Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms