Protein–RNA interactions for Protein: P38844

DSE2, Protein DSE2, yeastyeast

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE2P38844 LYS14YDR034C 2373 nt0.87□□□□□ -2.27
DSE2P38844 TRM3YDL112W 4311 nt0.87□□□□□ -2.27
DSE2P38844 ZIP1YDR285W 2628 nt0.87□□□□□ -2.27
DSE2P38844 GUP1YGL084C 1683 nt0.87□□□□□ -2.27
DSE2P38844 YLR422WYLR422W 5799 nt0.87□□□□□ -2.27
DSE2P38844 DCP2YNL118C 2913 nt0.87□□□□□ -2.27
DSE2P38844 GDS1YOR355W 1569 nt0.87□□□□□ -2.27
DSE2P38844 YDL211CYDL211C 1119 nt0.86□□□□□ -2.27
DSE2P38844 WIP1YDR374W-A 270 nt0.86□□□□□ -2.27
DSE2P38844 ECL1YGR146C 636 nt0.86□□□□□ -2.27
DSE2P38844 HIT1YJR055W 495 nt0.86□□□□□ -2.27
DSE2P38844 ZEO1YOL109W 342 nt0.86□□□□□ -2.27
DSE2P38844 snR54snR54 86 nt0.86□□□□□ -2.27
DSE2P38844 AZF1YOR113W 2745 nt0.85□□□□□ -2.27
DSE2P38844 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.85□□□□□ -2.27
DSE2P38844 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.85□□□□□ -2.27
DSE2P38844 YEL057CYEL057C 702 nt0.85□□□□□ -2.27
DSE2P38844 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.85□□□□□ -2.27
DSE2P38844 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.85□□□□□ -2.27
DSE2P38844 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.85□□□□□ -2.27
DSE2P38844 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.85□□□□□ -2.27
DSE2P38844 RSM22YKL155C 1887 nt0.84□□□□□ -2.27
DSE2P38844 CDC39YCR093W 6327 nt0.84□□□□□ -2.27
DSE2P38844 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.84□□□□□ -2.27
DSE2P38844 YHL037CYHL037C 402 nt0.84□□□□□ -2.27
DSE2P38844 SDH2YLL041C 801 nt0.84□□□□□ -2.27
DSE2P38844 HCH1YNL281W 462 nt0.84□□□□□ -2.27
DSE2P38844 NUT2YPR168W 474 nt0.84□□□□□ -2.27
DSE2P38844 SGO1YOR073W 1773 nt0.83□□□□□ -2.28
DSE2P38844 CBS1YDL069C 690 nt0.83□□□□□ -2.28
DSE2P38844 RRT15YLR162W-A 189 nt0.83□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YLR287CYLR287C 1068 nt0.83□□□□□ -2.28
DSE2P38844 PIG1YLR273C 1947 nt0.83□□□□□ -2.28
DSE2P38844 CYC7YEL039C 342 nt0.82□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.82□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YLL020CYLL020C 306 nt0.82□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.82□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YBL071CYBL071C 309 nt0.82□□□□□ -2.28
DSE2P38844 ERP4YOR016C 624 nt0.82□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YPL205CYPL205C 345 nt0.82□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YPR063CYPR063C 423 nt0.82□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YCL023CYCL023C 348 nt0.82□□□□□ -2.28
DSE2P38844 ADR1YDR216W 3972 nt0.81□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.81□□□□□ -2.28
DSE2P38844 PRE4YFR050C 801 nt0.81□□□□□ -2.28
DSE2P38844 RTT102YGR275W 474 nt0.81□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.81□□□□□ -2.28
DSE2P38844 RPL9BYNL067W 576 nt0.81□□□□□ -2.28
DSE2P38844 VAM6YDL077C 3150 nt0.81□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YLL032CYLL032C 2478 nt0.8□□□□□ -2.28
DSE2P38844 VPS54YDR027C 2670 nt0.8□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YDR114CYDR114C 303 nt0.8□□□□□ -2.28
DSE2P38844 RPL34BYIL052C 366 nt0.8□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YJL007CYJL007C 315 nt0.8□□□□□ -2.28
DSE2P38844 MRPL31YKL138C 396 nt0.8□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.8□□□□□ -2.28
DSE2P38844 ENV11YGR071C 2583 nt0.8□□□□□ -2.28
DSE2P38844 RFX1YLR176C 2436 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE2P38844 SWI6YLR182W 2412 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE2P38844 LAA1YJL207C 6045 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE2P38844 SDH7YDR511W 402 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE2P38844 TMA10YLR327C 261 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE2P38844 CDC31YOR257W 486 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE2P38844 PRM3YPL192C 402 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE2P38844 DIE2YGR227W 1578 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YLL054CYLL054C 2532 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 NOC3YLR002C 1992 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YDL032WYDL032W 312 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YDR269CYDR269C 324 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 TIM13YGR181W 318 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 RPL26AYLR344W 384 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 YPL182CYPL182C 384 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 APL3YBL037W 3078 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 SPT21YMR179W 2277 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 KIP1YBL063W 3336 nt0.78□□□□□ -2.28
DSE2P38844 SCW11YGL028C 1629 nt0.78□□□□□ -2.29
DSE2P38844 SLD3YGL113W 2007 nt0.77□□□□□ -2.29
DSE2P38844 NUT1YGL151W 3399 nt0.77□□□□□ -2.29
DSE2P38844 EAF1YDR359C 2949 nt0.77□□□□□ -2.29
DSE2P38844 PIP2YOR363C 2991 nt0.77□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YLR434CYLR434C 384 nt0.77□□□□□ -2.29
DSE2P38844 MRPL50YNR022C 420 nt0.77□□□□□ -2.29
DSE2P38844 STB6YKL072W 2301 nt0.77□□□□□ -2.29
DSE2P38844 MSN5YDR335W 3675 nt0.76□□□□□ -2.29
DSE2P38844 SWI4YER111C 3282 nt0.76□□□□□ -2.29
DSE2P38844 BUD3YCL014W 4911 nt0.76□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YDL011CYDL011C 324 nt0.76□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YAP6YDR259C 1152 nt0.76□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YIL059CYIL059C 366 nt0.76□□□□□ -2.29
DSE2P38844 RPS24BYIL069C 408 nt0.76□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.76□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.76□□□□□ -2.29
DSE2P38844 APL2YKL135C 2181 nt0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.4 ms