Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 SGO1YOR073W 1773 nt2.34□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 PDR3YBL005W 2931 nt2.34□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 TMN3YER113C 2121 nt2.34□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YER121WYER121W 345 nt2.34□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 ACB1YGR037C 264 nt2.34□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.34□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 RPL32YBL092W 393 nt2.34□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 OSH6YKR003W 1347 nt2.34□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 YEL043WYEL043W 2871 nt2.34□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 SGS1YMR190C 4344 nt2.33□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 SNU114YKL173W 3027 nt2.33□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 MLH1YMR167W 2310 nt2.33□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 YRB1YDR002W 606 nt2.33□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.33□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 TAR1YLR154W-C 375 nt2.33□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 VPS41YDR080W 2979 nt2.33□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 PAC1YOR269W 1485 nt2.33□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 MZM1YDR493W 372 nt2.32□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.32□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 AYR1YIL124W 894 nt2.32□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 RAM2YKL019W 951 nt2.32□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 YBR197CYBR197C 654 nt2.32□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 SLN1YIL147C 3663 nt2.32□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 VPS16YPL045W 2397 nt2.31□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 GIS1YDR096W 2685 nt2.31□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 CBF2YGR140W 2871 nt2.31□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 MRP10YDL045W-A 288 nt2.31□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 QCR7YDR529C 384 nt2.31□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 KTI11YBL071W-A 249 nt2.31□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 REV1YOR346W 2958 nt2.31□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 TOR1YJR066W 7413 nt2.31□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 YJL070CYJL070C 2667 nt2.3□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 YFH1YDL120W 525 nt2.3□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 TIM9YEL020W-A 264 nt2.3□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.3□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 YGR069WYGR069W 336 nt2.3□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 YNL337WYNL337W 255 nt2.3□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 YPL182CYPL182C 384 nt2.3□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 YPR099CYPR099C 357 nt2.3□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 AIM9YER080W 1884 nt2.3□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 YDR048CYDR048C 315 nt2.29□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 YGL149WYGL149W 306 nt2.29□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 YGL239CYGL239C 315 nt2.29□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 IPT1YDR072C 1584 nt2.28□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 SCD5YOR329C 2619 nt2.28□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 LYS9YNR050C 1341 nt2.28□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.28□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 TIM13YGR181W 318 nt2.28□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 LCL2YLR104W 396 nt2.28□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 LSM7YNL147W 348 nt2.28□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 RTC6YPL183W-A 282 nt2.28□□□□□ -2.04
UBX3Q12229 IRA2YOL081W 9240 nt2.27□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 BUB1YGR188C 3066 nt2.27□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YDL062WYDL062W 426 nt2.27□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YGL041CYGL041C 204 nt2.27□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.27□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 PHS1YJL097W 654 nt2.27□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 HSK3YKL138C-A 210 nt2.27□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 PAU8YAL068C 363 nt2.27□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 PAU20YOL161C 363 nt2.27□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.27□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 KAR3YPR141C 2190 nt2.27□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 DNF1YER166W 4716 nt2.26□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 CSF1YLR087C 8877 nt2.26□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 SCP160YJL080C 3669 nt2.26□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 SPF1YEL031W 3648 nt2.25□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 VTC3YPL019C 2508 nt2.25□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 RRP12YPL012W 3687 nt2.25□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 DBP6YNR038W 1890 nt2.25□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 HTL1YCR020W-B 237 nt2.25□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YNL198CYNL198C 303 nt2.25□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.25□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YEF3YLR249W 3135 nt2.25□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 CLN3YAL040C 1743 nt2.25□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 MPH1YIR002C 2982 nt2.25□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 TFC3YAL001C 3483 nt2.24□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 ALG13YGL047W 609 nt2.24□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YGR265WYGR265W 411 nt2.24□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 HTB2YBL002W 396 nt2.24□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YBR277CYBR277C 402 nt2.24□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YDR344CYDR344C 444 nt2.23□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.23□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YGL024WYGL024W 336 nt2.23□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YHL041WYHL041W 450 nt2.23□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 BLI1YKL061W 342 nt2.23□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.23□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 RPS17AYML024W 411 nt2.23□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 DIS3YOL021C 3006 nt2.23□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YPP1YGR198W 2454 nt2.22□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.22□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.22□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.22□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 GRX8YLR364W 330 nt2.22□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.22□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YNL010WYNL010W 726 nt2.22□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 SAR1YPL218W 573 nt2.22□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 NUP120YKL057C 3114 nt2.22□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 RAD61YDR014W 1944 nt2.22□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 YPR097WYPR097W 3222 nt2.22□□□□□ -2.05
UBX3Q12229 APL5YPL195W 2799 nt2.21□□□□□ -2.05
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