Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 DAN4YJR151C 3486 nt4.06□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt4.06□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 YIL174WYIL174W 228 nt4.06□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt4.06□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 RPS12YOR369C 432 nt4.06□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 RPN1YHR027C 2982 nt4.06□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 PEP3YLR148W 2757 nt4.06□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 UBP11YKR098C 2154 nt4.06□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 NIP100YPL174C 2607 nt4.06□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 YTA7YGR270W 4140 nt4.05□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 YBT1YLL048C 4986 nt4.05□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 ATP7YKL016C 525 nt4.05□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 CDC31YOR257W 486 nt4.05□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 MSC6YOR354C 2079 nt4.05□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 SWI6YLR182W 2412 nt4.05□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 POM152YMR129W 4014 nt4.05□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 YBL012CYBL012C 402 nt4.04□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 YPL044CYPL044C 549 nt4.04□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 GIS1YDR096W 2685 nt4.04□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 FAP7YDL166C 594 nt4.03□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 snR45snR45 172 nt4.03□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 RRM3YHR031C 2172 nt4.03□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 MDN1YLR106C 14733 nt4.03□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 ENA2YDR039C 3276 nt4.03□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 ENA1YDR040C 3276 nt4.03□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 YDR239CYDR239C 2364 nt4.02□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt4.02□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 SNF5YBR289W 2718 nt4.02□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 EPL1YFL024C 2499 nt4.02□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 SET1YHR119W 3243 nt4.02□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 APL5YPL195W 2799 nt4.02□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 RPH1YER169W 2391 nt4.01□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 SMY1YKL079W 1971 nt4.01□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 MDV1YJL112W 2145 nt4.01□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 STE6YKL209C 3873 nt4.01□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 PAU3YCR104W 375 nt4□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 SRP14YDL092W 441 nt4□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 RPL42BYHR141C 321 nt4□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 RPS25BYLR333C 327 nt4□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 RGM1YMR182C 636 nt4□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 RPL42AYNL162W 321 nt4□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 YAT2YER024W 2772 nt4□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 RAD5YLR032W 3510 nt4□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 RFX1YLR176C 2436 nt4□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 YJL120WYJL120W 324 nt3.99□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 TAF1YGR274C 3201 nt3.99□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 CHO2YGR157W 2610 nt3.99□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 CSR2YPR030W 3366 nt3.99□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 AIM44YPL158C 2277 nt3.98□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 NOC3YLR002C 1992 nt3.98□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 PKH1YDR490C 2301 nt3.98□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 YNL114CYNL114C 372 nt3.98□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 YCL046WYCL046W 324 nt3.98□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 POL2YNL262W 6669 nt3.98□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 YMR317WYMR317W 3423 nt3.98□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 RPA135YPR010C 3612 nt3.97□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt3.97□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 NOP10YHR072W-A 177 nt3.97□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt3.97□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.97□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 SPA2YLL021W 4401 nt3.97□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 RCY1YJL204C 2523 nt3.96□□□□□ -1.77
NOP53Q12080 CTF4YPR135W 2784 nt3.96□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 SLY1YDR189W 2001 nt3.96□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 YCR043CYCR043C 384 nt3.96□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 snR76snR76 109 nt3.96□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 SPO71YDR104C 3738 nt3.96□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 REC8YPR007C 2043 nt3.95□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 KSP1YHR082C 3090 nt3.95□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 MNE1YOR350C 1992 nt3.95□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 YBR206WYBR206W 324 nt3.95□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 VAS1YGR094W 3315 nt3.95□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 POL3YDL102W 3294 nt3.94□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 SOM1YEL059C-A 225 nt3.94□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 PHD1YKL043W 1101 nt3.94□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 YOR296WYOR296W 3870 nt3.94□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 PBY1YBR094W 2262 nt3.93□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 RPL33AYPL143W 324 nt3.93□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 FLO5YHR211W 3228 nt3.93□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 SNT1YCR033W 3681 nt3.92□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 UBP14YBR058C 2346 nt3.92□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 RPL20AYMR242C 519 nt3.92□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 PSY2YNL201C 2577 nt3.92□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 YPR089WYPR089W 2667 nt3.91□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 HOS4YIL112W 3252 nt3.91□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 RIF1YBR275C 5751 nt3.91□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 SWI5YDR146C 2130 nt3.91□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 YKU80YMR106C 1890 nt3.9□□□□□ -1.78
NOP53Q12080 YDL118WYDL118W 381 nt3.9□□□□□ -1.79
NOP53Q12080 MAK21YDR060W 3078 nt3.9□□□□□ -1.79
NOP53Q12080 UTP14YML093W 2700 nt3.9□□□□□ -1.79
NOP53Q12080 DBP10YDL031W 2988 nt3.9□□□□□ -1.79
NOP53Q12080 YEL025CYEL025C 3567 nt3.89□□□□□ -1.79
NOP53Q12080 HRD3YLR207W 2502 nt3.89□□□□□ -1.79
NOP53Q12080 SMY2YBR172C 2223 nt3.89□□□□□ -1.79
NOP53Q12080 YDL242WYDL242W 354 nt3.89□□□□□ -1.79
NOP53Q12080 ROG1YGL144C 2058 nt3.89□□□□□ -1.79
NOP53Q12080 DNL4YOR005C 2835 nt3.89□□□□□ -1.79
NOP53Q12080 FMP16YDR070C 282 nt3.88□□□□□ -1.79
NOP53Q12080 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.4 ms