Protein–RNA interactions for Protein: Q12432

EAF3, Chromatin modification-related protein EAF3, yeastyeast

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EAF3Q12432 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.63□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 TOF2YKR010C 2316 nt1.63□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 YNL144CYNL144C 2223 nt1.63□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 NAM7YMR080C 2916 nt1.63□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 RPH1YER169W 2391 nt1.62□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 YDR008CYDR008C 351 nt1.62□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 DAD4YDR320C-A 219 nt1.62□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.62□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 YLR334CYLR334C 381 nt1.62□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 YNL114CYNL114C 372 nt1.62□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.62□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 HIR3YJR140C 4947 nt1.61□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 ATG31YDR022C 591 nt1.61□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 RPL42BYHR141C 321 nt1.61□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.61□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 RPL42AYNL162W 321 nt1.61□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 MYO4YAL029C 4416 nt1.6□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 YAP6YDR259C 1152 nt1.6□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.6□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.6□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 RPL9BYNL067W 576 nt1.6□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 TBS1YBR150C 3285 nt1.6□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 YHR210CYHR210C 1026 nt1.59□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.59□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 PHS1YJL097W 654 nt1.59□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 YAR047CYAR047C 321 nt1.59□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 RPL26AYLR344W 384 nt1.59□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.59□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 YCL023CYCL023C 348 nt1.59□□□□□ -2.15
EAF3Q12432 SSQ1YLR369W 1974 nt1.59□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 SNF5YBR289W 2718 nt1.59□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 snR56snR56 88 nt1.58□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.58□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 TIM13YGR181W 318 nt1.58□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.58□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 MCM22YJR135C 720 nt1.58□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 PAU18YLL064C 363 nt1.58□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 HCH1YNL281W 462 nt1.58□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 PAU6YNR076W 363 nt1.58□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 LHS1YKL073W 2646 nt1.58□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 OSH6YKR003W 1347 nt1.58□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 PET309YLR067C 2898 nt1.57□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 PIK1YNL267W 3201 nt1.57□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 MSC6YOR354C 2079 nt1.57□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 TMA7YLR262C-A 195 nt1.57□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 ISF1YMR081C 1017 nt1.57□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.57□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 YOR121CYOR121C 306 nt1.57□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 YPL261CYPL261C 309 nt1.57□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 GUP1YGL084C 1683 nt1.57□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 HER1YOR227W 3741 nt1.56□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 MYO2YOR326W 4725 nt1.56□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 HIT1YJR055W 495 nt1.56□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 ABM1YJR108W 372 nt1.56□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 YML003WYML003W 873 nt1.56□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 YCL046WYCL046W 324 nt1.56□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 YLR419WYLR419W 4308 nt1.56□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 VPS34YLR240W 2628 nt1.56□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 INO80YGL150C 4470 nt1.56□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 PCF11YDR228C 1881 nt1.55□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 PRE4YFR050C 801 nt1.55□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 PXA2YKL188C 2562 nt1.55□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 HCS1YKL017C 2052 nt1.55□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 PEX8YGR077C 1770 nt1.54□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 HDA3YPR179C 1968 nt1.54□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 YGR250CYGR250C 2346 nt1.54□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 ATP6Q0085 780 nt1.54□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.54□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.54□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 AIM9YER080W 1884 nt1.54□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 TDA9YML081W 3756 nt1.54□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 UTP21YLR409C 2820 nt1.53□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 MSH5YDL154W 2706 nt1.53□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 YJR039WYJR039W 3366 nt1.53□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 YKL083WYKL083W 615 nt1.53□□□□□ -2.16
EAF3Q12432 SWI5YDR146C 2130 nt1.52□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 YJR098CYJR098C 1971 nt1.52□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 NOP53YPL146C 1368 nt1.52□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 GIM4YEL003W 336 nt1.52□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.52□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 YBL073WYBL073W 312 nt1.52□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 HHT1YBR010W 411 nt1.52□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 FMP23YBR047W 528 nt1.52□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 YPL229WYPL229W 621 nt1.52□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 ZRG17YNR039C 1818 nt1.52□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 SBE22YHR103W 2559 nt1.52□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 SEC63YOR254C 1992 nt1.51□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 YGR265WYGR265W 411 nt1.51□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.51□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 RPS27AYKL156W 249 nt1.51□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.51□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 YBR012CYBR012C 420 nt1.51□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 TFC8YPL007C 1767 nt1.5□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.5□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.5□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.5□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 YOR029WYOR029W 336 nt1.5□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 MSH6YDR097C 3729 nt1.5□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 FAB1YFR019W 6837 nt1.49□□□□□ -2.17
EAF3Q12432 MDM20YOL076W 2391 nt1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.1 ms