Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 APQ13YJL075C 417 nt1.03□□□□□ -2.24
DDI1P40087 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.03□□□□□ -2.24
DDI1P40087 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.03□□□□□ -2.24
DDI1P40087 YJR029WYJR029W 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
DDI1P40087 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
DDI1P40087 PIG1YLR273C 1947 nt1.03□□□□□ -2.25
DDI1P40087 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.02□□□□□ -2.25
DDI1P40087 HIT1YJR055W 495 nt1.02□□□□□ -2.25
DDI1P40087 NOC3YLR002C 1992 nt1.02□□□□□ -2.25
DDI1P40087 SPT21YMR179W 2277 nt1.02□□□□□ -2.25
DDI1P40087 TSC3YBR058C-A 243 nt1.02□□□□□ -2.25
DDI1P40087 SCC2YDR180W 4482 nt1.02□□□□□ -2.25
DDI1P40087 SEC3YER008C 4011 nt1.02□□□□□ -2.25
DDI1P40087 YCS4YLR272C 3531 nt1.02□□□□□ -2.25
DDI1P40087 YDR114CYDR114C 303 nt1.01□□□□□ -2.25
DDI1P40087 MXR1YER042W 555 nt1.01□□□□□ -2.25
DDI1P40087 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.01□□□□□ -2.25
DDI1P40087 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.01□□□□□ -2.25
DDI1P40087 GPI15YNL038W 690 nt1.01□□□□□ -2.25
DDI1P40087 EAF1YDR359C 2949 nt1.01□□□□□ -2.25
DDI1P40087 PXA2YKL188C 2562 nt1.01□□□□□ -2.25
DDI1P40087 CLU1YMR012W 3834 nt1□□□□□ -2.25
DDI1P40087 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1□□□□□ -2.25
DDI1P40087 MATALPHA2YCR039C 633 nt1□□□□□ -2.25
DDI1P40087 BIG1YHR101C 1008 nt1□□□□□ -2.25
DDI1P40087 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1□□□□□ -2.25
DDI1P40087 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1□□□□□ -2.25
DDI1P40087 NUT2YPR168W 474 nt1□□□□□ -2.25
DDI1P40087 APL3YBL037W 3078 nt1□□□□□ -2.25
DDI1P40087 CDC39YCR093W 6327 nt1□□□□□ -2.25
DDI1P40087 ROM2YLR371W 4071 nt0.99□□□□□ -2.25
DDI1P40087 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.99□□□□□ -2.25
DDI1P40087 BEM2YER155C 6504 nt0.99□□□□□ -2.25
DDI1P40087 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.99□□□□□ -2.25
DDI1P40087 STF2YGR008C 255 nt0.99□□□□□ -2.25
DDI1P40087 RPL32YBL092W 393 nt0.99□□□□□ -2.25
DDI1P40087 YNR025CYNR025C 360 nt0.99□□□□□ -2.25
DDI1P40087 STB6YKL072W 2301 nt0.99□□□□□ -2.25
DDI1P40087 EMC4YGL231C 573 nt0.98□□□□□ -2.25
DDI1P40087 RTT102YGR275W 474 nt0.98□□□□□ -2.25
DDI1P40087 SWI6YLR182W 2412 nt0.98□□□□□ -2.25
DDI1P40087 MPT5YGL178W 2580 nt0.98□□□□□ -2.25
DDI1P40087 YGL239CYGL239C 315 nt0.97□□□□□ -2.25
DDI1P40087 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.97□□□□□ -2.25
DDI1P40087 RUF22RUF22 515 nt0.97□□□□□ -2.25
DDI1P40087 SIP4YJL089W 2490 nt0.97□□□□□ -2.25
DDI1P40087 EAF6YJR082C 342 nt0.96□□□□□ -2.26
DDI1P40087 NUP145YGL092W 3954 nt0.96□□□□□ -2.26
DDI1P40087 YCR001WYCR001W 315 nt0.95□□□□□ -2.26
DDI1P40087 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.95□□□□□ -2.26
DDI1P40087 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.95□□□□□ -2.26
DDI1P40087 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
DDI1P40087 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
DDI1P40087 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.95□□□□□ -2.26
DDI1P40087 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
DDI1P40087 NBL1YHR199C-A 222 nt0.95□□□□□ -2.26
DDI1P40087 URM1YIL008W 300 nt0.95□□□□□ -2.26
DDI1P40087 STE18YJR086W 333 nt0.95□□□□□ -2.26
DDI1P40087 SCW11YGL028C 1629 nt0.95□□□□□ -2.26
DDI1P40087 ENV11YGR071C 2583 nt0.95□□□□□ -2.26
DDI1P40087 YLL032CYLL032C 2478 nt0.94□□□□□ -2.26
DDI1P40087 YGR045CYGR045C 363 nt0.94□□□□□ -2.26
DDI1P40087 RPF1YHR088W 888 nt0.94□□□□□ -2.26
DDI1P40087 SDH2YLL041C 801 nt0.94□□□□□ -2.26
DDI1P40087 YLR269CYLR269C 351 nt0.94□□□□□ -2.26
DDI1P40087 HUG1YML058W-A 207 nt0.94□□□□□ -2.26
DDI1P40087 PBI2YNL015W 228 nt0.94□□□□□ -2.26
DDI1P40087 YBR012CYBR012C 420 nt0.94□□□□□ -2.26
DDI1P40087 RFX1YLR176C 2436 nt0.94□□□□□ -2.26
DDI1P40087 DOP1YDR141C 5097 nt0.93□□□□□ -2.26
DDI1P40087 MRPL31YKL138C 396 nt0.93□□□□□ -2.26
DDI1P40087 APL2YKL135C 2181 nt0.92□□□□□ -2.26
DDI1P40087 PHS1YJL097W 654 nt0.92□□□□□ -2.26
DDI1P40087 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.92□□□□□ -2.26
DDI1P40087 AIM44YPL158C 2277 nt0.92□□□□□ -2.26
DDI1P40087 SAS3YBL052C 2496 nt0.92□□□□□ -2.26
DDI1P40087 SET3YKR029C 2256 nt0.91□□□□□ -2.26
DDI1P40087 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.91□□□□□ -2.26
DDI1P40087 SMC1YFL008W 3678 nt0.9□□□□□ -2.27
DDI1P40087 YDR269CYDR269C 324 nt0.9□□□□□ -2.27
DDI1P40087 YIL059CYIL059C 366 nt0.9□□□□□ -2.27
DDI1P40087 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.9□□□□□ -2.27
DDI1P40087 NFU1YKL040C 771 nt0.9□□□□□ -2.27
DDI1P40087 UPS1YLR193C 528 nt0.9□□□□□ -2.27
DDI1P40087 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.89□□□□□ -2.27
DDI1P40087 YML108WYML108W 318 nt0.89□□□□□ -2.27
DDI1P40087 IRC23YOR044W 474 nt0.89□□□□□ -2.27
DDI1P40087 YPL182CYPL182C 384 nt0.89□□□□□ -2.27
DDI1P40087 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.89□□□□□ -2.27
DDI1P40087 FIG4YNL325C 2640 nt0.89□□□□□ -2.27
DDI1P40087 STO1YMR125W 2586 nt0.89□□□□□ -2.27
DDI1P40087 UTP20YBL004W 7482 nt0.88□□□□□ -2.27
DDI1P40087 CYC7YEL039C 342 nt0.88□□□□□ -2.27
DDI1P40087 RPL16AYIL133C 600 nt0.88□□□□□ -2.27
DDI1P40087 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.88□□□□□ -2.27
DDI1P40087 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.88□□□□□ -2.27
DDI1P40087 KAP120YPL125W 3099 nt0.88□□□□□ -2.27
DDI1P40087 AIM9YER080W 1884 nt0.88□□□□□ -2.27
DDI1P40087 SLY1YDR189W 2001 nt0.88□□□□□ -2.27
DDI1P40087 SLD3YGL113W 2007 nt0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.8 ms