Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C1

ZMYND12, Zinc finger MYND domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND12Q9H0C1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZMYND12Q9H0C1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND12Q9H0C1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms