Protein–RNA interactions for Protein: O13536

YHR139C-A, Uncharacterized protein YHR139C-A, yeastyeast

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR139C-AO13536 snR13snR13 124 nt0.82□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 NUT2YPR168W 474 nt0.82□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.82□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 NUT1YGL151W 3399 nt0.82□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 CAT8YMR280C 4302 nt0.82□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 CDC39YCR093W 6327 nt0.81□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 FIG4YNL325C 2640 nt0.81□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 YCS4YLR272C 3531 nt0.81□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.81□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.81□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 EAF6YJR082C 342 nt0.81□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.81□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 EAF1YDR359C 2949 nt0.81□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 EFR3YMR212C 2349 nt0.81□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 MMS4YBR098W 2076 nt0.8□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 RPL9AYGL147C 576 nt0.8□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 YGL239CYGL239C 315 nt0.8□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 YGR025WYGR025W 303 nt0.8□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 UPS1YLR193C 528 nt0.8□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 snR14snR14 160 nt0.8□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 NST1YNL091W 3723 nt0.8□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 RFX1YLR176C 2436 nt0.79□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 YLL032CYLL032C 2478 nt0.79□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt0.79□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 RCN2YOR220W 798 nt0.79□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 ROM2YLR371W 4071 nt0.78□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 YDL032WYDL032W 312 nt0.78□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 YDR269CYDR269C 324 nt0.78□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 GPI15YNL038W 690 nt0.78□□□□□ -2.28
YHR139C-AO13536 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.77□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 YGR045CYGR045C 363 nt0.77□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 HIT1YJR055W 495 nt0.77□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 MRPL31YKL138C 396 nt0.77□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 YPL182CYPL182C 384 nt0.77□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.77□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 YDL206WYDL206W 2289 nt0.77□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 YGR130CYGR130C 2451 nt0.77□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 STB6YKL072W 2301 nt0.76□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 NUP192YJL039C 5052 nt0.76□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 SLI15YBR156C 2097 nt0.76□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 AIM9YER080W 1884 nt0.75□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 PDE2YOR360C 1581 nt0.75□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 APL2YKL135C 2181 nt0.75□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 CYC7YEL039C 342 nt0.75□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.75□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 HUR1YGL168W 333 nt0.75□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 YHL037CYHL037C 402 nt0.75□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 URM1YIL008W 300 nt0.75□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 PBI2YNL015W 228 nt0.75□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 RUF22RUF22 515 nt0.75□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.75□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 SCC2YDR180W 4482 nt0.75□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 SET3YKR029C 2256 nt0.75□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 LCD1YDR499W 2244 nt0.74□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 SPT7YBR081C 3999 nt0.74□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 STO1YMR125W 2586 nt0.74□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 SMC1YFL008W 3678 nt0.74□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 KAP120YPL125W 3099 nt0.74□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 NPC2YDL046W 522 nt0.74□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 EMC4YGL231C 573 nt0.74□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 YCR001WYCR001W 315 nt0.73□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.73□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 YER135CYER135C 393 nt0.73□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.73□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.73□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 YLR255CYLR255C 354 nt0.73□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 RRT1YBL048W 312 nt0.73□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 RPL32YBL092W 393 nt0.73□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 IRC23YOR044W 474 nt0.73□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 ZIP2YGL249W 2115 nt0.73□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 PHS1YJL097W 654 nt0.72□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 RPB10YOR210W 213 nt0.72□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.72□□□□□ -2.29
YHR139C-AO13536 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.71□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.71□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 NBL1YHR199C-A 222 nt0.71□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.71□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 YLR269CYLR269C 351 nt0.71□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 IES4YOR189W 351 nt0.71□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 WAR1YML076C 2835 nt0.71□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 YPR117WYPR117W 7470 nt0.71□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 BEM2YER155C 6504 nt0.71□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 TIM13YGR181W 318 nt0.7□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 YHR125WYHR125W 306 nt0.7□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 YHR130CYHR130C 336 nt0.7□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.7□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 NUP157YER105C 4176 nt0.7□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 ALG13YGL047W 609 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 GPG1YGL121C 381 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 YKL202WYKL202W 582 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 YNR025CYNR025C 360 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 YOR199WYOR199W 330 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 SPO75YLL005C 2607 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 ALY2YJL084C 3141 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR139C-AO13536 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 73.3 ms