Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms