Protein–RNA interactions for Protein: P38799

YHR078W, Uncharacterized protein YHR078W, yeastyeast

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR078WP38799 GEA1YJR031C 4227 nt2.47□□□□□ -2.01
YHR078WP38799 TRS65YGR166W 1683 nt2.47□□□□□ -2.01
YHR078WP38799 SWI6YLR182W 2412 nt2.47□□□□□ -2.01
YHR078WP38799 NUP170YBL079W 4509 nt2.47□□□□□ -2.01
YHR078WP38799 OLI1Q0130 231 nt2.47□□□□□ -2.01
YHR078WP38799 REV3YPL167C 4515 nt2.47□□□□□ -2.01
YHR078WP38799 VMR1YHL035C 4779 nt2.47□□□□□ -2.01
YHR078WP38799 VPS54YDR027C 2670 nt2.46□□□□□ -2.01
YHR078WP38799 MGM1YOR211C 2646 nt2.46□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 MLH1YMR167W 2310 nt2.46□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 STE11YLR362W 2154 nt2.46□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 TOR1YJR066W 7413 nt2.46□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 AMS1YGL156W 3252 nt2.46□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 JSN1YJR091C 3276 nt2.46□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.46□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 MMS22YLR320W 4365 nt2.46□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 YKU80YMR106C 1890 nt2.45□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 GIS1YDR096W 2685 nt2.45□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 SLN1YIL147C 3663 nt2.45□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 SMY2YBR172C 2223 nt2.45□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 UTP14YML093W 2700 nt2.45□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 PDR1YGL013C 3207 nt2.45□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.45□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 SET2YJL168C 2202 nt2.45□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 RFX1YLR176C 2436 nt2.44□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 PRP39YML046W 1890 nt2.43□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 SLM1YIL105C 2061 nt2.43□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 ZRG8YER033C 3231 nt2.43□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 MPT5YGL178W 2580 nt2.43□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 YRB1YDR002W 606 nt2.43□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 YLR140WYLR140W 327 nt2.43□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 RPB10YOR210W 213 nt2.43□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.43□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 YPR092WYPR092W 306 nt2.43□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 SWI5YDR146C 2130 nt2.42□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 SPF1YEL031W 3648 nt2.42□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 SCP160YJL080C 3669 nt2.42□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 IRA2YOL081W 9240 nt2.41□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 SLY1YDR189W 2001 nt2.41□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 snR72snR72 98 nt2.41□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.41□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 YOR170WYOR170W 306 nt2.41□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 ARP8YOR141C 2646 nt2.41□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 SEC5YDR166C 2916 nt2.41□□□□□ -2.02
YHR078WP38799 CAF120YNL278W 3183 nt2.4□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 YCR043CYCR043C 384 nt2.4□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.4□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 YNL018CYNL018C 1839 nt2.4□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 UBP1YDL122W 2430 nt2.39□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 CSF1YLR087C 8877 nt2.39□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 PHO2YDL106C 1680 nt2.39□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 YOR376WYOR376W 369 nt2.39□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 NIP100YPL174C 2607 nt2.39□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 LYS14YDR034C 2373 nt2.39□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 YKU70YMR284W 1809 nt2.38□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 snR74snR74 88 nt2.38□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 HYP2YEL034W 474 nt2.38□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 PAU8YAL068C 363 nt2.38□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 PAU18YLL064C 363 nt2.38□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 PAU6YNR076W 363 nt2.38□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 PAU20YOL161C 363 nt2.38□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 APL5YPL195W 2799 nt2.38□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 VTC1YER072W 390 nt2.37□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 EMP24YGL200C 612 nt2.37□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.37□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.37□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 ESL2YKR096W 3588 nt2.36□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.36□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.36□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 SPC98YNL126W 2541 nt2.35□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 YNL170WYNL170W 396 nt2.35□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 YOR055WYOR055W 435 nt2.35□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 SGF11YPL047W 300 nt2.35□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 PHO91YNR013C 2685 nt2.35□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 SVL3YPL032C 2478 nt2.34□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 CLN3YAL040C 1743 nt2.34□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 YGL217CYGL217C 342 nt2.34□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 RPS27BYHR021C 249 nt2.34□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 YOR218CYOR218C 420 nt2.34□□□□□ -2.03
YHR078WP38799 YCL046WYCL046W 324 nt2.33□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 TRS130YMR218C 3309 nt2.33□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 MET18YIL128W 3099 nt2.32□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 MRP10YDL045W-A 288 nt2.32□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 YBL012CYBL012C 402 nt2.32□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.32□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 SWA2YDR320C 2007 nt2.32□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 SPO75YLL005C 2607 nt2.32□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 TOP2YNL088W 4287 nt2.31□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 UBR1YGR184C 5853 nt2.31□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 SRP14YDL092W 441 nt2.31□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 MSB1YOR188W 3414 nt2.31□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 MNE1YOR350C 1992 nt2.3□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 VPS8YAL002W 3825 nt2.3□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.3□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 RPS29AYLR388W 171 nt2.3□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 snR46snR46 197 nt2.3□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 ZRG17YNR039C 1818 nt2.3□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 SMC6YLR383W 3345 nt2.29□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 NUP100YKL068W 2880 nt2.29□□□□□ -2.04
YHR078WP38799 FAR11YNL127W 2862 nt2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.7 ms