Protein–RNA interactions for Protein: Q12234

RUD3, GRIP domain-containing protein RUD3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUD3Q12234 YPR117WYPR117W 7470 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 YGL217CYGL217C 342 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 LIN1YHR156C 1023 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 CRG1YHR209W 876 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 RCN1YKL159C 636 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 YLR217WYLR217W 324 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 YML003WYML003W 873 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 YPL039WYPL039W 951 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 SIP4YJL089W 2490 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 SEF1YBL066C 3447 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 SEC3YER008C 4011 nt1.12□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 YER138W-AYER138W-A 105 nt1.11□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 YNL114CYNL114C 372 nt1.11□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 YBL073WYBL073W 312 nt1.11□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt1.11□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 UBS1YBR165W 834 nt1.11□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.1□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt1.1□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 MAK10YEL053C 2202 nt1.09□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 BEM2YER155C 6504 nt1.09□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 SEC5YDR166C 2916 nt1.09□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 YBR184WYBR184W 1572 nt1.09□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 ROM2YLR371W 4071 nt1.09□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 RAD50YNL250W 3939 nt1.09□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 SWI4YER111C 3282 nt1.09□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 RTR1YER139C 681 nt1.09□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 SMD3YLR147C 306 nt1.09□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 RPL37AYLR185W 267 nt1.09□□□□□ -2.23
RUD3Q12234 SLX4YLR135W 2247 nt1.09□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 EAF1YDR359C 2949 nt1.08□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 RSM27YGR215W 333 nt1.08□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt1.08□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 ATP20YPR020W 348 nt1.08□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 YCL046WYCL046W 324 nt1.08□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 YNL150WYNL150W 408 nt1.07□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 STB6YKL072W 2301 nt1.07□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 MSS11YMR164C 2277 nt1.06□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 YFR057WYFR057W 456 nt1.06□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 RRI2YOL117W 1938 nt1.05□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 DOP1YDR141C 5097 nt1.05□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 CDC39YCR093W 6327 nt1.05□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 CHZ1YER030W 462 nt1.05□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 CWC23YGL128C 852 nt1.05□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 DDR48YMR173W 1293 nt1.05□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 SGO1YOR073W 1773 nt1.05□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 CLU1YMR012W 3834 nt1.05□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 VPS54YDR027C 2670 nt1.04□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 SCC2YDR180W 4482 nt1.04□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 YER121WYER121W 345 nt1.04□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 RPL42BYHR141C 321 nt1.04□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 PAU18YLL064C 363 nt1.04□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 RPS18BYML026C 441 nt1.04□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 RPL42AYNL162W 321 nt1.04□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 PAU6YNR076W 363 nt1.04□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 YPR170CYPR170C 336 nt1.04□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 TTI1YKL033W 3117 nt1.04□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 YLL054CYLL054C 2532 nt1.04□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 KAP120YPL125W 3099 nt1.03□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 IFH1YLR223C 3258 nt1.03□□□□□ -2.24
RUD3Q12234 VPS52YDR484W 1926 nt1.03□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 PAU2YEL049W 363 nt1.02□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 TAD1YGL243W 1203 nt1.02□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 RTT102YGR275W 474 nt1.02□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 YIR020CYIR020C 303 nt1.02□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 RPL9BYNL067W 576 nt1.02□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 KAR1YNL188W 1302 nt1.02□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 ZRG17YNR039C 1818 nt1.02□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 APL3YBL037W 3078 nt1.01□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 MRPL32YCR003W 552 nt1.01□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 YHR054CYHR054C 1065 nt1.01□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 SPC2YML055W 537 nt1.01□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 snR14snR14 160 nt1.01□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 HCH1YNL281W 462 nt1□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 PIP2YOR363C 2991 nt1□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 SPT21YMR179W 2277 nt1□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 NUT1YGL151W 3399 nt0.99□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 SMC1YFL008W 3678 nt0.99□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.99□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 MRPS8YMR158W 468 nt0.99□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 ERP4YOR016C 624 nt0.99□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 GDS1YOR355W 1569 nt0.99□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.98□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.98□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.98□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.98□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.98□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.98□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 YCL020WYCL020W 1317 nt0.98□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 SMB1YER029C 591 nt0.98□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.98□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.98□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 YPR147CYPR147C 915 nt0.98□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 HDA3YPR179C 1968 nt0.97□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 snR79snR79 84 nt0.97□□□□□ -2.25
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