Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms