Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFLP07196 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFLP07196 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFLP07196 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFLP07196 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFLP07196 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFLP07196 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFLP07196 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFLP07196 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFLP07196 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFLP07196 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFLP07196 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFLP07196 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFLP07196 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFLP07196 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFLP07196 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFLP07196 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFLP07196 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFLP07196 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFLP07196 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFLP07196 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFLP07196 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFLP07196 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFLP07196 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFLP07196 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFLP07196 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFLP07196 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFLP07196 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFLP07196 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFLP07196 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFLP07196 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFLP07196 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFLP07196 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFLP07196 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFLP07196 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFLP07196 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFLP07196 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFLP07196 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFLP07196 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFLP07196 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEFLP07196 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEFLP07196 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEFLP07196 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEFLP07196 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEFLP07196 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEFLP07196 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEFLP07196 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEFLP07196 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFLP07196 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms