Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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