Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms