Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 QCR7YDR529C 384 nt1.06□□□□□ -2.24
USB1Q12208 ILM1YJR118C 612 nt1.06□□□□□ -2.24
USB1Q12208 RPL33BYOR234C 324 nt1.06□□□□□ -2.24
USB1Q12208 FMP23YBR047W 528 nt1.06□□□□□ -2.24
USB1Q12208 SHE9YDR393W 1371 nt1.06□□□□□ -2.24
USB1Q12208 MUK1YPL070W 1839 nt1.05□□□□□ -2.24
USB1Q12208 TRM732YMR259C 4263 nt1.05□□□□□ -2.24
USB1Q12208 YBR184WYBR184W 1572 nt1.05□□□□□ -2.24
USB1Q12208 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.05□□□□□ -2.24
USB1Q12208 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.05□□□□□ -2.24
USB1Q12208 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.05□□□□□ -2.24
USB1Q12208 YNR025CYNR025C 360 nt1.05□□□□□ -2.24
USB1Q12208 YOR376WYOR376W 369 nt1.05□□□□□ -2.24
USB1Q12208 SVS1YPL163C 783 nt1.05□□□□□ -2.24
USB1Q12208 YSY6YBR162W-A 198 nt1.05□□□□□ -2.24
USB1Q12208 DGR2YKL121W 2559 nt1.04□□□□□ -2.24
USB1Q12208 NUP120YKL057C 3114 nt1.04□□□□□ -2.24
USB1Q12208 SEF1YBL066C 3447 nt1.04□□□□□ -2.24
USB1Q12208 snR84snR84 550 nt1.04□□□□□ -2.24
USB1Q12208 IES5YER092W 378 nt1.04□□□□□ -2.24
USB1Q12208 PAU18YLL064C 363 nt1.04□□□□□ -2.24
USB1Q12208 YML003WYML003W 873 nt1.04□□□□□ -2.24
USB1Q12208 DDR48YMR173W 1293 nt1.04□□□□□ -2.24
USB1Q12208 PAU6YNR076W 363 nt1.04□□□□□ -2.24
USB1Q12208 HHT1YBR010W 411 nt1.04□□□□□ -2.24
USB1Q12208 OSH6YKR003W 1347 nt1.04□□□□□ -2.24
USB1Q12208 APL1YJR005W 2103 nt1.04□□□□□ -2.24
USB1Q12208 SEC5YDR166C 2916 nt1.04□□□□□ -2.24
USB1Q12208 MSS11YMR164C 2277 nt1.04□□□□□ -2.24
USB1Q12208 IML1YJR138W 4755 nt1.03□□□□□ -2.24
USB1Q12208 SPT7YBR081C 3999 nt1.03□□□□□ -2.24
USB1Q12208 SEC3YER008C 4011 nt1.03□□□□□ -2.24
USB1Q12208 EMC5YIL027C 426 nt1.03□□□□□ -2.24
USB1Q12208 GAL7YBR018C 1101 nt1.03□□□□□ -2.24
USB1Q12208 YPR039WYPR039W 336 nt1.03□□□□□ -2.24
USB1Q12208 YPR063CYPR063C 423 nt1.03□□□□□ -2.24
USB1Q12208 SLM6YBR266C 453 nt1.03□□□□□ -2.24
USB1Q12208 SRP14YDL092W 441 nt1.02□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.02□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YER135CYER135C 393 nt1.02□□□□□ -2.25
USB1Q12208 EMC4YGL231C 573 nt1.02□□□□□ -2.25
USB1Q12208 ABM1YJR108W 372 nt1.02□□□□□ -2.25
USB1Q12208 NOP15YNL110C 663 nt1.02□□□□□ -2.25
USB1Q12208 UFD2YDL190C 2886 nt1.02□□□□□ -2.25
USB1Q12208 MAK10YEL053C 2202 nt1.01□□□□□ -2.25
USB1Q12208 RTT102YGR275W 474 nt1.01□□□□□ -2.25
USB1Q12208 APQ13YJL075C 417 nt1.01□□□□□ -2.25
USB1Q12208 GPI15YNL038W 690 nt1.01□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YDL152WYDL152W 366 nt1□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YDL158CYDL158C 309 nt1□□□□□ -2.25
USB1Q12208 HUR1YGL168W 333 nt1□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YAP3YHL009C 993 nt1□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YNL114CYNL114C 372 nt1□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YOR248WYOR248W 303 nt1□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YPR099CYPR099C 357 nt1□□□□□ -2.25
USB1Q12208 SIP4YJL089W 2490 nt0.99□□□□□ -2.25
USB1Q12208 MSH5YDL154W 2706 nt0.99□□□□□ -2.25
USB1Q12208 TTI1YKL033W 3117 nt0.99□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YDL211CYDL211C 1119 nt0.99□□□□□ -2.25
USB1Q12208 MET32YDR253C 576 nt0.99□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YGR025WYGR025W 303 nt0.99□□□□□ -2.25
USB1Q12208 STE18YJR086W 333 nt0.99□□□□□ -2.25
USB1Q12208 RPS18BYML026C 441 nt0.99□□□□□ -2.25
USB1Q12208 PAN3YKL025C 2040 nt0.99□□□□□ -2.25
USB1Q12208 NUP188YML103C 4968 nt0.98□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YDR509WYDR509W 348 nt0.98□□□□□ -2.25
USB1Q12208 RPL9AYGL147C 576 nt0.98□□□□□ -2.25
USB1Q12208 RPF1YHR088W 888 nt0.98□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YBL073WYBL073W 312 nt0.98□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YPR153WYPR153W 423 nt0.98□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YLL054CYLL054C 2532 nt0.98□□□□□ -2.25
USB1Q12208 NST1YNL091W 3723 nt0.98□□□□□ -2.25
USB1Q12208 SPR3YGR059W 1539 nt0.98□□□□□ -2.25
USB1Q12208 SWI5YDR146C 2130 nt0.97□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.97□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.97□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.97□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YLR269CYLR269C 351 nt0.97□□□□□ -2.25
USB1Q12208 TIM18YOR297C 579 nt0.97□□□□□ -2.25
USB1Q12208 YBR032WYBR032W 303 nt0.97□□□□□ -2.25
USB1Q12208 HDA3YPR179C 1968 nt0.96□□□□□ -2.26
USB1Q12208 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.96□□□□□ -2.26
USB1Q12208 snR14snR14 160 nt0.96□□□□□ -2.26
USB1Q12208 TSC3YBR058C-A 243 nt0.96□□□□□ -2.26
USB1Q12208 RAD50YNL250W 3939 nt0.96□□□□□ -2.26
USB1Q12208 ZRG17YNR039C 1818 nt0.96□□□□□ -2.26
USB1Q12208 PAU2YEL049W 363 nt0.95□□□□□ -2.26
USB1Q12208 YGR265WYGR265W 411 nt0.95□□□□□ -2.26
USB1Q12208 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.95□□□□□ -2.26
USB1Q12208 snR13snR13 124 nt0.95□□□□□ -2.26
USB1Q12208 YBR071WYBR071W 636 nt0.95□□□□□ -2.26
USB1Q12208 CLU1YMR012W 3834 nt0.95□□□□□ -2.26
USB1Q12208 IRR1YIL026C 3453 nt0.94□□□□□ -2.26
USB1Q12208 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.94□□□□□ -2.26
USB1Q12208 YGL217CYGL217C 342 nt0.94□□□□□ -2.26
USB1Q12208 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.94□□□□□ -2.26
USB1Q12208 TMA22YJR014W 597 nt0.94□□□□□ -2.26
USB1Q12208 RPL40BYKR094C 387 nt0.94□□□□□ -2.26
USB1Q12208 CDC33YOL139C 642 nt0.94□□□□□ -2.26
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