 nt0.52□□□□□ -2.33
CCS1P40202 LYS14YDR034C 2373 nt0.52□□□□□ -2.33
CCS1P40202 YDR008CYDR008C 351 nt0.52□□□□□ -2.33
CCS1P40202 YDR114CYDR114C 303 nt0.52□□□□□ -2.33
CCS1P40202 SCEIQ0160 708 nt0.52□□□□□ -2.33
CCS1P40202 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.52□□□□□ -2.33
CCS1P40202 SPO23YBR250W 1572 nt0.52□□□□□ -2.33
CCS1P40202 YDL196WYDL196W 330 nt0.51□□□□□ -2.33
CCS1P40202 SLD3YGL113W 2007 nt0.51□□□□□ -2.33
CCS1P40202 SPO13YHR014W 876 nt0.51□□□□□ -2.33
CCS1P40202 BMT5YIL096C 1011 nt0.51□□□□□ -2.33
CCS1P40202 HIT1YJR055W 495 nt0.51□□□□□ -2.33
CCS1P40202 ECM9YKR004C 1134 nt0.51□□□□□ -2.33
CCS1P40202 PPN1YDR452W 2025 nt0.5□□□□□ -2.33
CCS1P40202 SWF1YDR126W 1011 nt0.5□□□□□ -2.33
CCS1P40202 YOR199WYOR199W 330 nt0.5□□□□□ -2.33
CCS1P40202 AFR1YDR085C 1863 nt0.5□□□□□ -2.33
CCS1P40202 UTP10YJL109C 5310 nt0.5□□□□□ -2.33
CCS1P40202 PDE2YOR360C 1581 nt0.49□□□□□ -2.33
CCS1P40202 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.49□□□□□ -2.33
CCS1P40202 SLM6YBR266C 453 nt0.49□□□□□ -2.33
CCS1P40202 YMR160WYMR160W 2451 nt0.49□□□□□ -2.33
CCS1P40202 YDL187CYDL187C 330 nt0.48□□□□□ -2.33
CCS1P40202 YJR087WYJR087W 351 nt0.48□□□□□ -2.33
CCS1P40202 YLR252WYLR252W 306 nt0.48□□□□□ -2.33
CCS1P40202 GMC2YLR445W 567 nt0.48□□□□□ -2.33
CCS1P40202 IPP1YBR011C 864 nt0.48□□□□□ -2.33
CCS1P40202 LCD1YDR499W 2244 nt0.48□□□□□ -2.33
CCS1P40202 YML002WYML002W 2214 nt0.48□□□□□ -2.33
CCS1P40202 OCA6YDR067C 675 nt0.47□□□□□ -2.33
CCS1P40202 SLX9YGR081C 633 nt0.47□□□□□ -2.33
CCS1P40202 UPS1YLR193C 528 nt0.47□□□□□ -2.33
CCS1P40202 YOR029WYOR029W 336 nt0.47□□□□□ -2.33
CCS1P40202 SWI6YLR182W 2412 nt0.47□□□□□ -2.33
CCS1P40202 MMS4YBR098W 2076 nt0.47□□□□□ -2.33
CCS1P40202 SLY1YDR189W 2001 nt0.47□□□□□ -2.33
CCS1P40202 LTE1YAL024C 4308 nt0.47□□□□□ -2.33
CCS1P40202 OST1YJL002C 1431 nt0.47□□□□□ -2.33
CCS1P40202 PRP16YKR086W 3216 nt0.46□□□□□ -2.34
CCS1P40202 AFB1YLR040C 675 nt0.46□□□□□ -2.34
CCS1P40202 IES4YOR189W 351 nt0.46□□□□□ -2.34
CCS1P40202 YLL007CYLL007C 1998 nt0.45□□□□□ -2.34
CCS1P40202 GEA2YEL022W 4380 nt0.45□□□□□ -2.34
CCS1P40202 WAR1YML076C 2835 nt0.45□□□□□ -2.34
CCS1P40202 ALG13YGL047W 609 nt0.45□□□□□ -2.34
CCS1P40202 STF2YGR008C 255 nt0.45□□□□□ -2.34
CCS1P40202 URM1YIL008W 300 nt0.45□□□□□ -2.34
CCS1P40202 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.45□□□□□ -2.34
CCS1P40202 YLR198CYLR198C 360 nt0.45□□□□□ -2.34
CCS1P40202 YLL032CYLL032C 2478 nt0.44□□□□□ -2.34
CCS1P40202 INA22YIR024C 651 nt0.44□□□□□ -2.34
CCS1P40202 YOR248WYOR248W 303 nt0.44□□□□□ -2.34
CCS1P40202 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.43□□□□□ -2.34
CCS1P40202 SPO11YHL022C 1197 nt0.43□□□□□ -2.34
CCS1P40202 MRPL31YKL138C 396 nt0.43□□□□□ -2.34
CCS1P40202 RRT1YBL048W 312 nt0.43□□□□□ -2.34
CCS1P40202 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.43□□□□□ -2.34
CCS1P40202 GRX5YPL059W 453 nt0.43□□□□□ -2.34
CCS1P40202 DBP6YNR038W 1890 nt0.43□□□□□ -2.34
CCS1P40202 ENV11YGR071C 2583 nt0.43□□□□□ -2.34
CCS1P40202 MET32YDR253C 576 nt0.42□□□□□ -2.34
CCS1P40202 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.42□□□□□ -2.34
CCS1P40202 YGR042WYGR042W 816 nt0.42□□□□□ -2.34
CCS1P40202 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.42□□□□□ -2.34
CCS1P40202 YNL050CYNL050C 813 nt0.42□□□□□ -2.34
CCS1P40202 YOL029CYOL029C 606 nt0.42□□□□□ -2.34
CCS1P40202 DCP1YOL149W 696 nt0.42□□□□□ -2.34
CCS1P40202 RPS30BYOR182C 192 nt0.42□□□□□ -2.34
CCS1P40202 YPR039WYPR039W 336 nt0.42□□□□□ -2.34
CCS1P40202 YPR153WYPR153W 423 nt0.42□□□□□ -2.34
CCS1P40202 UTP20YBL004W 7482 nt0.42□□□□□ -2.34
CCS1P40202 SLI15YBR156C 2097 nt0.41□□□□□ -2.34
CCS1P40202 ECM12YHR021W-A 456 nt0.41□□□□□ -2.34
CCS1P40202 ILM1YJR118C 612 nt0.41□□□□□ -2.34
CCS1P40202 RPL32YBL092W 393 nt0.41□□□□□ -2.34
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