Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms